Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,625,580 | T→A | 5.6% | intergenic (‑50/+27) | PP_3195 ← / ← PP_3196 | hypothetical protein/nodulation protein d1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,625,580 | 0 | T | A | 5.6% | 218.4 / 4.0 | 72 | intergenic (‑50/+27) | PP_3195/PP_3196 | hypothetical protein/nodulation protein d1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/30); new base A (2/2); total (39/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.85e-01 |
TTGTCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAA > NC_002947/3625431‑3625726 | ttgtCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCt > 1:1795908/1‑150 (MQ=255) cTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGgt > 1:846660/1‑150 (MQ=255) cTGCGGTCGTGGAGGCCTGCGCCGACATGCGGGACAGGCAGGCAGTGGGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGACAGGGCCGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGTATGCGAGGTCTCGCGAAACGGGATGACCGAG‑CATCGCTACGGCGTc > 2:114780/1‑150 (MQ=255) tGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCt > 2:1901086/1‑150 (MQ=255) gCGGGCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTCAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGCTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTg < 1:1854358/150‑1 (MQ=255) gTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAACCGGTTTTTGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgggg < 2:264673/150‑1 (MQ=255) tCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGc > 2:1513120/1‑150 (MQ=255) gTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgcc < 2:1018812/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCCGGGGCGATGgcc > 2:1739106/1‑150 (MQ=255) tCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACTCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgccg > 1:732092/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCCCACTTGAGCGAAAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgccgc < 1:836490/150‑1 (MQ=255) gCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGgc > 1:924048/1‑150 (MQ=255) aggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGGTGCGGTGTGTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCa > 1:1317081/1‑150 (MQ=255) aggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCa < 1:1892330/150‑1 (MQ=255) ggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATTAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGc < 2:1557197/108‑1 (MQ=255) ggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATTAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGc > 1:1557197/1‑108 (MQ=255) ggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCCGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCag > 2:1030374/1‑150 (MQ=255) aggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGACGCCCCAGACACCGCAGCg < 1:998443/107‑1 (MQ=255) aggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGACGCCCCAGACACCGCAGCg > 2:998443/1‑107 (MQ=255) ggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCa < 1:922829/150‑1 (MQ=255) gcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCAt > 1:855020/1‑150 (MQ=255) gcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCAt > 1:700036/1‑150 (MQ=255) gggCGCGGTCTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTg < 1:1444566/150‑1 (MQ=255) gTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGt > 1:1779273/1‑126 (MQ=255) gTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGt < 2:1779273/126‑1 (MQ=255) tttGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGTTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTg > 2:395655/1‑150 (MQ=255) tttGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTg > 2:363371/1‑150 (MQ=255) gggCAAGGTGCGCGGGCAGGGGGGGGTGGGGGCGATCGGGAGCAGGGATGCGAGGTATCGGGAAACGCGGTGCGCCAG‑CACGGCGGCGGTGTGTGGGGGGATGGCCGCCGCTCAGGGGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGgc < 1:1030374/149‑1 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGgcg > 1:1075294/1‑150 (MQ=255) aGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACt < 1:1901086/150‑1 (MQ=255) ggTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGa < 1:1763810/95‑1 (MQ=255) ggTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGa > 2:1763810/1‑95 (MQ=255) gcaggcagGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGACTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGa > 2:1516709/1‑150 (MQ=255) agggcagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGTCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGc > 1:1667951/1‑150 (MQ=255) ggcagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTg > 1:1424885/1‑150 (MQ=255) cagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCACTGGAGTTCGAAACTCTATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGAt < 1:1397903/150‑1 (MQ=255) agggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGccgccg > 2:1542847/1‑88 (MQ=255) agggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGccgccg < 1:1542847/88‑1 (MQ=255) gggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATgc < 2:1795908/150‑1 (MQ=255) cAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCACTGATGCGCTCGCGaa > 1:1830781/1‑150 (MQ=255) tCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGcc < 2:855020/150‑1 (MQ=255) gTGATCAGGGATGCGAGGTATCACGAAACGCAATGCCCCAG‑CACCTCTTCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCAt < 2:1667951/150‑1 (MQ=255) gATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCt < 2:1572001/150‑1 (MQ=255) tCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCtgt < 1:1513120/150‑1 (MQ=255) cAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCtgtg < 1:1739106/150‑1 (MQ=255) aGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGc > 1:974380/1‑150 (MQ=255) ggATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCAt < 2:732092/150‑1 (MQ=255) tGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGc > 1:1196242/1‑91 (MQ=255) tGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGc < 2:1196242/91‑1 (MQ=255) tcGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATgggg > 2:518656/2‑150 (MQ=255) gCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATgggg < 2:974380/150‑1 (MQ=255) tCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCa < 1:1072033/137‑1 (MQ=255) tCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCa > 2:1072033/1‑137 (MQ=255) tCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTc > 1:471234/1‑150 (MQ=255) gAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCAtt > 2:1093892/1‑149 (MQ=255) aaaCGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCAtgc > 2:570354/1‑150 (MQ=255) aTGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTg > 2:1246323/1‑150 (MQ=255) tGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGAGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGc < 1:1426390/150‑1 (MQ=255) gCCCCAGACACCGCAGCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGcc > 1:191310/1‑150 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCAt < 2:1797566/61‑1 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCAt > 1:1797566/1‑61 (MQ=255) ccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGt > 1:71967/1‑144 (MQ=255) ccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGt < 2:71967/144‑1 (MQ=255) ccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCcaca > 1:1119013/1‑150 (MQ=255) ccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCcaca > 1:482791/1‑150 (MQ=255) g‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCa > 1:557399/1‑150 (MQ=255) cACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCACTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCAt < 2:1830781/150‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGc > 2:945287/1‑88 (MQ=255) aCCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGc < 1:945287/88‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGc < 2:665249/105‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGc > 1:665249/1‑105 (MQ=255) ccGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGa < 2:924048/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGaa < 2:191310/150‑1 (MQ=255) | TTGTCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAA > NC_002947/3625431‑3625726 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |