Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,517,056 | A→T | 5.8% | N125I (AAT→ATT) | PP_2210 → | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,517,056 | 0 | A | T | 5.8% | 220.4 / 2.6 | 69 | N125I (AAT→ATT) | PP_2210 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/34); new base T (2/2); total (33/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
CGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTGGGGCACGCCTGGGCCA > NC_002947/2516907‑2517202 | cGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCaa > 2:497218/1‑150 (MQ=255) cGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCaa < 2:1095872/150‑1 (MQ=255) cGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGACGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCaa > 1:1084882/1‑150 (MQ=255) gaagaaGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAAt < 1:1334059/150‑1 (MQ=255) agtgcAGACCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCa < 2:10711/147‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCaa < 2:935712/143‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCaa > 1:935712/1‑143 (MQ=255) gcAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGAGCATTGCCCAggc < 1:1766876/150‑2 (MQ=255) cAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGAGCATTGCCCAggcg > 2:588812/1‑148 (MQ=255) gCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGAcc > 2:1684175/1‑150 (MQ=255) gCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGAGCATTGCCCAggcgcaa < 1:588812/150‑6 (MQ=255) cTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGgct < 1:1366801/150‑1 (MQ=255) gAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGgctgcg > 2:386795/1‑150 (MQ=255) gAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGgctgcg > 2:386419/1‑150 (MQ=255) gCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGgctgcgctg < 1:755755/150‑1 (MQ=255) cAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAg > 1:886479/1‑130 (MQ=255) cAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAg < 2:886479/130‑1 (MQ=255) ccAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGa > 1:767667/1‑150 (MQ=255) aGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGCCCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGc > 2:1900049/1‑150 (MQ=255) gCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAGCTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGc < 2:1225816/150‑1 (MQ=255) cTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGcc > 2:1913392/1‑150 (MQ=255) tGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCg > 1:1707774/1‑150 (MQ=255) cgcCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCg < 2:658688/150‑1 (MQ=255) gcCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCgg < 2:767667/150‑1 (MQ=255) aGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGa < 1:321007/150‑1 (MQ=255) aGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGa < 1:386419/150‑1 (MQ=255) aGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGa < 1:386795/150‑1 (MQ=255) ccgccgACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGaaa > 2:1016259/1‑150 (MQ=255) ccgccgACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGaaa > 1:1116701/1‑150 (MQ=255) gccgACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATc > 1:1942156/1‑150 (MQ=255) cgACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGa < 2:1857904/150‑1 (MQ=255) gACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGTGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGc < 1:1796187/118‑1 (MQ=255) gACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGTGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGc > 2:1796187/1‑118 (MQ=255) aCGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGc < 2:1707774/150‑1 (MQ=255) cccGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCcgcg < 1:1900049/150‑1 (MQ=255) ccGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCgcgc > 2:1757179/1‑150 (MQ=255) ccGAATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGAATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCgcgc > 1:1136182/1‑150 (MQ=255) cGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGAAAACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCa > 2:551220/1‑150 (MQ=255) tCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAggg < 2:911166/150‑1 (MQ=255) cGGGTAAAGCAGATGCTGGTGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTCGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAgggg > 2:1392285/1‑150 (MQ=255) ggTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTAACCGTCACCTTGCGCTTTGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCt < 1:1684175/150‑1 (MQ=255) tCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGcc > 2:326184/1‑136 (MQ=255) tCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGcc < 1:326184/136‑1 (MQ=255) tCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGc > 1:1647808/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAAt > 2:350270/1‑150 (MQ=255) cgcTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATctct < 1:497218/150‑1 (MQ=255) ctgctgCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCtgt < 2:1647808/150‑1 (MQ=255) ctgctgCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCtgt < 1:350270/150‑1 (MQ=255) ctgctgCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCtgt < 1:1786273/150‑1 (MQ=255) gcGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTc < 2:1116701/150‑1 (MQ=255) gCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCCGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCt < 2:1399421/150‑1 (MQ=255) tACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCtgtgt > 2:894254/1‑150 (MQ=255) gtgtCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGACACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGt < 2:940869/150‑1 (MQ=255) tCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTAc > 2:936870/1‑150 (MQ=255) tCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTAc < 1:894254/150‑1 (MQ=255) aCCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATc > 1:777813/1‑109 (MQ=255) aCCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATc < 2:777813/109‑1 (MQ=255) gTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCtgtgt < 1:1774037/135‑1 (MQ=255) gTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCtgtgt > 2:1774037/1‑135 (MQ=255) gTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTg < 2:1942156/150‑1 (MQ=255) tCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGAc < 1:743460/62‑1 (MQ=255) tCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGAc > 2:743460/1‑62 (MQ=255) aaCTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCtgt < 1:1302890/117‑1 (MQ=255) aaCTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCtgt > 2:1302890/1‑117 (MQ=255) aCTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTGgcgc < 1:1127698/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTGGGGCAc > 1:1203390/1‑150 (MQ=255) ggtctccTGAGCATTGCCCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTGGGGCAc > 2:1035117/6‑150 (MQ=255) cTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTGGGGCACGCCTgg < 1:395158/150‑1 (MQ=255) cTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTGGGGCACGCCTgg > 1:546807/1‑150 (MQ=255) cTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTGGGGCACGCCTgg > 2:1617763/1‑150 (MQ=255) tGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTGGGGCACGCCTggg > 2:778017/1‑150 (MQ=255) gCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTGGGGCACGCCTGGGTCa > 1:1520468/1‑150 (MQ=255) cAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCgcgc > 1:1937064/1‑112 (MQ=255) cAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCgcgc < 2:1937064/112‑1 (MQ=255) | CGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATGCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCTGCAAAATCTCTGTGAGTCGCGCCTGTGTGCGCTGTTACCGGTGGGGCACGCCTGGGCCA > NC_002947/2516907‑2517202 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |