Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,141,475 | G→A | 5.3% | V132M (GTG→ATG) | PP_3645 → | L‑proline amide hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,141,475 | 0 | G | A | 5.3% | 225.1 / 2.4 | 75 | V132M (GTG→ATG) | PP_3645 | L‑proline amide hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/35); new base A (2/2); total (38/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.81e-01 |
CACCTGCAAATTGCACAAGCCACCGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACTGGCGAGCAACGACCCGCAG > NC_002947/4141328‑4141624 | caccTGCAAATTGCACAAGCCACCGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTg > 2:1647326/1‑150 (MQ=255) accTGCAAATTGCACAAGCCACCGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGa < 1:1647326/150‑1 (MQ=255) gCAAATTGCACAAGCCACCGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGc < 1:926803/150‑1 (MQ=255) tGCACAAGCCACCGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCACgcgc < 1:788799/150‑1 (MQ=255) acaAGCCACCGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCACCCGCACCCCCGAGCAACGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGc > 2:677181/1‑150 (MQ=255) ccACCGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAg > 2:1673026/1‑150 (MQ=255) cACCGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCGGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAgc < 1:263159/150‑1 (MQ=255) cGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAgcggc < 2:533548/150‑1 (MQ=255) cGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAgcggc > 1:180783/1‑150 (MQ=255) gCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCACACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTgg < 2:642014/150‑1 (MQ=255) cTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTggg < 1:974237/150‑1 (MQ=255) tctcCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGcc > 2:285002/1‑150 (MQ=255) gcggcCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCa > 1:1015290/1‑150 (MQ=255) cggcCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCaa < 2:1686428/150‑1 (MQ=255) gTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGAt < 1:533777/150‑1 (MQ=255) tgatggaTTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGCGCTGGGCCAAGACGCCAACGTCGAtgctgc > 1:67094/7‑150 (MQ=255) ccGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGAtgctgt > 1:1898833/1‑149 (MQ=255) cGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCATGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGcc > 2:1662050/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGAtgc > 1:479174/1‑140 (MQ=255) ttCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGAtgc < 2:479174/140‑1 (MQ=255) tCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGAcc < 2:1296655/150‑1 (MQ=255) gCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCCACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGa > 2:1441632/1‑122 (MQ=255) gCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGa < 1:1441632/122‑1 (MQ=255) cccTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAACGTGGCGGTGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCt < 2:66532/150‑1 (MQ=255) cccTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGc < 1:1445525/97‑1 (MQ=255) cccTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGc > 2:1445525/1‑97 (MQ=255) cccTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCt > 1:1456842/1‑150 (MQ=255) cccTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCATGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCt < 1:1662050/150‑1 (MQ=255) ccTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGACAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTg < 2:1085573/150‑1 (MQ=255) aaTTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTc < 2:1070828/150‑1 (MQ=255) ttACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAg > 2:1142542/1‑150 (MQ=255) cccGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGAtg < 2:560824/125‑1 (MQ=255) cccGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGAtg > 1:560824/1‑125 (MQ=255) ccGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGt > 1:82247/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGt < 2:16196/150‑1 (MQ=255) cGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTg > 2:1268030/1‑150 (MQ=255) gCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGa > 2:76367/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCAGGGGTGATCGCCCGCGCTGCGCAAGCGGTGGGGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAAt > 1:924206/1‑150 (MQ=255) gcCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACa > 1:1775229/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAg > 1:123687/1‑150 (MQ=255) tGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAgg < 2:305431/150‑1 (MQ=255) gCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCGCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCt > 1:1855214/1‑150 (MQ=255) cACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGt < 1:1726894/55‑1 (MQ=255) cACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGt > 2:1726894/1‑55 (MQ=255) gTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCcgcg > 1:143201/1‑150 (MQ=255) gCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCa > 1:847618/1‑150 (MQ=255) cTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAg > 1:432319/1‑150 (MQ=255) tCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAgg > 2:699324/1‑150 (MQ=255) tCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAgg > 1:214885/1‑150 (MQ=255) aGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTcgcc < 2:1236079/150‑1 (MQ=255) aGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTcgcc > 1:1236079/1‑150 (MQ=255) gCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAAc < 2:49410/134‑1 (MQ=255) gCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAAc > 1:49410/1‑134 (MQ=255) cGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTcgccgc < 2:1022915/150‑1 (MQ=255) tCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTc < 1:1673026/150‑1 (MQ=255) aaCCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGc > 2:1177356/1‑150 (MQ=255) aaCCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGc > 2:1177589/1‑150 (MQ=255) aaCCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTAGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGc > 1:886520/1‑150 (MQ=255) ccGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGCCACCTGCTCCAGCCGTTAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCa < 2:67094/150‑1 (MQ=255) ccGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCa < 1:699324/150‑1 (MQ=255) ccGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGATGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTgg > 2:6648/1‑97 (MQ=255) ccGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGATGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTgg > 2:976812/1‑97 (MQ=255) ccGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGATGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTgg < 1:6648/97‑1 (MQ=255) ccGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGATGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTgg < 1:976812/97‑1 (MQ=255) gCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAgg < 1:1868414/150‑1 (MQ=255) cACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGt > 2:206642/1‑150 (MQ=255) ccccGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCa > 1:1054394/1‑95 (MQ=255) ccccGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCa < 2:1054394/95‑1 (MQ=255) ccccGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACt > 1:384544/1‑150 (MQ=255) ccccGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACt < 1:1177589/150‑1 (MQ=255) ccccGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACt < 1:1177356/150‑1 (MQ=255) cGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACTGGc < 1:206642/150‑1 (MQ=255) aGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCAGCGCGGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACTGGCGa < 2:245225/150‑1 (MQ=255) aaGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACTGGCGAGCaa < 2:143201/150‑1 (MQ=255) ccGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTAGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACTGGCGAGCAACGAcc < 2:886520/150‑1 (MQ=255) ggggTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGAAGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCATGTACTGGCGAGCAACGACCCg < 2:712748/150‑1 (MQ=255) gggTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCTCCGCCATTCGCCAGGTACTGGCGAGCAACGACCCGc > 1:856099/1‑150 (MQ=255) ggTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACTGGCGAGCAACGACCCGCa > 2:1805059/1‑150 (MQ=255) gTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGGGCTGGGCCCATACGCCAACGTCGATGCTGCCCTCAACTTCGAAATCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACTGGCGAGCAACGACCCGCAg < 1:1305000/150‑1 (MQ=255) | CACCTGCAAATTGCACAAGCCACCGTGATCGGCTTCTCCATGGGCGGCCTGGTTGCCCGTGCATTCGCCCTCAATTACCCGCAGCGCCTGGCTGCACTGGTCGTGCTCAACAGCGTGTTCAACCGCACCCCCGAGCAAAGTGCCGGGGTGATCGCCCGCGCTGCCCAAGCGGCGGAGCTGGGCCCAGACGCCAACGTCGATGCTGCCCTGGACCGCTGGTTCAGCCGTGAATACAAGGCTGCCAACCCCGCGCAGGTCGCCGCCATTCGCCAGGTACTGGCGAGCAACGACCCGCAG > NC_002947/4141328‑4141624 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |