| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,635,624 | C→T | 5.8% | L331L (CTG→CTA) ‡ | PP_2305 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,635,624 | 0 | C | T | 5.8% | 198.4 / 2.4 | 69 | L331L (CTG→CTA) ‡ | PP_2305 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/35); new base T (2/2); total (32/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCATGACCTCGAAGCTCTGGTTGATCAAATCCA > NC_002947/2635482‑2635772 | ccTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGa < 1:1676421/150‑1 (MQ=255)ccTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGa > 2:522484/1‑150 (MQ=255) tCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATg < 2:1692/150‑1 (MQ=255) cTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTCACGAAAAAGCAAAACTCAACTATCCGCCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAACTCCGgc > 1:228184/1‑150 (MQ=255) tCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCtt > 1:1815570/1‑150 (MQ=255) tCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCCCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCACCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCtt < 1:724314/150‑1 (MQ=255) ttttCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTa < 2:1095577/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGaa < 1:1811303/150‑1 (MQ=255) ccAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCTGGGGCGagagat < 2:245474/130‑6 (MQ=255) ccAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCTGGGGCGagagat > 1:245474/1‑125 (MQ=255) cAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGt > 2:1376660/1‑142 (MQ=255) cAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGt < 1:1376660/142‑1 (MQ=255) ccGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑aaa < 2:1815570/150‑1 (MQ=255) cgcgAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑aaaa < 1:1865294/150‑1 (MQ=255) gTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCacac > 1:246637/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTTCACAGTGCCTTCAGGTGTGGCGCTAACCAGGTGCTAACGCTTAACCCCTTCATTACTATGCAGCGTATCGCGTAAAATCTC‑TCGCCGCAGAGCTATGAGTTCCGGCGCCTTATAGAACTAG‑AAAAACCGACACACCCGCATg > 2:127344/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTg > 1:1662163/1‑150 (MQ=255) cGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTgg < 1:1490459/150‑1 (MQ=255) aaGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGt > 2:791463/1‑150 (MQ=255) tCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCtt < 1:796231/142‑1 (MQ=255) tCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCtt > 2:796231/1‑142 (MQ=255) aGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGAt > 1:1154913/1‑150 (MQ=255) aGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGAt < 2:378733/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCGAAAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGAt < 2:222694/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTAAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATc > 1:1155625/1‑150 (MQ=255) tGCTTTCAGGGGTGGCGCAAACCAGGTGCCACGGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGCATCGCGTCCAATCTC‑CCGCCCCAGCGAGATGAGCTCCGGCGCCGTGTAGAAATCA‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCa < 2:246637/150‑1 (MQ=255) ccTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGa < 2:1375756/91‑1 (MQ=255) ccTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGa > 1:1375756/1‑91 (MQ=255) gcgtTAACCAGATGCTACCGCTTCACCCCTTCATCACTAACGAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGa < 1:510075/150‑1 (MQ=255) cgcTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGAt > 1:293303/1‑150 (MQ=255) gcTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATa > 2:146678/1‑150 (MQ=255) tAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGc < 2:556914/150‑1 (MQ=255) cTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGaa < 1:273599/84‑1 (MQ=255) cTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGaa < 1:272998/84‑1 (MQ=255) cTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGaa > 2:272998/1‑84 (MQ=255) cTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGaa > 2:273599/1‑84 (MQ=255) tACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCATCGCCCTGGGGCGaga > 2:985181/1‑62 (MQ=37) tACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCATCGCCCTGGGGCGaga < 1:985181/64‑3 (MQ=37) tACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTg < 2:1662163/150‑1 (MQ=255) aCCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCgg > 2:350382/1‑95 (MQ=255) aCCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCgg < 1:350382/95‑1 (MQ=255) aCCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGcc < 1:1541006/139‑1 (MQ=255) aCCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGcc > 2:1541006/1‑139 (MQ=255) aCCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCAGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGt > 1:668258/1‑150 (MQ=255) cGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTa < 1:1794522/149‑1 (MQ=255) cGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTa > 2:1794522/1‑149 (MQ=255) cACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGc < 1:1382251/150‑1 (MQ=255) cccTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCaa < 1:376418/150‑1 (MQ=255) cccTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCaa > 1:517768/1‑150 (MQ=255) cTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCT‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACg > 1:749469/1‑150 (MQ=255) tCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGaa < 1:522484/150‑1 (MQ=255) tAACTGTCCAGCGTAGCGCGTGCAAGCTC‑TCCCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCA‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTc < 2:228184/150‑1 (MQ=255) aaCTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATTAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCt > 2:702491/1‑150 (MQ=255) aaCTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCtt > 2:1521919/1‑130 (MQ=255) aaCTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCtt < 1:1521919/130‑1 (MQ=255) aaCTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTACCAACGAAGTCt < 2:1154913/150‑1 (MQ=255) cTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGc > 2:888223/1‑150 (MQ=255) tGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCa < 1:1701824/150‑1 (MQ=255) tGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCa < 1:1701682/150‑1 (MQ=255) gCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCAt < 1:67962/145‑1 (MQ=255) gCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCAt > 2:67962/1‑145 (MQ=255) gTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCATGACCTCGAAGctct < 1:888223/150‑1 (MQ=255) tGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCATGACCTCGAAGCTCTg > 2:865372/1‑150 (MQ=255) tGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCATGACCTCGAAGCTCTg > 2:223224/1‑150 (MQ=255) gCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGt > 2:1500786/1‑93 (MQ=255) gCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGt < 1:1500786/93‑1 (MQ=255) aaTCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGACGTCTGCATGACCTCGAGGCACTGAtt > 2:898964/1‑150 (MQ=255) tctc‑tcGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCT‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCATGACCTCGAAGCTCTGGTTGa < 2:749469/150‑1 (MQ=255) tc‑tcGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCATGACCTCGAAGCTCTGGTTGATc < 2:1628447/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGt > 1:1593657/1‑115 (MQ=255) ccAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGt < 2:1593657/115‑1 (MQ=255) ccAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCATGACCTCGAAGCTCTGGTTGATCAAATCca < 1:865372/150‑1 (MQ=255) | CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTC‑TCGCCCCAGGGCGATGAGCTCCGGCGCCTTGTAGAACTCG‑AAAAACCGGCACACCCGCTTGGGTACGTTGATCAGCACATCCGGTGGATAGCCGGCAATCTTGTACTGTGCCAACGAAGTCTGCATGACCTCGAAGCTCTGGTTGATCAAATCCA > NC_002947/2635482‑2635772 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |