| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,793,935 | A→T | 6.5% | L211M (TTG→ATG) | PP_3355 ← | beta‑ketothiolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,793,935 | 0 | A | T | 6.5% | 240.0 / 7.4 | 77 | L211M (TTG→ATG) | PP_3355 | beta‑ketothiolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/40); new base T (3/2); total (35/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.21e-01 | |||||||||||
CAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCACGCGCC > NC_002947/3793786‑3794080 | cAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcaa > 1:1381393/1‑150 (MQ=255) ggCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTATGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcattgc < 2:635073/150‑1 (MQ=255) gccgcGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCcg > 1:903113/1‑150 (MQ=255) ccgcGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCcgc > 1:42122/1‑150 (MQ=255) gcgcCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGt < 2:1167576/150‑1 (MQ=255) cATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGACTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGtggct < 2:1404787/150‑1 (MQ=255) cGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGtggctggc < 1:1731323/150‑1 (MQ=255) ccaccGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGc < 2:1095623/150‑1 (MQ=255) caccGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGcc > 2:1613654/1‑150 (MQ=255) ccGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTCTGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGCACTCACACACTGCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCtt > 1:434086/1‑150 (MQ=255) cgcAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTa < 2:1918780/150‑1 (MQ=255) cgcAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCAGTGGGTGGCTGTCCTGGCTCAGCTCAATCACCGCACCCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTa < 1:339188/150‑1 (MQ=255) gcAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTAc < 2:578905/150‑1 (MQ=255) aCTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTc > 2:742339/1‑150 (MQ=255) aCTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTc < 2:42122/150‑1 (MQ=255) cAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCt < 1:1856368/150‑1 (MQ=255) ccGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTgcg > 2:77037/1‑150 (MQ=255) gTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcattgca > 2:1762140/1‑108 (MQ=255) gTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcattgca < 1:1762140/108‑1 (MQ=255) gTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGcgcg < 2:239997/150‑1 (MQ=255) tCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCa > 2:1269262/1‑138 (MQ=255) tCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCa < 1:1269262/138‑1 (MQ=255) cTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGt < 1:623311/150‑1 (MQ=255) cTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGt < 2:1123262/150‑1 (MQ=255) gCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGa < 2:1599838/150‑1 (MQ=255) gCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGa < 2:865801/150‑1 (MQ=255) cGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGc < 1:1118203/150‑1 (MQ=255) ccACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTg < 2:1707934/150‑1 (MQ=255) cACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGa < 1:573102/150‑1 (MQ=255) cACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGa < 1:1456420/150‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGCACTGGGCGCAGTCGGGCGAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTGCTGGCTGACGTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTACAGGGCCTGCGCGGTGACGCTGAc < 1:1516057/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGGCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGa > 2:911150/1‑150 (MQ=255) gCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGAtt < 1:742339/150‑1 (MQ=255) gCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGAtt > 2:1451231/1‑150 (MQ=255) gTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGc < 2:1041990/110‑1 (MQ=255) gTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGc > 1:1041990/1‑110 (MQ=255) cACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtc < 1:675789/150‑1 (MQ=255) aCCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGTCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtcg > 2:1254640/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtcgt < 2:178719/150‑1 (MQ=255) cgcAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAAc < 2:303429/150‑1 (MQ=255) cAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCa > 1:640476/1‑150 (MQ=255) aGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAg > 2:1315588/1‑150 (MQ=255) tCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGcc < 1:77037/150‑1 (MQ=255) gggCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCt > 1:283920/1‑150 (MQ=255) ccAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAACCCTGcc > 2:1940256/1‑149 (MQ=255) gCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTgg < 2:283920/150‑1 (MQ=255) gcgTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGc < 2:1355772/150‑1 (MQ=255) gTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtc > 2:1866112/1‑116 (MQ=255) gTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtc < 1:1866112/116‑1 (MQ=255) gCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCtt < 2:912769/138‑1 (MQ=255) gCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCtt > 1:912769/1‑138 (MQ=255) gggtggCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATgg < 2:434086/150‑1 (MQ=255) gtggCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCt > 2:213058/1‑150 (MQ=255) gtggCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCt < 1:1613654/150‑1 (MQ=255) tGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCa > 1:295364/1‑150 (MQ=255) tCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAgg > 1:1395808/1‑150 (MQ=255) ccTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAggg < 1:1451231/150‑1 (MQ=255) tGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGcc > 2:177762/1‑150 (MQ=255) cTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCAc < 1:1914187/150‑1 (MQ=255) cTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAAGGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTAGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCAc < 2:9631/150‑1 (MQ=255) ccTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGcgcg > 2:1294385/1‑68 (MQ=255) ccTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGcgcg < 1:1294385/68‑1 (MQ=255) ctcactcaCGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTgg < 2:1597353/109‑1 (MQ=255) ctcactcaCGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTgg > 1:1597353/1‑109 (MQ=255) ctcactcaCGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTc > 2:48832/1‑150 (MQ=255) cactcacGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCa > 1:1186208/1‑150 (MQ=255) acgccacgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGtt > 1:951627/1‑150 (MQ=255) cgccacgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGttt > 2:1514806/1‑150 (MQ=255) gccacgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTc < 2:951627/150‑1 (MQ=255) gccacgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATAGCTGCTCCGGGCCCACCCGTCCACCGTTTc > 2:245153/1‑150 (MQ=255) acgcGGCATTGCATTGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGcgcg < 2:1765878/55‑1 (MQ=25) acgcGGCATTGCATTGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGcgcg > 1:1765878/1‑55 (MQ=25) acgcGGCATTGCATTGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTc < 1:1076047/72‑1 (MQ=38) acgcGGCATTGCATTGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTc > 2:1076047/1‑72 (MQ=38) acgcGGCATTGCATTGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCAcg > 1:266484/1‑150 (MQ=255) acgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCAcg > 1:59383/1‑150 (MQ=255) gcgGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtcgt > 1:1704094/1‑75 (MQ=255) gcgGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtcgt < 2:1704094/75‑1 (MQ=255) gcgGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATgg < 1:136087/116‑1 (MQ=255) gcgGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATgg > 2:136087/1‑116 (MQ=255) ggCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCACGCGcc > 2:1579099/1‑150 (MQ=255) | CAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCACGCGCC > NC_002947/3793786‑3794080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |