| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,154,102 | T→A | 6.5% | intergenic (+112/+98) | PP_1908 → / ← PP_1909 | putative Peptidase/septum formation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,154,102 | 0 | T | A | 6.5% | 279.1 / 9.9 | 93 | intergenic (+112/+98) | PP_1908/PP_1909 | putative Peptidase/septum formation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/47); new base A (3/3); total (43/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.19e-01 | |||||||||||
CGATGTGGATGGGGTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATCCACCAGCCGAATCAGC > NC_002947/2153953‑2154251 | cGATGTGGATGGGGTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGtt < 2:1783957/150‑1 (MQ=255) gtgGATGGGGTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTCGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTAcc > 1:121564/1‑150 (MQ=255) tgGATGGGGTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTAccc > 1:1196647/1‑150 (MQ=255) gATGGGGTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTAAACCcgc > 2:309978/1‑150 (MQ=255) tGGGGTTCCAGGGGCCGCAGTTGCTTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTAAACCcgcgc < 1:687856/150‑2 (MQ=255) tGGGGTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTAAACCcgcgc < 1:309978/150‑2 (MQ=255) ggggTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:554086/150‑1 (MQ=255) ggTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGCCGGCATCATGAAACAG‑‑GGCGCAGCGATCAGGGTGACCAGAGGAATGTCGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATa > 1:1006673/1‑150 (MQ=255) ggTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCCCGAATa < 2:1393403/150‑1 (MQ=255) gTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTAAACCcgcgcc > 1:1625992/1‑145 (MQ=255) gTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTAAACCcgcgcc < 2:1625992/147‑3 (MQ=255) tCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGc < 2:121564/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGc < 1:264934/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTACGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGc < 2:1196647/150‑1 (MQ=255) ccAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGcc < 2:122235/150‑1 (MQ=255) ggggCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGa > 1:1936456/1‑150 (MQ=255) ccGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACctg < 2:1772640/150‑1 (MQ=255) gTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCa > 2:775676/1‑150 (MQ=255) gtcgCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATc < 1:1310737/150‑1 (MQ=255) ttCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCAcc > 2:619948/1‑150 (MQ=255) ttCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCACAACGGGATGTTGTAGGCGCGGGTTAACCAGAGAAGAGGCCGGACGTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCAcc > 1:1884954/1‑150 (MQ=255) tCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCAccc > 1:288582/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACctg > 2:373217/1‑120 (MQ=255) tgtgGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACctg < 1:373217/120‑1 (MQ=255) gtggtgCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGa > 1:220397/1‑136 (MQ=255) gtggtgCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGa < 2:220397/136‑1 (MQ=255) tggtgCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCg < 2:201282/150‑1 (MQ=255) tggtgCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCg < 2:331077/150‑1 (MQ=255) gtgCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCggg > 1:1673813/1‑150 (MQ=255) gtgCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCggg > 1:162591/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGggcggc < 2:1913780/150‑1 (MQ=255) tGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGcc > 1:1459380/1‑104 (MQ=255) tGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGcc < 2:1459380/104‑1 (MQ=255) gCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCt > 2:411972/1‑150 (MQ=255) gCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCt > 2:1536556/1‑150 (MQ=255) 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cccgcGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGgcgc > 1:497962/1‑150 (MQ=255) ccgcGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGcc > 1:1865551/1‑150 (MQ=255) ccgcGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGcc < 2:162591/150‑1 (MQ=255) cgcgcgGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCgg > 1:1118879/1‑144 (MQ=255) cgcgcgGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCgg < 2:1118879/144‑1 (MQ=255) cgcgcgGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGccc < 2:78624/150‑1 (MQ=255) gcgcgGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGcccc < 1:321142/150‑1 (MQ=255) gctcATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATc < 2:769903/147‑1 (MQ=255) gcATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATccc > 1:1176538/1‑150 (MQ=255) gcATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATccc < 2:1872433/150‑1 (MQ=255) 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gTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCccttcct < 2:1936456/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGt > 1:1019151/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGt > 2:655692/1‑150 (MQ=255) aGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCTGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCa < 2:809814/150‑1 (MQ=255) cGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGc < 2:1006673/150‑1 (MQ=255) 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gTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCat > 2:861799/1‑150 (MQ=255) tgttgtAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATc < 2:630910/150‑1 (MQ=255) ttgtAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAAc < 2:1414037/121‑1 (MQ=255) ttgtAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAAc > 1:1414037/1‑121 (MQ=255) tgtAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATccac < 2:497962/150‑1 (MQ=255) ctattcgcgGGTAAACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATccacc > 1:1484495/6‑150 (MQ=255) tAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGTAGCCCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCGGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATccacca > 1:1400716/1‑150 (MQ=255) ggCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATCCACCAGc < 2:1882279/150‑1 (MQ=255) gcgcGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGGTCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATCCACCAGcc < 1:619948/150‑1 (MQ=255) gcgGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATCCACCAGCCGa > 1:865570/1‑150 (MQ=255) gTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATCCACCAGCCGAATCa < 1:861799/150‑1 (MQ=255) ttACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATCCACCAGCCGAATCatc < 1:376240/150‑3 (MQ=255) | CGATGTGGATGGGGTTCCAGGGGCCGCAGTTGCGTTGAGTTCGTCGCAGTTCTTGTGGTGCCTGGCAGATCAAGCGCCGCCCGCGCGGC‑‑GCATCGCGCGCGGGCTCGCTCATCGATCAGGGTGCCCAGCGGTATGTTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCTGTCCAGCATCCCTGATCGTTCACCCTCCCGGGCGGCGCTCGATCTGCCGGGCGCCCCAAATCCCCAGCCAGGTTACGGAACCATCACCCCTTCCTTGGTCAGCATATCCACCAGCCGAATCAGC > NC_002947/2153953‑2154251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |