| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,488,222 | T→C | 5.1% | intergenic (+35/‑367) | PP_2182 → / → PP_2183 | hypothetical protein/formate dehydrogenase subunit gamma |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,488,222 | 0 | T | C | 5.1% | 231.9 / 2.0 | 79 | intergenic (+35/‑367) | PP_2182/PP_2183 | hypothetical protein/formate dehydrogenase subunit gamma |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/43); new base C (2/2); total (34/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.83e-01 | |||||||||||
CAGGCTGCGCGGCAACGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAGATGATGCCGGGGCGTAATCACGTGCGTCGG > NC_002947/2488077‑2488370 | cagGCTGCGCGGCAACGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCa < 1:905834/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGCGGCAACGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGc > 1:1131764/1‑150 (MQ=255) gcgGCAACGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGACGGCa < 2:957047/142‑1 (MQ=255) gcgGCAACGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGACGGCa > 1:957047/1‑142 (MQ=255) cgGCAACGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGc < 1:1331932/150‑1 (MQ=255) ggCAACGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGcc > 1:254185/1‑150 (MQ=255) cAACGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCgg < 2:888367/150‑1 (MQ=255) cAACGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCgg < 2:1131764/150‑1 (MQ=255) aCGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCgggg < 1:493622/150‑1 (MQ=255) aCGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCgggg < 2:254185/150‑1 (MQ=255) gCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCa < 1:397885/139‑1 (MQ=255) gCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCa > 2:397885/1‑139 (MQ=255) gCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGcc > 1:670606/1‑150 (MQ=255) ccAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑g > 1:206443/1‑150 (MQ=255) gACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTg > 1:1261964/1‑150 (MQ=255) aCCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTgg < 1:1538116/150‑1 (MQ=255) aCCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTgg < 2:1603938/150‑1 (MQ=255) aCGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAgg < 2:1202303/150‑1 (MQ=255) tCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAg < 1:1583003/116‑1 (MQ=255) tCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAg > 2:1583003/1‑116 (MQ=255) ggCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGCCTGGTTTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCACATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAAt < 1:155072/149‑1 (MQ=255) gCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATg < 2:1602978/150‑1 (MQ=255) gCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATg < 2:1626221/150‑1 (MQ=255) cGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACAACGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATgg < 1:579122/150‑1 (MQ=255) gttgTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGa > 2:1449701/4‑150 (MQ=255) aaGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGAc < 2:1003644/150‑1 (MQ=255) aaGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGAc < 2:670606/150‑1 (MQ=255) aGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGTCCATTGCCGGGCCTGCCAGAC‑GGCAGCCCCGGCAATGGGCt < 2:706653/150‑1 (MQ=37) aGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCa > 1:322406/1‑112 (MQ=255) aGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCa < 2:322406/112‑1 (MQ=255) aGTCAAACGCCAAGACCCAGACTCCGGCCCCCG‑CGCCTTCCCCCCAAACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGCCTGCC‑AGACGGCAGCCCCGGCAATGGGCt < 2:123277/150‑1 (MQ=21) cAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGc < 1:359775/130‑1 (MQ=255) cAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGc > 2:359775/1‑130 (MQ=255) aaaGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGt > 1:1424274/1‑150 (MQ=255) aaaGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGt > 2:1732953/1‑150 (MQ=255) gcccaggcTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCga < 2:869129/150‑1 (MQ=255) gcccaggcTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCga < 1:1732953/150‑1 (MQ=255) gcTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCa > 2:1580908/1‑114 (MQ=255) gcTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCa < 1:1580908/114‑1 (MQ=255) cTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTg > 1:1657402/1‑150 (MQ=255) tCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTgg > 1:1703252/1‑150 (MQ=255) tCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGCTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTgg < 1:1650991/150‑1 (MQ=255) ccgccgACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACg < 1:1347979/150‑1 (MQ=255) gccgACACCTC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGCATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGTTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGAt < 2:533509/150‑1 (MQ=255) gccgACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGAt < 1:1599061/150‑1 (MQ=255) gccgACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGAt < 2:795283/150‑1 (MQ=255) ccgACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGATGCCCAGTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATg < 1:724608/150‑1 (MQ=255) gACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGt > 2:751176/1‑150 (MQ=255) gC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGACGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGttt > 2:905102/1‑117 (MQ=255) gC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGACGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGttt < 1:905102/117‑1 (MQ=255) aaCGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGAc < 1:759356/150‑1 (MQ=255) gTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCAc < 1:317940/150‑1 (MQ=255) cAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGtgcat < 2:1852931/124‑1 (MQ=255) cAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGtgcat > 1:1852931/1‑124 (MQ=255) gTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGAt > 1:691999/1‑150 (MQ=255) tCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGCCCCGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATc > 1:1087799/1‑150 (MQ=255) tACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCgg > 1:62109/1‑150 (MQ=255) acgcGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGATATGCTGGCTGCATGCTGGTTGCCGGGTCGGCC‑TTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCgg < 2:1390462/147‑1 (MQ=255) ccGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGGGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCa > 2:1398943/1‑150 (MQ=255) tGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGCCTGCCAGAC‑GGCAGCCCCGGCAATgggct > 1:869535/1‑82 (MQ=17) tGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGCCTGCCAGAC‑GGCAGCCCCGGCAATGGGCt < 2:869535/85‑1 (MQ=17) gAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGt < 2:1720607/150‑1 (MQ=255) gCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCCAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTgg < 1:751176/150‑1 (MQ=255) cTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCAGTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCGGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGc > 1:1699545/1‑150 (MQ=255) cAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAg < 2:1261964/150‑1 (MQ=255) tCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCCTTGCAGCGACAGCC‑GTCGGGTAGGCCCGGCAATGGTCGGGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGCTCGGCAAGCCGTGGCAgatg > 1:1208215/1‑150 (MQ=255) tCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAgatg > 2:829540/1‑150 (MQ=255) tCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGGTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAgatg > 1:1273212/1‑150 (MQ=255) gcgTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCAtt > 2:1933772/1‑38 (MQ=255) gcgTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCAtt < 1:1933772/38‑1 (MQ=255) gcgTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAgatgat > 2:1434837/1‑150 (MQ=255) tGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAGATGATGCCggg < 2:206443/150‑1 (MQ=255) ccGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCCGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAGATGATGCCGGGGCGt > 1:1867108/1‑150 (MQ=255) ccATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAGATGATGCCGGGGCGTAATCAc > 1:854267/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGGCCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAGATGATGCCGGGGCGTAATCACGt < 1:1791648/150‑1 (MQ=255) tGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAGATGATGCCGGGGCGTAATCACGTg > 2:1777343/1‑150 (MQ=255) cTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGc < 1:421090/112‑1 (MQ=255) cTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGc > 2:421090/1‑112 (MQ=255) aTGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAGATGATGCCGGGGCGTAATCACGTGCGTCgg < 2:691999/150‑1 (MQ=255) | CAGGCTGCGCGGCAACGCAGCCAGGACCGACGCAATCGTGCGAAGTCAAAGGCCCAGGCCCAGGCTCCGGCCCCCGCCGCCGACACCGC‑AACGGTGCAGTCTACCGACTGAGCTCAGTCGCGTTCTGCCCCGTAGCCATGCTGGATGGCAGCCCATTGCCGGGGCTGCC‑GTCTGGCAGGCCCGGCAATGGACTAGGTTCGGTTTCGAGAGCCTGGTGCATGCAACGATGGTTTCAAGACCCACCTGATCGGCAAGCCGTGGCAGATGATGCCGGGGCGTAATCACGTGCGTCGG > NC_002947/2488077‑2488370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |