| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,158,350 | C→G | 8.6% | P109R (CCT→CGT) | opuA → | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,158,350 | 0 | C | G | 8.6% | 218.7 / 11.4 | 70 | P109R (CCT→CGT) | opuA | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/29); new base G (3/3); total (38/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.23e-01 | |||||||||||
TCGCGGTGCGGCGTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGCGGCACT > NC_002947/3158203‑3158494 | tCGCGGTGCGGCGTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTa < 2:1779716/150‑1 (MQ=255) gcgGTGCGGCGTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACg < 2:862394/150‑1 (MQ=255) gcgTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGC‑TGGCGCAGCGTAGGCTgcgtcaa > 2:61035/1‑146 (MQ=255) cgTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGC‑TGGCGCAGCGTAGGCTgcgtcaag < 1:61035/150‑6 (MQ=255) gTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGc > 1:1376009/1‑150 (MQ=255) gTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCg > 2:5936/1‑150 (MQ=255) tgctttgcttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGc > 1:689424/1‑150 (MQ=255) gctttgcttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTGGA‑GCAGCGTAGGCTgcgtcaagc < 1:812204/140‑7 (MQ=255) gctttgcttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTGGA‑GCAGCGTAGGCTgcgtcaagc > 2:812204/1‑134 (MQ=255) ctttgcttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAg > 2:1837090/1‑150 (MQ=255) tttgcttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGt < 1:1051736/144‑1 (MQ=255) tttgcttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGt > 2:1051736/1‑144 (MQ=255) tttgcttGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAgc < 2:1376009/150‑1 (MQ=255) aTGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGGCACGTCAACCGGTGGATAGAGCCGAGCAGCGGCAAGTGGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGc < 1:129060/150‑1 (MQ=255) gTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATgg > 1:1338125/1‑150 (MQ=255) gTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATgg > 1:1677132/1‑150 (MQ=255) aTCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGtt > 2:575201/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTcc < 1:5936/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGc > 1:1559498/1‑139 (MQ=255) cGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGc < 2:1559498/139‑1 (MQ=255) cGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCa < 2:689424/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGc > 1:1309189/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCGGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATc < 2:78182/133‑1 (MQ=255) cAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCGGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATc > 1:78182/1‑133 (MQ=255) cGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCAttt > 1:761035/1‑150 (MQ=255) aGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGtt > 2:175985/1‑150 (MQ=255) tCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTtg > 2:1221856/1‑150 (MQ=255) gcCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGaa < 1:575201/150‑1 (MQ=255) ccACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGt < 2:1279150/98‑1 (MQ=255) ccACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGt > 1:1279150/1‑98 (MQ=255) ccACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAg > 2:676027/1‑150 (MQ=255) ccACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAg > 2:1551679/1‑150 (MQ=255) cACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGc > 1:602157/1‑150 (MQ=255) cACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGc > 1:830360/1‑150 (MQ=255) tCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGc < 1:1221856/150‑1 (MQ=255) ttGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAAc < 1:1745204/150‑1 (MQ=255) ggtgacGAGCAGCGGCGAGGGGCTAATCGACGGTAAGGTCCTGAGCACATCGGGGTGGCCTACGCTGCGCTCGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCCAAGCGTTCTGGACAACGTGGc < 2:459835/145‑1 (MQ=255) gagCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCa < 1:896391/83‑1 (MQ=255) gagCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCa > 2:896391/1‑83 (MQ=255) gagCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTACTGAGCAGCATGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGcc > 1:1306781/1‑150 (MQ=255) agCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAg > 2:902788/1‑104 (MQ=255) agCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAg < 1:902788/104‑1 (MQ=255) agCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGAc > 1:1652341/1‑140 (MQ=255) agCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGAc < 2:1652341/140‑1 (MQ=255) gCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCtt < 2:830360/150‑1 (MQ=255) agcagcGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGccc < 1:175985/150‑1 (MQ=255) gcggcgAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTgg > 2:431054/1‑150 (MQ=255) ggTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTgcg > 2:1820345/1‑150 (MQ=255) tCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGCGTTCCAGCATTTCGGAATCCTGCCTCATCGAAGCTTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTg < 1:1208004/150‑1 (MQ=255) cATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGa > 1:1302198/1‑150 (MQ=255) aTCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGc < 1:1760578/108‑1 (MQ=255) aTCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGc > 2:1760578/1‑108 (MQ=255) aTCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAg > 1:1240087/1‑150 (MQ=255) tCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGtt < 1:691730/90‑1 (MQ=255) tCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGtt > 2:691730/1‑90 (MQ=255) tCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGc < 1:676027/150‑1 (MQ=255) ggTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGaa < 1:431054/150‑1 (MQ=255) ggTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCCGTTTGCCGAAGCATCCAAGCGTGCTGGACAACGTGGCGTTGCCCTGGGAATTGCGCGGTGAGCCAGaa < 2:1677132/150‑1 (MQ=255) ttGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCa < 2:1695418/72‑1 (MQ=255) ttGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCa > 1:1695418/2‑73 (MQ=255) tGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAg > 2:1499898/1‑150 (MQ=255) aGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTa < 2:1240087/150‑1 (MQ=255) tCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTc < 1:1837090/150‑1 (MQ=255) tCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTc > 1:1312019/1‑150 (MQ=255) agcagcTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTcgccgc > 2:499035/1‑150 (MQ=255) cTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGc < 2:1312019/150‑1 (MQ=255) cTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGc > 2:869640/1‑150 (MQ=255) ctggcGCAGCGTAGGCTGCGTCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGa < 2:231454/121‑1 (MQ=255) ctggcGCAGCGTAGGCTGCGTCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGa > 1:231454/5‑125 (MQ=255) gCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGAATCGGCCTGGTGTTCCAGAATTTCGGTTTGCTGCCGCAGCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGCGGCACt > 1:1007592/1‑150 (MQ=255) ccTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGc < 1:1337344/118‑1 (MQ=255) ccTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGc > 2:1337344/1‑118 (MQ=255) | TCGCGGTGCGGCGTGGCGAAGTGCTTTGCTTGATGGGTACATCCGGCAGCGGCAAGTCGACTTTGCTGCGCCACGTCAACCGGTTGATAGAGCCGAGCAGCGGCGAGGTGCTCATCGACGGTGAGGTCCTGAGCAGCTTGACGCAGCCTACGCTGCGCCAGCTGCGGTCGCAGCGCATCGGCATGGTGTTCCAGCATTTCGGTTTGCTGCCGCATCGAAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTGCCCCTGGAATTGCGCGGTGAGCCAGAAAGTACTCGCCGCACAGCGGCACT > NC_002947/3158203‑3158494 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |