| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,388,379 | C→G | 9.0% | intergenic (+73/+71) | pyrD → / ← rmf | dihydroorotate dehydrogenase/ribosome modulation factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,388,379 | 0 | C | G | 9.0% | 271.3 / 15.5 | 89 | intergenic (+73/+71) | pyrD/rmf | dihydroorotate dehydrogenase/ribosome modulation factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/40); new base G (5/3); total (46/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.35e-01 | |||||||||||
ACTCGGGCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCAGTTATCACCGC > NC_002947/2388233‑2388523 | aCTCGGGCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAg < 1:123448/150‑1 (MQ=255)aCTCGGGCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAg < 1:1378806/150‑1 (MQ=255) cTCGGGCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTGAAga < 1:357651/150‑2 (MQ=255) tCGGGCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAggg > 1:703785/1‑150 (MQ=255) gggCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGc > 2:1628370/1‑150 (MQ=255) cTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGcccc > 1:1809162/1‑150 (MQ=255) ttCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCACTGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCt > 2:1246783/1‑150 (MQ=255) caccTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGCAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTgg < 2:339982/147‑1 (MQ=255) tACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAAGGGGCCCCTTGAAGGGGccctttttta > 2:1471880/1‑143 (MQ=255) tACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCt > 2:998676/1‑150 (MQ=255) tACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCt > 2:223500/1‑150 (MQ=255) aCAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCtt > 1:288584/1‑150 (MQ=255) aGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTGAAGGGGccctttt > 1:1137362/1‑137 (MQ=255) aGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTGAAGGGGccctttt < 2:1137362/141‑5 (MQ=255) gCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTcgcccgc < 1:998676/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCccgccg > 2:1882783/1‑150 (MQ=255) cgcTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGccc < 1:1420616/150‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGt > 1:1437436/1‑150 (MQ=255) gTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTGAAGGGGccctttt > 1:1186074/1‑112 (MQ=255) gTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTGAAGGGGccctttt < 2:1186074/116‑5 (MQ=255) tGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTCGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGGCCATGGt > 2:669225/1‑150 (MQ=255) aTGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTaaa < 2:703785/150‑1 (MQ=255) tgatATTGCGGCAAAGCCGCGGTGAGCAGCCCGCCCCGGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAAt > 2:1529337/4‑150 (MQ=255) tGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATgggg < 1:1598099/136‑1 (MQ=255) tGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATgggg > 2:1598099/1‑136 (MQ=255) tGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAAt > 1:1735282/1‑150 (MQ=255) tGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAAt < 2:1749277/150‑1 (MQ=255) caccgcgGCATTGCCGCGATGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGGGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGACGTCTCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGGAAAGCGa > 1:1372322/4‑150 (MQ=255) aTCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGaa < 2:1735282/150‑1 (MQ=255) aTCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGaa < 2:885084/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAAt > 1:497699/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAAt < 1:1426290/150‑1 (MQ=255) cgcgGCATTGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAAtt > 1:591431/1‑150 (MQ=255) gcgGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTc > 1:582245/1‑150 (MQ=255) cgGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCa > 2:33064/1‑150 (MQ=255) gCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAgt < 1:967123/150‑1 (MQ=255) aaTGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAgtgt > 2:121108/1‑150 (MQ=255) aTGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTc < 1:1246783/150‑1 (MQ=255) gcccgcccCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGt > 2:1778641/1‑111 (MQ=255) gcccgcccCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGt < 1:1778641/111‑1 (MQ=255) cccgcccCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGCAGAGCAGAAGAGAGTGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACgg > 2:646455/1‑150 (MQ=255) ccgcccCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGc > 1:60726/1‑150 (MQ=255) cccTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGaa > 1:143019/1‑120 (MQ=255) cccTGGGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGaa < 2:143019/120‑1 (MQ=255) tgtgGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGAttt > 1:937779/1‑150 (MQ=255) tgtgGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGAttt < 2:1831650/150‑1 (MQ=255) tgGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTc < 1:121108/150‑1 (MQ=255) gggggggCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCg < 1:1628370/150‑1 (MQ=255) aggggCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGAATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGtt < 1:101112/149‑1 (MQ=255) gCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGt < 1:496411/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGt > 2:496411/1‑150 (MQ=255) gCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGt < 1:1882783/150‑1 (MQ=255) ggtgggtgCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTa > 2:1710413/1‑150 (MQ=255) gtgggtgCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTAt < 1:33064/150‑1 (MQ=255) gtgCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGAt < 2:1661805/150‑1 (MQ=255) tgCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATg < 2:1809162/150‑1 (MQ=255) tgCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATg > 1:1430332/1‑150 (MQ=255) aGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCa > 1:1493800/1‑150 (MQ=255) tgatgaGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCg < 1:223500/150‑1 (MQ=255) atgaGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCATGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGt > 2:609471/1‑150 (MQ=255) ggTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGaa < 1:1843334/87‑1 (MQ=255) ggTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGaa > 2:1843334/1‑87 (MQ=255) gTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTc > 2:691787/1‑98 (MQ=255) gTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTc < 1:691787/98‑1 (MQ=255) gTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAg < 2:582245/150‑1 (MQ=255) gTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAg < 2:497699/150‑1 (MQ=255) tttGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGt < 2:1437436/150‑1 (MQ=255) tGCCAAGGCATAAAAAA‑GGTCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCa < 2:1272836/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGaa < 2:1854755/82‑1 (MQ=255) gCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGaa > 1:1854755/1‑82 (MQ=255) aaGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTcc > 2:1845167/1‑150 (MQ=255) cATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTcc < 2:1430332/150‑1 (MQ=255) aTAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAACTCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTTTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTccc < 1:646455/150‑1 (MQ=255) aTAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGc > 2:552108/1‑100 (MQ=255) aTAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGc < 1:552108/100‑1 (MQ=255) aTAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCgg > 1:1318412/1‑132 (MQ=255) aTAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCgg < 2:1318412/132‑1 (MQ=255) tAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTAt < 1:267208/119‑1 (MQ=255) tAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTAt > 2:267208/1‑119 (MQ=255) tAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCa < 2:591431/150‑1 (MQ=255) tAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCa < 2:1493800/150‑1 (MQ=255) aaaa‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCAGtt > 2:488425/1‑150 (MQ=255) aaaa‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCAGtt > 2:679537/1‑150 (MQ=255) aggggCCCCTTGAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCAGTTAt > 2:454401/3‑150 (MQ=255) gggCCCCTTGAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCAGTTATCa > 2:234098/1‑150 (MQ=255) ccccTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCAGTTATCACcg > 1:579658/1‑150 (MQ=255) cccTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCAGTTATCACcgc > 2:1586958/1‑150 (MQ=255) ccTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACg < 1:820610/85‑1 (MQ=255) ccTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACg > 2:820610/1‑85 (MQ=255) | ACTCGGGCTTCATCTACAAAGGGCCGGCGCTGATTCGCGAAGCGGTGGATGCTATCGCGGCAATGCCGCGGTGACCAGCCCGCCCCTGTGGGGGGGCGGGTGGGTGCAGCTGATGAGGTTTGCCAAGGCATAAAAAA‑GGGCCCCTTCAAGGGGCCCCTGGGCCTTCGCCCGCCGCCCGGATGGGGCGTGCATGGTAAATCGAATTCAGTGTCCTCGTTCAGCCAACGGCGTGATTTTCGTTGAGTCTATGGATGCCAGCGGTGCCAGTCATTCCGTCCCAGTTATCACCGC > NC_002947/2388233‑2388523 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |