| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,203,914 | A→C | 5.3% | T1302T (ACT→ACG) | PP_3691 ← | DNA helicase‑related protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,203,914 | 0 | A | C | 5.3% | 213.7 / 3.8 | 75 | T1302T (ACT→ACG) | PP_3691 | DNA helicase‑related protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/35); new base C (2/2); total (38/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.34e-01 | |||||||||||
AACAACGCAAGCCTTTCACGCAGGCCAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTAACAGGTCGAAG > NC_002947/4203765‑4204061 | aacaacGCAAGCCTTTCACGCAGGCCAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCa < 1:11681/150‑1 (MQ=255)aacaacGCAAGCCTTTCACGCAGGCCAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCa < 1:11374/150‑1 (MQ=255) cGCAAGCCTTTCACGCAGGCCAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGc > 2:1274474/1‑150 (MQ=255) cAAGCCTTTCACGCAGGCCAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTa > 1:1158365/1‑150 (MQ=255) tttCACGCAGGCCAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGcc > 1:399374/1‑150 (MQ=255) cGCAGGCCAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTgg > 1:1879607/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGa > 1:1861486/1‑150 (MQ=255) ccAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGcc < 2:1879607/150‑1 (MQ=255) cAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCca > 1:1166924/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCcaca > 2:771057/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGc < 2:777790/150‑1 (MQ=255) cTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCt < 1:556207/150‑1 (MQ=255) cGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGAc < 1:174591/150‑1 (MQ=255) agagCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGt < 2:1861486/150‑1 (MQ=255) cTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGAGCACTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCaa < 1:1107538/150‑1 (MQ=255) tATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAAt < 2:1006526/150‑1 (MQ=255) aTCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAAtc < 1:771057/150‑1 (MQ=255) aTCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAAtc > 1:1414289/1‑150 (MQ=255) tCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAAtct > 2:1591771/1‑150 (MQ=255) tCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGGTTGCAGGGGAGCCATGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCAACAGCCTGACGTGCAAtct > 1:1018712/1‑150 (MQ=255) cACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCaa < 2:399374/150‑1 (MQ=255) gCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTg < 1:616564/150‑1 (MQ=255) gCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCaa < 2:394933/141‑1 (MQ=255) gCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCaa > 1:394933/1‑141 (MQ=255) tctAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTc < 2:1158365/150‑1 (MQ=255) aGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAgg < 2:1173132/150‑1 (MQ=255) aGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAgg > 1:1414320/1‑150 (MQ=255) gCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTTCCCTGTGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGt < 1:338922/150‑1 (MQ=255) gCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGt > 1:565178/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCtt > 2:195141/1‑104 (MQ=255) cAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCtt < 1:195141/104‑1 (MQ=255) cGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTcc > 2:1144365/1‑150 (MQ=255) gCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGAc < 2:565178/150‑1 (MQ=255) cATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCg > 1:522480/1‑150 (MQ=255) cGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTa < 1:1274474/150‑1 (MQ=255) cccAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTAcc > 2:1498371/1‑150 (MQ=255) ccAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCa > 2:505251/1‑150 (MQ=255) ccAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCa > 2:1300482/1‑150 (MQ=255) agCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAActct < 1:1300482/150‑1 (MQ=255) agCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAActct < 2:1029298/150‑1 (MQ=255) gTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGACGTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGc > 2:1911255/1‑150 (MQ=255) tttGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACTGCCGTTGcg > 1:1906112/1‑67 (MQ=255) tttGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACTGCCGTTGcg < 2:1906112/68‑2 (MQ=255) tttGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCa < 1:1665313/150‑1 (MQ=255) gAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCg < 2:1747871/132‑1 (MQ=255) gAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCg > 1:1747871/1‑132 (MQ=255) aGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCa < 1:1498371/150‑1 (MQ=255) ggggAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAg > 1:1057139/1‑150 (MQ=255) gggAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGc > 1:32754/1‑150 (MQ=255) gAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACTGCCGTTGcgaa < 2:988364/61‑4 (MQ=255) gAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACTGCCGTTGcgaa > 1:988364/1‑58 (MQ=255) gAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCcaca > 1:1033770/1‑80 (MQ=255) gAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCcaca < 2:1033770/80‑1 (MQ=255) ttGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGa > 1:923526/1‑81 (MQ=255) ttGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGa < 2:923526/81‑1 (MQ=255) gCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGa > 2:692392/1‑150 (MQ=255) tGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAg > 2:1418482/1‑99 (MQ=255) tGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAg < 1:1418482/99‑1 (MQ=255) tCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAAcc > 1:1170674/1‑150 (MQ=255) gcgcGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAAccgctgcccgct > 2:1931169/1‑150 (MQ=255) gcgcGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAAccg > 2:1078147/1‑141 (MQ=255) gcgcGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAAccg < 1:1078147/141‑1 (MQ=255) gAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGCCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCtt < 1:1591771/150‑1 (MQ=255) cTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTAc > 2:20749/1‑90 (MQ=255) cTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTaa > 2:1356081/1‑150 (MQ=255) cTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTaa < 2:1170674/150‑1 (MQ=255) cTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCAACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTaa < 2:1018712/150‑1 (MQ=255) cTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCGTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTAc < 1:20749/90‑1 (MQ=255) ttCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTAAc > 1:146332/1‑150 (MQ=255) cGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTAACAg < 2:522480/150‑1 (MQ=255) gCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCtt < 1:1288105/143‑1 (MQ=255) gCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCtt > 2:1288105/1‑143 (MQ=255) gCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTAACAgg > 2:1261952/1‑150 (MQ=255) cAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTAACAGGt < 1:1911255/150‑1 (MQ=255) aaCGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTATGACAGGTCGGACAGATCACGTTCAACAGCTGCCCGCTGCTTTAAGAGGTc > 1:1087602/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTAACAGGTCGaa < 1:1144365/150‑1 (MQ=255) gCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTAACAGGTCGAAg < 1:1356081/150‑1 (MQ=255) | AACAACGCAAGCCTTTCACGCAGGCCAACGCCTGCGAGAGCTATCGCACCTGCAGGCTCTAGCAAAGCGTTGCCATCGCCCAAGAGCGTTTGAAGGGGAGCCTTGTAAGCTGCAATCTGCTCCGGGTTCAGCGCGAGCTTCGCAACGGCAGTTGCTACCTGCCCTTGGAACGCCACAGCCTGACGTGCAATCTCAAGCTTGGTCTTCAGGTCACTCCAGACCGGTACCAACTCTCGCAGGTCAGCCAGGTCGGACAGATCACGTTCAACCGCTGCCCGCTGCTTTAACAGGTCGAAG > NC_002947/4203765‑4204061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |