| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,063,248 | T→C | 5.4% | intergenic (+62/‑145) | PP_1838 → / → PP_1839 | membrane protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,063,248 | 0 | T | C | 5.4% | 254.0 / 2.9 | 93 | intergenic (+62/‑145) | PP_1838/PP_1839 | membrane protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/41); new base C (2/3); total (48/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.55e-01 | |||||||||||
TCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCA > NC_002947/2063101‑2063392 | tCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCg > 1:1393982/1‑150 (MQ=255) aagaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑a < 1:387473/150‑1 (MQ=255) tGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTtgtg < 1:1503954/150‑1 (MQ=255) ggAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGc > 1:1349889/1‑150 (MQ=255) aaGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCACGCCCCCAGAGGCCTTGCAC‑GGGCTCGGCAGCTTGTGCAg > 2:1277292/1‑150 (MQ=255) aGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCTGCTCCCACAGGCATTGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCaat < 1:1852968/150‑3 (MQ=38) cGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGACCACGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTc < 1:1322240/150‑1 (MQ=255) gTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTcc > 1:547265/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGc < 1:1447071/150‑1 (MQ=255) aGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACACACGCTGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAg > 1:18755/1‑150 (MQ=21) gACGAAGATCCTGCTGGATAACACCGCCGGGGTGATGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTACGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCACAGGACCTGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCGGGCaa < 2:283229/150‑1 (MQ=14) ccAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGTACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGc > 2:1619620/1‑150 (MQ=255) agagCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCcg > 2:707844/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCaa > 1:1856215/1‑141 (MQ=255) ccTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCaa < 2:1856215/141‑1 (MQ=255) tgctgGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATg > 1:385670/1‑150 (MQ=255) tgctgGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATg < 1:1501838/150‑1 (MQ=255) tgctgGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCGGGTCGGCACTCAGAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑AACTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATg > 2:557918/1‑150 (MQ=255) gctgGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAAGGTCCGA‑Acc < 2:469969/111‑1 (MQ=255) cgatctcacCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGcc < 1:1384679/144‑1 (MQ=255) aaCACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGCGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGcgccgc > 1:1734571/1‑150 (MQ=255) acCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTATGGGAGCGGGGAAGCCCGCGAAGGGGcccagatcg > 2:1384679/1‑144 (MQ=38) ccgccgGCGTGCGACACGGCACACCGAAGTAAACCGGCGCCGCTTTGCGCCCCATTCGCGGGCTTCCCCGCGCCCACGGCCATTGCACGGGGTTCGG‑CCTTTGGGCGGGTCCTGTGCGAGCGGGCTAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACaa < 1:557918/150‑1 (MQ=255) cgccgGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAAt < 1:1760161/150‑1 (MQ=255) gccgGGGTGGGACACGGCACACCGAAGTAAGCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCGACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGGGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATTGGCCCCGCACAAtt < 2:1734571/150‑1 (MQ=38) tgCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACt > 1:531917/1‑150 (MQ=255) tgCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACt < 1:1202254/150‑1 (MQ=255) tgCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACt < 2:385670/150‑1 (MQ=255) aCGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGaa < 2:547265/150‑1 (MQ=255) cGGTACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGCCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAAc < 1:1619620/150‑1 (MQ=255) ggCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCTGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACa > 2:1603515/1‑150 (MQ=255) cGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCCAGGCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATccc > 1:701722/1‑150 (MQ=255) gAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTCTcccc < 2:1349889/150‑1 (MQ=255) aaGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGa < 1:673750/134‑1 (MQ=255) aaGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGa > 2:673750/1‑134 (MQ=255) gTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGcc > 2:1655783/1‑150 (MQ=255) aaCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAAt > 1:663874/1‑106 (MQ=255) aaCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAAt < 2:663874/106‑1 (MQ=255) aaCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCa > 1:273859/1‑150 (MQ=255) cGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAgg > 2:371517/1‑150 (MQ=255) gCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACAtt < 1:1061566/131‑1 (MQ=255) gCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACAtt > 2:1061566/1‑131 (MQ=255) cgcgTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGAATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGtt > 1:1848920/1‑150 (MQ=255) gcgTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTa > 1:132081/1‑150 (MQ=255) gTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAATCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTAtt < 2:1393982/150‑1 (MQ=255) gTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTAtt < 2:1848920/150‑1 (MQ=255) tGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGCCCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCa < 1:1577418/150‑1 (MQ=255) gCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAg < 1:707844/150‑1 (MQ=255) gCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCa > 1:464801/1‑150 (MQ=255) cccATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCAt > 1:194211/1‑150 (MQ=255) ccATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATc < 2:132081/150‑1 (MQ=255) cgtccgcgGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTGCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCCAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATca < 1:773386/146‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATcac > 2:1895486/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATcac > 2:1690259/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCACGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATcac > 2:1098526/1‑150 (MQ=255) 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cccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCACGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTc < 1:1690259/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGGCAGTTATTCAGGCATCACCCACTTGGTGTTc > 1:1430175/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACGTTTTGCAGGTCCTGTGCGAGCTGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg < 1:1277292/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg > 2:1533708/1‑56 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg < 1:1533708/56‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCacacac > 2:980323/1‑140 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCacacac < 1:980323/140‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 1:1300107/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 1:312783/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGtt < 2:531917/150‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGtt > 1:1842211/1‑150 (MQ=255) ccACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCCAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGtt > 2:869417/1‑146 (MQ=255) ccACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAg < 1:1048212/110‑1 (MQ=255) ccACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAg > 2:1048212/1‑110 (MQ=255) ccACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGtt < 1:869417/146‑1 (MQ=255) acaGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTga > 1:752618/1‑150 (MQ=255) caGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTg < 2:1067043/134‑1 (MQ=255) caGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTg > 1:1067043/1‑134 (MQ=255) gCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTccc > 1:1585108/1‑78 (MQ=255) gCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTccc < 2:1585108/78‑1 (MQ=255) ttGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTc > 2:737100/1‑150 (MQ=255) tGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTACCGGACTGAACATGATCCCCGACCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTcc > 2:852360/1‑150 (MQ=38) gCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTgag > 2:1420137/1‑142 (MQ=255) gCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTgag < 1:1420137/142‑1 (MQ=255) cacaGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGgtgt > 2:476778/1‑129 (MQ=255) cacaGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGgtgt < 1:476778/129‑1 (MQ=255) acaGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGtt > 2:175481/1‑150 (MQ=255) acaGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGAATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGtt < 1:1424852/150‑1 (MQ=255) caGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTc > 2:1138096/1‑150 (MQ=255) aGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATc < 2:1758597/84‑1 (MQ=255) aGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATc > 1:1758597/1‑84 (MQ=255) aGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCa > 1:380515/1‑150 (MQ=255) | TCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACTGAGAGGGTCCGTTCA > NC_002947/2063101‑2063392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |