Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,509,064 | A→G | 5.9% | C32R (TGC→CGC) | PP_2203 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,509,064 | 0 | A | G | 5.9% | 197.6 / 2.5 | 68 | C32R (TGC→CGC) | PP_2203 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/36); new base G (2/2); total (30/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.79e-01 |
CGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACGCAGGCGGATACCGGCGACCAGGCGGGTCTGGC > NC_002947/2508920‑2509212 | cgccgATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTgg < 2:1612269/150‑1 (MQ=255) gccgATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACTGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTggg < 2:1888105/150‑1 (MQ=255) ccgATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTgggg < 2:269447/150‑1 (MQ=255) tCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGATAGGGGCGTTGACGGTAACACAACACATTATTGA‑GCGGCTGGTTGAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTcgc > 1:434905/1‑150 (MQ=255) ccccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGt < 2:1421490/150‑1 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTTTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCGGTTGGGGTCGCGGTa > 2:1919328/1‑150 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTa > 1:1404353/1‑150 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTa > 2:1710067/1‑150 (MQ=255) cccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTCTCACTCACCTGGTTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTa < 1:37659/150‑1 (MQ=255) ccGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTTTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCGGTTGGGGTCGCGGTAg < 1:1919328/150‑1 (MQ=255) gCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGAt > 1:1227622/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTcggc > 2:1657538/1‑150 (MQ=255) aGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCG‑TTGTCACGGAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGGAGCAGCCGCAGTCAGGGTCGAACTCAACGTCGATGGTCTcggcg > 1:1069185/1‑150 (MQ=255) aCGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAgg > 2:882583/1‑150 (MQ=255) cGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGc < 2:1540436/150‑1 (MQ=255) gAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGt < 2:1758538/150‑1 (MQ=255) gAGGCGGTGCTGGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCCGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGt < 2:198489/150‑1 (MQ=255) tttGCTTGTCGGCGCGCGTGTTTGGCTCGTCGTTGTCGTTGACGGTAAAACCT‑TTGTCACGCAGGTGGCTGCCCCAGGGCGTGGAGCAGCCGCACTTGGGGTCGCGGTAGACGTCTATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACgg < 2:410728/149‑1 (MQ=255) gACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGt > 1:1184642/1‑107 (MQ=255) gACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGt < 2:1184642/107‑1 (MQ=255) aCGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAgg < 1:993507/150‑1 (MQ=255) gcgcTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTc > 2:740204/1‑150 (MQ=255) cTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAgg < 1:740204/150‑1 (MQ=255) cATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGt < 1:1277694/150‑1 (MQ=255) tGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTcagcag < 2:1227622/150‑1 (MQ=255) gCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGgt > 1:644888/1‑150 (MQ=255) tCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGgtgt > 1:457423/1‑150 (MQ=255) gACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGttt > 1:733349/1‑150 (MQ=255) gTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTggg < 2:1822270/63‑1 (MQ=255) gTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTggg > 1:1822270/1‑63 (MQ=255) gTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGt > 1:1603528/1‑108 (MQ=255) gTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGt < 2:1603528/108‑1 (MQ=255) gACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGt < 2:1263856/150‑1 (MQ=255) gACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGt > 2:753231/1‑150 (MQ=255) ggTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATg > 1:1776230/1‑145 (MQ=255) ggTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATg < 2:1776230/145‑1 (MQ=255) ggTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGaa < 2:188652/150‑1 (MQ=255) ggTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGaa < 2:1706460/150‑1 (MQ=255) ggTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGaa < 2:457423/150‑1 (MQ=255) gTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAg < 2:434905/150‑1 (MQ=255) tAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAg < 1:400276/118‑1 (MQ=255) tAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAg > 2:400276/1‑118 (MQ=255) aaaCCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTcagcag < 2:638397/125‑1 (MQ=255) aaaCCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTcagcag > 1:638397/1‑125 (MQ=255) aaCCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTGTCGGTGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCGCAGGGTCAGCGGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACt > 1:619258/1‑150 (MQ=255) aaCCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACt > 2:1121176/1‑150 (MQ=255) aCCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGTCCGGTGACGGGCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTc < 2:1726029/150‑1 (MQ=255) aCCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTc < 1:1092963/150‑1 (MQ=255) ccA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTcc < 2:644888/150‑1 (MQ=255) cA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGTCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCt < 2:1404353/150‑1 (MQ=255) gTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTaa < 2:1069185/150‑1 (MQ=255) tCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGGCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTaaa > 2:1289782/1‑150 (MQ=255) cACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTaaaa < 2:482103/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGgt > 1:921712/1‑114 (MQ=255) gCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGgt < 2:921712/114‑1 (MQ=255) gCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATg > 2:1551461/1‑128 (MQ=255) gCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATg < 1:1551461/128‑1 (MQ=255) gCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGaa > 1:895574/1‑133 (MQ=255) gCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGaa < 2:895574/133‑1 (MQ=255) gCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACg > 2:183978/1‑150 (MQ=255) gTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACGCAgg < 1:1121176/150‑1 (MQ=255) aGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACGCAGGCGGATACCGGc > 1:955009/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGCAGCAGCCGCGGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCa > 2:445583/1‑62 (MQ=255) ggCCTTGCAGCAGCCGCGGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCa < 1:445583/62‑1 (MQ=255) gcCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACGCa > 1:531135/1‑124 (MQ=255) gcCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACGCa < 2:531135/124‑1 (MQ=255) gCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACGCAGGCGGATACCGGCGACCAGGCGGGTCTgg > 1:482101/1‑150 (MQ=255) cAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACGCAGGCGGATACCGGCGACCAGGCGGGTCTGGc < 1:1348884/150‑1 (MQ=255) | CGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCA‑TTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACGCAGGCGGATACCGGCGACCAGGCGGGTCTGGC > NC_002947/2508920‑2509212 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |