| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,082,935 | C→T | 6.1% | P279L (CCG→CTG) | PP_3592 → | RpiR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,082,935 | 0 | C | T | 6.1% | 190.4 / 2.6 | 66 | P279L (CCG→CTG) | PP_3592 | RpiR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/32); new base T (2/2); total (32/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.88e-01 | |||||||||||
GGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTG > NC_002947/4082786‑4083084 | ggTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGAcc < 1:1301355/150‑1 (MQ=255) gACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACAATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGa < 2:1029231/150‑1 (MQ=255) cGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGt > 2:43144/1‑150 (MQ=255) acacCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTg < 1:867771/150‑1 (MQ=255) acCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCACACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGCTGGCAAACGAGGTCTGCAGGAAGCTCGGACCGGATGTTGaa > 2:510105/1‑150 (MQ=255) cTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGAGAATTCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGACGCTCGCACCGTATGTTGaaaa > 2:59625/1‑150 (MQ=255) ttCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGaaaaa > 2:1156599/1‑150 (MQ=255) ggCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGc < 1:1458994/150‑1 (MQ=255) ggATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATACGCCTCGACGAGGCTGTGGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAAc < 1:441581/150‑1 (MQ=255) gCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGcc > 1:378026/1‑150 (MQ=255) ccAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACTGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCg > 1:1271866/1‑150 (MQ=255) ccAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACTGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCg > 1:1271848/1‑150 (MQ=255) cAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGAAAGCAACTgaccc > 1:797710/1‑146 (MQ=255) cAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGAATGTTGAAACACGCTTGGAAGCAACTGCCGc > 2:831649/1‑150 (MQ=255) tGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGctct > 2:1882629/1‑150 (MQ=255) tGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAAAGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAACCGCTTGGAAGCAACTGCCGctct < 1:831649/150‑1 (MQ=255) ccGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTAc < 1:982387/150‑1 (MQ=255) cgacgaGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACa < 1:831670/150‑1 (MQ=255) gacgaGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAACACGCCTCGACTGTGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACAt > 1:1408104/1‑150 (MQ=255) cgaGGTGTTCCGACTCGCCATCGCGTCCCGACTCTTCTTCGAATCCGTCCCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATaa < 2:990581/150‑1 (MQ=255) gaGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGTGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTGGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAAc < 1:1792536/150‑1 (MQ=255) gtgtTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGaa > 2:734214/1‑150 (MQ=255) tgtTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAAt < 1:945433/150‑1 (MQ=255) cGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATtcgtc < 2:1646497/150‑1 (MQ=255) cGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATtcgtc < 1:1882629/150‑1 (MQ=255) gCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATtcgtcg < 2:330527/150‑1 (MQ=255) cATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCgg < 1:43144/150‑1 (MQ=255) cccACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGATGCACCTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTac > 1:408359/1‑150 (MQ=255) ccACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATtcgtc < 2:695163/143‑1 (MQ=255) ccACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATtcgtc > 1:695163/1‑143 (MQ=255) ccACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTaca > 2:1490616/1‑150 (MQ=255) ttCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCTGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTgg > 2:1522270/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATtcgtc > 2:385244/1‑131 (MQ=255) aCCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATtcgtc < 1:385244/131‑1 (MQ=255) ccTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGc < 1:1363786/111‑1 (MQ=255) ccTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGc > 2:1363786/1‑111 (MQ=255) tGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACgg < 2:782138/150‑1 (MQ=255) gTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACggg < 1:734214/150‑1 (MQ=255) gAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAaacaa < 1:1156599/150‑1 (MQ=255) aaTCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAaacaac < 1:1908557/150‑1 (MQ=255) aTCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAacaaca < 1:583624/150‑1 (MQ=255) aCCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTacac > 2:1564951/1‑122 (MQ=255) aCCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTacac < 1:1564951/122‑1 (MQ=255) aCCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGc > 2:619553/1‑138 (MQ=255) aCCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGc < 1:619553/138‑1 (MQ=255) tGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAag < 1:1737767/136‑1 (MQ=255) tGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAag > 2:1737767/1‑136 (MQ=255) gTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCga > 2:546691/1‑150 (MQ=255) tGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAg > 1:1681480/1‑143 (MQ=255) tGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAg < 2:1681480/143‑1 (MQ=255) gCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACTGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCgaga < 2:1271848/150‑1 (MQ=255) gCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACTGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCgaga < 2:1271866/150‑1 (MQ=255) aTCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATg < 2:378026/150‑1 (MQ=255) tGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAAc > 1:1030896/1‑150 (MQ=255) aTGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATGGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACaa < 1:510105/150‑1 (MQ=255) aTGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACaa > 1:950297/1‑150 (MQ=255) aaCGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCAt > 1:1175347/1‑150 (MQ=255) gAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGc > 2:576500/1‑112 (MQ=255) gAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGc < 1:576500/112‑1 (MQ=255) tGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCt > 1:334232/1‑150 (MQ=255) aagaagCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGc > 1:1443379/1‑90 (MQ=255) aagaagCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGc < 2:1443379/90‑1 (MQ=255) gaagCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAaacaa > 2:1197967/1‑94 (MQ=255) gaagCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTg > 1:807241/1‑118 (MQ=255) gaagCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTg < 2:807241/118‑1 (MQ=255) caagCTCGTACCGGATGTTGCAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAaacaa < 1:1197967/93‑1 (MQ=255) ggACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACAACTCGTGGTGGACGGGCAAACAACAATAGCACGAGTGCAATGAGCTGCGAGATGAACAAGTCCATGCCCTTGCTAGGCGCGTgcgc > 2:580784/1‑150 (MQ=255) cGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACg < 1:134170/74‑1 (MQ=255) cGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACg > 2:134170/1‑74 (MQ=255) cGGATGTTGAAAAACACTTGGCAGCAACTGCAGCACTAACTGACGAAGTCGCCGGCTACACCTCGTGCTCGACGGGCAAACAACACTAGCAATAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCctg < 2:408359/150‑1 (MQ=255) | GGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTG > NC_002947/4082786‑4083084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |