| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,403,339 | G→T | 6.2% | R57R (CGA→AGA) | PP_3013 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,403,339 | 0 | G | T | 6.2% | 230.4 / 2.2 | 74 | R57R (CGA→AGA) | PP_3013 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/32); new base T (2/3); total (39/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 | |||||||||||
TACAGGGGAGCCAAGCCCTGAGCCCGCATTTGGTTCGCAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTCTGAAGCCCCTGCCGAGTCGTGGTGTGAT > NC_002947/3403192‑3403488 | tACAGGGGAGCCAAGCCCTGAGCCCGCATTTGGTTCGCAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCt > 1:361172/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCTGAGCCCGCATTTGGTTCGCAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGNCNGCAATCNGCCGGCGTCGGTNTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTNGt < 1:1331009/150‑1 (MQ=255) aaGCCCTGAGCCCGCATTTGGTTCGCAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACTCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCTAGTGGTa > 2:1172769/1‑150 (MQ=255) cccGCATTTGGTTCGCAATGGTGCGGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTATGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGgcga > 1:462661/1‑150 (MQ=255) cccGCATTTGGTTCGCAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGgcga < 1:253658/150‑1 (MQ=255) cGCATTTGGTTCGCAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGgcgagc > 1:1264820/1‑150 (MQ=255) tttGGTTCGCAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGaaa < 1:583276/150‑1 (MQ=255) tGGTTCGCAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGa < 1:586662/150‑1 (MQ=255) ttCGCAATGGTGCCGGAGCATCCTAATGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGc > 1:1717614/1‑150 (MQ=255) cAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGt < 2:1427957/121‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGt > 1:1427957/1‑121 (MQ=255) cAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACg < 2:361172/150‑1 (MQ=255) aaTGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACgg > 2:846716/1‑150 (MQ=255) ccGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGgcgag > 1:1384499/1‑128 (MQ=255) ccGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGgcgag < 2:1384499/128‑1 (MQ=255) aGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCAcc < 1:870014/150‑1 (MQ=255) atGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCtt > 1:1076505/1‑137 (MQ=255) atGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCtt < 2:1076505/137‑1 (MQ=255) tGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTa > 1:367325/1‑150 (MQ=255) gAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCTCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTaa < 1:1403818/150‑1 (MQ=255) aCTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTaa > 1:274737/1‑146 (MQ=255) aCTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTaa < 2:274737/146‑1 (MQ=255) aCTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGt > 2:76992/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTAAGTCAGGAAAGAGATAGGAGGGTCGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTg > 1:433352/1‑150 (MQ=255) ttCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGAt < 2:1824568/118‑1 (MQ=255) ttCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGAt > 1:1824568/1‑118 (MQ=255) cTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTCCCAGGGTGACGGGt > 2:138306/1‑150 (MQ=255) ttttCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGtt > 1:471559/1‑150 (MQ=255) ctgTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCTACTGATTGTCGATCGGCAAGTGGTACGTACGGCGAGCGAAAGATGCTACGACCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCAtt > 2:128729/1‑150 (MQ=255) ctgTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGtt > 2:1870391/1‑119 (MQ=255) ctgTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGtt < 1:1870391/119‑1 (MQ=255) tgTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTc > 2:482773/1‑150 (MQ=255) tACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTg > 2:1212828/1‑142 (MQ=255) tACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTg < 1:1212828/142‑1 (MQ=255) ccTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAgg < 2:1044349/128‑1 (MQ=255) ccTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAgg > 1:1044349/1‑128 (MQ=255) cTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGa < 2:1548195/148‑1 (MQ=255) cTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGa > 1:1548195/1‑148 (MQ=255) cagcaCCGAACCCTTGTTGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGa < 1:114630/145‑1 (MQ=255) cagcaCCGAACCCTTGTTGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGa > 2:114630/1‑145 (MQ=255) caCCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAgaagaa < 1:482773/150‑1 (MQ=255) aCCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAACCCGCCGACGAAAGTGAAACCAGATCGTCGCTCGGCGAGTGTGACATCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGGCTTGGTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAAc > 1:1493381/1‑150 (MQ=255) gAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGTCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGa > 2:1755569/1‑150 (MQ=255) gAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGa < 2:1717614/150‑1 (MQ=255) aCCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGAt > 2:140700/1‑137 (MQ=255) aCCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGAt < 1:140700/137‑1 (MQ=255) ttGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGtgttg < 1:1227408/150‑1 (MQ=255) gtcAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGc > 2:1023656/1‑150 (MQ=255) tcAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCTCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCtt > 2:1516662/1‑88 (MQ=255) tcAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCTCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCtt > 2:1516826/1‑88 (MQ=255) tcAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCTCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCtt < 1:1516662/88‑1 (MQ=255) tcAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCTCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCtt < 1:1516826/88‑1 (MQ=255) tcAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCg < 2:367325/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGt > 2:883566/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGCAGTCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTgg < 1:585783/150‑1 (MQ=255) tGCTAGCTATCCGCCGTCGTCTGTGTTGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTTGTACGTCTGGCGAGCGAAACATTCTACGTCCTTCTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGCGTGTTGTTGGCGTTGGt < 1:128729/150‑1 (MQ=255) ccAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGtt > 1:759615/1‑84 (MQ=255) ccAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGtt < 2:759615/84‑1 (MQ=255) aGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTc < 2:1716249/114‑1 (MQ=255) aGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTc > 1:1716249/1‑114 (MQ=255) aaTCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATa < 2:1264820/150‑1 (MQ=255) cgGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTCTGaa < 1:76992/150‑1 (MQ=255) cgGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGAATGGAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTCTGaa > 1:1789761/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCCCCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGa > 2:745892/1‑103 (MQ=255) gTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGa < 1:745892/103‑1 (MQ=255) gtgtCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATCATGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTCTGAAGCCCCTGc < 1:138306/150‑1 (MQ=255) tcTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCg > 2:152834/1‑63 (MQ=255) tcTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCg < 1:152834/63‑1 (MQ=255) tcTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTCTGAAGCCCCTGCCGAGTc > 1:332579/1‑150 (MQ=255) tcTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTCTGAAGCCCCTGCCGAGTc > 1:984684/1‑150 (MQ=255) gATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTCTGAAGCCCCTGCCGAGTCgtg > 1:777045/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTg > 1:165480/1‑120 (MQ=255) ttGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTg < 2:165480/120‑1 (MQ=255) ttGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTCTGAAGCCCCTGCCGAGTCgtggt < 2:471559/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCCTAGTCTGAAGCCCCTGCCGAGTCGTGGTGTGAt < 2:462661/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTc < 2:447791/122‑1 (MQ=255) gCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTc > 1:447791/1‑122 (MQ=255) | TACAGGGGAGCCAAGCCCTGAGCCCGCATTTGGTTCGCAATGGTGCCGGAGCATCATGAGGACTTCAGCTTTTCTGCTGTACCTGCAGCACCGAACCCTTGTCGTCAGTTGCCAGCAATCCGCCGGCGTCGGTGTCGTCTGATTGTCGCTCGGCAAGTGGTACGTCCGGCGAGCGAAAGATGCTACGGCCTTGTTCACCGGTTTTAAGGGTGACGAGTTTGCCATTCTGATAGAAGAACTGAGTGTTGTTGGCGTTGGTTTGCATAGTCTGAAGCCCCTGCCGAGTCGTGGTGTGAT > NC_002947/3403192‑3403488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |