| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 11,648 | G→C | 5.1% | M182I (ATG→ATC) | dnaN → | DNA polymerase III subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 11,648 | 0 | G | C | 5.1% | 245.7 / 4.1 | 78 | M182I (ATG→ATC) | dnaN | DNA polymerase III subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/38); new base C (2/2); total (38/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.91e-01 | |||||||||||
AAGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCA > NC_002947/11502‑11796 | aaGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAgc > 1:163586/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGcc > 2:705653/1‑150 (MQ=255) gccgccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGa > 2:724685/1‑150 (MQ=255) gccgccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGa < 2:1939803/150‑1 (MQ=255) cgccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATc > 1:123718/1‑150 (MQ=255) cgccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATc < 2:1856878/150‑1 (MQ=255) ccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGa > 1:478437/1‑150 (MQ=255) tGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGc < 1:1419608/150‑1 (MQ=255) tGATCAAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGc < 1:357498/150‑1 (MQ=255) aGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCaggagg < 1:705653/150‑1 (MQ=255) gCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAggagga > 2:1139739/1‑150 (MQ=255) gCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAggagga < 2:123718/150‑1 (MQ=255) gAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATTTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACCCGATATGCGCTGTATCCCAACG‑CCGCCACGTCCCGGCGGTGTGGTCTATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATc < 1:822306/150‑1 (MQ=255) gAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATc > 1:710254/1‑150 (MQ=255) gAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATc > 2:493471/1‑150 (MQ=255) aaCCAGCTTCGCCATTGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCg > 1:548538/1‑150 (MQ=255) cAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCa < 2:1723649/138‑1 (MQ=255) cAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCa > 1:1723649/1‑138 (MQ=255) cAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGaca > 2:469496/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCa > 1:1586686/1‑150 (MQ=255) ttCGCCATTGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAg < 2:548538/150‑1 (MQ=255) ttCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAg > 2:1733662/1‑150 (MQ=255) gCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTc < 2:464562/150‑1 (MQ=255) ccATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCa > 1:892728/1‑150 (MQ=255) ccAGAAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGTTCATCTTGcg < 2:1682486/150‑2 (MQ=255) cagcagGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCcg > 2:742296/1‑150 (MQ=255) aTGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTTCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAg < 1:493471/150‑1 (MQ=255) aTGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAg < 2:488131/150‑1 (MQ=255) cgcTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATc < 2:1710964/150‑1 (MQ=255) cTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCagga < 2:1231490/111‑1 (MQ=255) cTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCagga > 1:1231490/1‑111 (MQ=255) cTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCt > 1:1511244/1‑150 (MQ=255) cTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCt < 1:1733662/150‑1 (MQ=255) ttACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGa < 1:469496/150‑1 (MQ=255) ccTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGtt > 1:1580481/1‑150 (MQ=255) cGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATc > 2:525206/1‑136 (MQ=255) cGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATc < 1:525206/136‑1 (MQ=255) tGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTTACCGa < 2:1350394/150‑1 (MQ=255) tttCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGgc > 1:1563975/1‑130 (MQ=255) tttCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGgc < 2:1563975/130‑1 (MQ=255) ttCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGGGCGCCTGCTGACCGATCCTGa > 2:997932/1‑150 (MQ=255) tCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCTCGTAAATGTAGCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGaa < 2:710254/150‑1 (MQ=255) ccGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATcc < 1:1616469/144‑1 (MQ=255) ccGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATcc > 2:1616469/1‑144 (MQ=255) ccGCAACACGTTGCGAGCTGTAT‑CCACCGATGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAgg < 2:1082211/150‑1 (MQ=255) gCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCt < 1:697187/143‑1 (MQ=255) gCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCt > 2:697187/1‑143 (MQ=255) acGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTc > 2:1776351/1‑150 (MQ=255) gcgcTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGcc < 1:1194330/117‑1 (MQ=255) gcgcTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGcc > 2:1194330/1‑117 (MQ=255) gcgcTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATCGgcgcgc < 2:12958/51‑1 (MQ=255) gcgcTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATCGgcgcgc > 1:12958/1‑51 (MQ=255) gcTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTg > 1:573199/1‑150 (MQ=255) tAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTgg < 2:163586/150‑1 (MQ=255) caaCGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCa > 1:560674/3‑150 (MQ=255) cGACGGTCACCGCATGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCa > 2:427996/1‑150 (MQ=255) aCGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATc < 1:1776351/150‑1 (MQ=255) aCGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCAATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATc < 2:1580481/150‑1 (MQ=255) aCCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGTCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCgcg < 2:602858/131‑3 (MQ=255) aCCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGTCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCgcg > 1:602858/1‑129 (MQ=255) ctccTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCcgc < 1:1643817/148‑1 (MQ=255) ccTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCgcgc < 2:1511244/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCACGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTTGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGCTCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCgcgc < 1:742296/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCAt > 1:823484/1‑137 (MQ=255) tGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCAt < 2:823484/137‑1 (MQ=255) gcTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAg < 1:882957/65‑1 (MQ=255) gcTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAg > 2:882957/1‑65 (MQ=255) tcctGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCa > 2:594079/4‑112 (MQ=38) tcctGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCa < 1:594079/109‑1 (MQ=38) ttGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTgg > 1:133880/1‑150 (MQ=255) tCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATg < 2:503892/102‑1 (MQ=255) tCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATg > 1:503892/1‑102 (MQ=255) gATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGCGGCTCGCCCCCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGtt < 2:892728/150‑1 (MQ=255) gATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctgc > 1:853048/1‑80 (MQ=255) gATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctgc < 2:853048/80‑1 (MQ=255) gATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCa > 2:282320/1‑137 (MQ=255) gATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCa < 1:282320/137‑1 (MQ=255) tGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCa > 1:905431/1‑150 (MQ=255) | AAGCTGCGCCGCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAACGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTAT‑CCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCA > NC_002947/11502‑11796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |