Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,560,505 | T→A | 8.6% | W142R (TGG→AGG) ‡ | PP_2243 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,560,505 | 0 | T | A | 8.6% | 242.9 / 12.8 | 81 | W142R (TGG→AGG) ‡ | PP_2243 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/37); new base A (3/4); total (40/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.14e-01 |
CGATTGCGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGA > NC_002947/2560357‑2560649 | cGATTGCGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCctg > 1:1697678/1‑150 (MQ=255) cGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCtggctggc < 2:1452971/150‑1 (MQ=255) cGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCtggctggc > 1:1384659/1‑150 (MQ=255) cGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGACGAGAAAGCGCATGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCtggctggc < 2:1022279/150‑1 (MQ=255) aCCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTggcgg < 1:1740404/150‑1 (MQ=255) ttGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCt > 2:1708526/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCt < 1:473726/150‑1 (MQ=255) ttGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCt < 2:730780/150‑1 (MQ=255) gCGTTGGCAAGGTGTGTCGTCGAAGCAACTACACACCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGa < 1:1659276/150‑1 (MQ=255) ttGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAg > 2:548051/1‑150 (MQ=255) ttGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtggcgctg < 1:1335644/150‑8 (MQ=255) cAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtggcgct > 1:412486/1‑139 (MQ=255) cAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtggcgct < 2:412486/145‑7 (MQ=255) cAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTAAGGCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCg > 1:994551/1‑150 (MQ=255) aaGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCgg < 1:532488/150‑1 (MQ=255) aGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCgg > 2:1189206/1‑149 (MQ=255) aGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCgg < 1:1189206/149‑1 (MQ=255) ggTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTGTCGA‑AGGCCgcca < 1:936528/150‑4 (MQ=255) tgtCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCggg < 1:737336/145‑1 (MQ=255) tgtCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCggg > 2:737336/1‑145 (MQ=255) aGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCgg > 2:557948/1‑150 (MQ=255) gCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCAAGGCCGCCAGCCAGGCGGcc > 1:218304/1‑121 (MQ=255) gCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCAAGGCCGCCAGCCAGGCGGcc < 2:218304/121‑1 (MQ=255) aCTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGActgg > 1:1144537/1‑139 (MQ=255) aCTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGActgg < 2:1144537/139‑1 (MQ=255) cTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGacc < 2:1697678/150‑1 (MQ=255) cAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGacccac > 1:1281940/1‑150 (MQ=255) aaGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGacccacc > 1:446715/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCg > 1:346352/1‑150 (MQ=255) gAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATg < 1:282245/150‑1 (MQ=255) gAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATg > 2:516805/1‑150 (MQ=255) aGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATgg < 2:1426021/150‑1 (MQ=255) cAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTc < 1:557948/150‑1 (MQ=255) aCCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCAt < 2:446715/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTggcgg > 1:1723268/1‑100 (MQ=255) ccGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTggcgg < 2:1723268/100‑1 (MQ=255) gTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCAt > 1:1540860/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGAATGGCCGCAGCAACGCGCCACCGCCGTGTATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATg < 2:1384659/150‑1 (MQ=255) tGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGc < 2:1281940/150‑1 (MQ=255) ccGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGTGTGTTTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTgg > 2:942839/1‑150 (MQ=255) cGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGt > 1:1540403/1‑150 (MQ=255) cGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCAT‑TCGAGAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGt > 1:195341/1‑150 (MQ=255) aaTGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTAc < 2:346352/150‑1 (MQ=255) tGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTa < 1:1014962/143‑1 (MQ=255) tGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTa > 2:1014962/1‑143 (MQ=255) aGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCg < 1:799747/104‑1 (MQ=255) aGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCg > 2:799747/1‑104 (MQ=255) aTCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGgt < 2:1929527/150‑1 (MQ=255) aTCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGgt < 1:516805/150‑1 (MQ=255) aTCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGgt > 2:1908158/1‑150 (MQ=255) tCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGgtg > 2:1746378/1‑150 (MQ=255) cGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGc < 2:1540860/150‑1 (MQ=255) cATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGc > 2:272403/1‑115 (MQ=255) cATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGc < 1:272403/115‑1 (MQ=255) ggtggtGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTAAAGGCCCTGGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAg < 1:1322692/150‑1 (MQ=255) gAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTgg > 1:1627015/1‑122 (MQ=255) gAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTgg < 2:1627015/122‑1 (MQ=255) tCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGAc > 1:310129/1‑150 (MQ=255) gTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCg < 1:746077/70‑1 (MQ=255) gTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCg > 2:746077/1‑70 (MQ=255) gTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGt > 1:473686/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATgcgc > 1:1457601/1‑93 (MQ=255) ttCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATgcgc < 2:1457601/93‑1 (MQ=255) cTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGtgctgc > 2:1157817/1‑150 (MQ=255) tGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGa < 1:62392/141‑1 (MQ=255) tGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGa > 2:62392/1‑141 (MQ=255) cgcTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGc < 2:473686/150‑1 (MQ=255) gcTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCt > 2:546291/1‑150 (MQ=255) tATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGgt > 1:1638638/1‑108 (MQ=255) tATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGgt < 2:1638638/108‑1 (MQ=255) tATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGAGGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGt > 1:1634871/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCa < 1:548051/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGt > 2:1888989/1‑136 (MQ=255) gCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGt < 1:1888989/136‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATgg < 2:364427/70‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATgg > 1:364427/1‑70 (MQ=255) cAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCaa > 2:620468/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGCCAGCCAGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCaa > 2:213634/2‑150 (MQ=255) ggCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAAtt < 1:1708526/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAAtt < 2:1904510/150‑1 (MQ=255) gccgccTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTg > 1:296596/1‑150 (MQ=255) ccgccTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGc > 2:280779/1‑114 (MQ=255) ccgccTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGc < 1:280779/114‑1 (MQ=255) ccgccTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTgg > 1:1091321/1‑149 (MQ=255) ccgccTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATCCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGa < 1:620468/150‑1 (MQ=255) | CGATTGCGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCT‑TCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGA > NC_002947/2560357‑2560649 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |