| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,708,586 | C→T | 6.1% | P222P (CCG→CCA) | cysI ← | sulfite reductase hemoprotein subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,708,586 | 0 | C | T | 6.1% | 242.3 / 3.4 | 81 | P222P (CCG→CCA) | cysI | sulfite reductase hemoprotein subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/38); new base T (3/2); total (41/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
CATTTCGGCCTCGACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATGGCGGCGCGGTCTTCCTGCGA > NC_002947/2708439‑2708735 | cATTTCGGCCTCGACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTGCTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACgg < 1:548806/150‑1 (MQ=255)cATTTCGGCCTCGACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACgg > 1:249114/1‑150 (MQ=255) tttCGGCCTCGACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTTTTGGCGTCCGTAACGTTTGTACACGCCCAGGATGTCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCGCGTCa > 2:1521385/1‑150 (MQ=255) tttCGGCCTCGACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCa < 1:1782831/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTCGACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAgg < 2:1436246/150‑1 (MQ=255) cTCGACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTc > 2:1942459/1‑150 (MQ=255) tCGACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGACCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCg > 2:151754/1‑150 (MQ=255) cGACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCCAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGt < 1:1571854/150‑1 (MQ=255) gACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGtt < 2:1230044/150‑1 (MQ=255) gACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGtt < 2:41475/150‑1 (MQ=255) gACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGtt > 1:1630196/1‑150 (MQ=255) gAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCGTGGCAGGacctgat > 1:956854/1‑131 (MQ=255) gAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCGTGGCAGGacctgat < 2:956854/137‑7 (MQ=255) acacTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCcca < 2:1630196/150‑1 (MQ=255) ttCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGTTCCTGCCGTGGCAGGacc > 2:1357018/1‑125 (MQ=255) ttCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGTTCCTGCCGTGGCAGGacc < 1:1357018/127‑3 (MQ=255) ttCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCcaccac > 2:1566621/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCcaccac > 1:1044921/1‑150 (MQ=255) ccGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCg < 2:249114/150‑1 (MQ=255) ccTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGTGTCCACCACCGGGTTACGGCGCa < 2:1044921/150‑1 (MQ=255) ccTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGACCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCa < 1:151754/150‑1 (MQ=255) cTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGGAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAg > 2:1397356/1‑150 (MQ=255) cTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAg > 1:1397445/1‑150 (MQ=255) ccAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAAATCGTTCATGAACTAACCCACCGCCGGGGTACGGCCCAGGccac > 1:1580441/1‑150 (MQ=255) cAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACg > 2:42672/1‑98 (MQ=255) cAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACg < 1:42672/98‑1 (MQ=255) cAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGccacc > 1:1911999/1‑150 (MQ=255) cAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGccacc < 2:1397445/150‑1 (MQ=255) cAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGccacc > 1:1508737/1‑150 (MQ=255) aGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAg > 1:99643/1‑120 (MQ=255) aGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAg < 2:99643/120‑1 (MQ=255) aGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGccacca < 2:883348/150‑1 (MQ=255) aGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCATACCATCAGGGGCGCTGTTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGccacca > 2:1020922/1‑150 (MQ=255) ggATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGccacca > 2:160646/1‑149 (MQ=255) ggATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGccacca < 1:160646/149‑1 (MQ=255) ttGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTAcc < 2:1656912/150‑1 (MQ=255) tGATCCGCGCCTTGTACTTTTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCa < 1:595710/150‑1 (MQ=255) gATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCa < 2:1395307/92‑1 (MQ=255) gATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCa > 1:1395307/1‑92 (MQ=255) cgcgCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGcaca < 2:1593939/150‑1 (MQ=255) ttgttgTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCCGGTCGCGACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGt < 1:1020922/150‑1 (MQ=255) tCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCg > 2:1010656/1‑150 (MQ=255) aCCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGtt < 2:1911999/150‑1 (MQ=255) cGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGcc < 2:385667/130‑1 (MQ=255) cGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGcc > 1:385667/1‑130 (MQ=255) aCGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCCGCGTTGCGCAc > 2:816885/1‑150 (MQ=255) gTTGTACACGCGCAGGATGGGGCCTGGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCgg < 2:1415146/150‑1 (MQ=255) gTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCgg > 1:1725798/1‑150 (MQ=255) cacGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAg > 2:235564/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGcc > 2:1369955/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCAACTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGcc > 2:337667/1‑150 (MQ=255) aGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTc > 2:849489/1‑116 (MQ=255) aGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTc < 1:849489/116‑1 (MQ=255) gATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTc > 2:926226/1‑150 (MQ=255) gATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCACCGCGGCAATCTGCATGGGCGAACAATCCCGGGTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGGCAAtttt > 1:716907/1‑147 (MQ=255) gCTGTTCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATggc < 1:1942459/150‑1 (MQ=255) tGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTgc < 2:620395/111‑1 (MQ=255) tGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTgc > 1:620395/1‑111 (MQ=255) aTCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCcaccac < 2:1550914/70‑1 (MQ=255) aTCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCcaccac > 1:1550914/1‑70 (MQ=255) aTCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATGgcggcg > 1:207074/1‑150 (MQ=255) tCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCg > 1:695038/1‑114 (MQ=255) tCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCg < 2:695038/114‑1 (MQ=255) tCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAg < 1:569506/121‑1 (MQ=255) tCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAg > 2:569506/1‑121 (MQ=255) gTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTgcg < 2:1186273/105‑1 (MQ=255) gTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTgcg > 1:1186273/1‑105 (MQ=255) gTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCaa < 2:1274273/116‑1 (MQ=255) gTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCaa > 1:1274273/1‑116 (MQ=255) cTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAg < 2:1130006/54‑1 (MQ=255) cTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAg > 1:1130006/1‑54 (MQ=255) cTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCgg < 2:756300/92‑1 (MQ=255) cTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCgg > 1:756300/1‑92 (MQ=255) cTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATGGCGGCGCGGTCTTc < 1:1566621/150‑1 (MQ=255) atGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATGGCGGCGCGGTCTTc > 2:1326448/2‑150 (MQ=255) ccACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATGGCGGCGCGGTCTTc < 1:1413789/147‑1 (MQ=255) ccACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATGGCGGCGCGGTCTTc > 2:1413789/1‑147 (MQ=255) ccACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATGGCGGCGCGGTCTTCCTg < 1:1010656/150‑1 (MQ=255) cACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCAACCCCGCGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATGGCGGCGCGGTCTTCCTGc < 1:1397356/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGAt < 1:148788/130‑1 (MQ=255) aCGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGAt > 2:148788/1‑130 (MQ=255) cGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATGGCGGCGCGGTCTTCCTGCGa < 2:1725798/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTCCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTCCGATGGCGGCGCGGTCTTCCTGCGa < 1:1521385/150‑1 (MQ=255) | CATTTCGGCCTCGACCTTTTCGGCGAACACTTCCGGGGTAAGGGCCTTGACCAGGATCTTGATCCGCGCCTTGTACTTGTTGTCACGGCGACCGTAACGGTTGTACACGCGCAGGATGGCGTCGAGGTAGCTGATCAGGTCCTGCCACGGCAGGAACTCGTTGATGAACGAGCCCACCACCGGGGTACGGCCCAGGCCACCACCTACCAGCACACGGAAGCCCAGTTCGCCGGCAGCGTTGCGCACCGGCTCAAGGCCAATGTCGTGCACTTCGATGGCGGCGCGGTCTTCCTGCGA > NC_002947/2708439‑2708735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |