Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,553,216 | T→A | 5.5% | L277Q (CTG→CAG) | PP_3137 → | group 2 family glycosyl transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,553,216 | 0 | T | A | 5.5% | 277.8 / 5.0 | 91 | L277Q (CTG→CAG) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/44); new base A (3/2); total (45/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 |
CCAGCCACCCGAGCGGCATTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGATCGAGTACAAGTGAG > NC_002947/3553067‑3553365 | ccagccaCCCGAGCGGCATTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCt > 1:622924/1‑150 (MQ=255) ccagccaCCCGAGCGGCATTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCt > 2:854614/1‑150 (MQ=255) agccaCCCGAGCGGCATTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGGTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCGGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCCACCCACTGCAGGCGGTGGGACTgg > 2:1924634/1‑150 (MQ=255) ccaCCCGAGCGGCATTAGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGTTCTACCCACTGCAGGCGGCGCGCCAGgcg > 1:320462/1‑150 (MQ=255) caCCCGAGCGGCATTGGCTGCGTGCGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGgcgc < 2:892749/150‑1 (MQ=255) gAGCGGCATTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGCGCGCCAGGCGcaccgc < 2:320462/150‑1 (MQ=255) gCATTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGTGCCTGGCGCGCCGcggcgg > 2:1770136/1‑150 (MQ=255) gCATTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGcggcgg > 1:1141963/1‑150 (MQ=255) cATTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCggcggc > 1:306061/1‑150 (MQ=255) cATTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCggcggc < 1:854614/150‑1 (MQ=255) aTTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCa < 2:1651221/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGt < 1:1924634/150‑1 (MQ=255) gCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTg > 2:1289311/1‑150 (MQ=255) gCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTg > 2:241114/1‑150 (MQ=255) gCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTg > 2:1428126/1‑150 (MQ=255) gTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCTGCGGCAAGTGGACGCGCga < 2:1141963/150‑1 (MQ=255) tCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCgag > 2:906931/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGTGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTg < 1:1770136/150‑1 (MQ=255) gCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTg < 1:1133424/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGCGCGCCAGGCGcaccgcc < 2:978865/118‑2 (MQ=255) tGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGCGCGCCAGGCGcaccgcc > 1:978865/1‑117 (MQ=255) gTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGc < 2:1815555/150‑1 (MQ=255) gggCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGtt > 2:1915519/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTc > 2:25297/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTc < 1:1915519/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTcc > 2:1282927/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGAGTTACCCTCTTGACGACGCGCGCATGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTcc > 1:137291/1‑150 (MQ=255) cTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCCGGCGGTGCGCCTGGCCCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTg < 2:115389/150‑1 (MQ=255) cTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTTGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTg > 2:1126962/1‑150 (MQ=255) gggCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTTGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGgt < 1:1126962/150‑1 (MQ=255) gggCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGgt < 1:1428126/150‑1 (MQ=255) gggCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGATCTTATAGAGCCAATGCCGACTGCAAGCGGTGCCCCTGGCGCGAAGCGGCAACTAATGGACCCGTTTTGTCTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGgt < 1:1893422/150‑1 (MQ=255) gCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGgtgt < 1:1918256/150‑1 (MQ=255) aTACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTg > 2:1920523/1‑150 (MQ=255) aTACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTg < 1:1920523/150‑1 (MQ=255) tACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTgg < 1:1289311/150‑1 (MQ=255) aCCTTTGGTGATCGCGCTGTCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGGTGCTGTTGAACTCACCACTGCAGGCGGTTCGACTGGCCCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCGGCGGGCCGTGTTCCTGGTGTTggg > 2:277046/1‑150 (MQ=255) aCCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTggg < 1:1282927/150‑1 (MQ=255) cTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCa > 2:1336529/1‑150 (MQ=255) cTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCa > 1:1150525/1‑150 (MQ=255) cTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCa > 1:1445754/1‑150 (MQ=255) ggTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGtt < 2:1198072/150‑1 (MQ=255) aTCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCg < 1:317934/150‑1 (MQ=255) aTCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCg < 1:25297/150‑1 (MQ=255) tcccgcTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCgg > 1:1934432/4‑150 (MQ=255) cctgcctgCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCg < 1:1224250/150‑1 (MQ=255) ctgcctgcTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCgg > 1:1731090/1‑150 (MQ=255) tgcctgcTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGc < 2:1934432/150‑1 (MQ=255) ctgctgGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGc < 1:809582/97‑1 (MQ=255) ctgctgGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGc > 2:809582/1‑97 (MQ=255) 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(MQ=255) gcTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGcc > 1:1848140/1‑95 (MQ=255) gcTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGcc < 2:1848140/95‑1 (MQ=255) gcTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTgc < 2:622924/150‑1 (MQ=255) gcTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTgc < 1:906931/150‑1 (MQ=255) gcTGGGGCCTGCTGTTGCTGTCGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTgc < 2:996021/150‑1 (MQ=255) tGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTgcgc > 2:390569/1‑150 (MQ=255) 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aTCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCaaa > 1:943680/1‑150 (MQ=255) tCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGTCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAAt > 2:837339/1‑150 (MQ=255) cTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCAGTAGCTTGCGGCTGGCAAATc < 1:1125638/150‑1 (MQ=255) cccACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGTCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGc < 1:837339/150‑1 (MQ=255) ccACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCt > 2:1814196/1‑150 (MQ=255) ccACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGAGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCCCCGCCTTCCGGCTGGCAAGTCGGCt > 2:603228/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGGCGGGGCACCTGGCGCGCGGCGCCCTCAAGTGGGCGCGCGATAACTGGCTGCAGTCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCTGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCttt < 2:609607/149‑1 (MQ=255) acggCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCttt < 1:603228/147‑1 (MQ=255) aCTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCttt > 2:1816133/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGa > 2:647665/1‑150 (MQ=255) cgccgcggcgCGCCAGGCGCACCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGAt > 2:855193/5‑150 (MQ=255) cAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTggg < 1:1312045/77‑1 (MQ=255) cAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTggg > 2:1312045/1‑77 (MQ=255) aGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGATCg > 1:1461553/1‑150 (MQ=255) gggggTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCGAGTTCCCGGAAGTGCTCGGCGTACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGGGTTGATCGa < 2:1525/147‑1 (MQ=255) gCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGATCGAg < 1:647665/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAANTTCCTGNGCCACCGCCTTGNGGCTGGCAAATCGGCTTTGATCGAGTa < 1:1336529/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGATCGAGTa > 1:1451841/1‑150 (MQ=255) gcCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGACCTGGCTGCAGTCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGATCGAGTACAAGt < 1:1583683/150‑1 (MQ=255) gcCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGATCGAGTACAAGt < 1:241114/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGATCGAGTACAAGTgag < 1:534745/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGAAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCCCCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGATCGAGTACAAGTgag < 1:534767/150‑1 (MQ=255) | CCAGCCACCCGAGCGGCATTGGCTGCGTGAGTCACGTCGGGCCTGGTTGTGGGGCCTGGGCATACCTTTGGTGATCGCGCTGGCCTGCCTGCTGCTGGGCGGCTGGGGCCTGCTGTTGCTGTTGATCTACCCACTGCAGGCGGTGCGCCTGGCGCGCCGCGGCGGCAAGTGGACGCGCGAGAACTGGCTGCAGGCCGTGTTCCTGGTGTTGGGCAAGTTCCCGGAAATGCTCGGCCAACTGAAGTTCCTGCGCCACCGCCTTGCGGCTGGCAAATCGGCTTTGATCGAGTACAAGTGAG > NC_002947/3553067‑3553365 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |