| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,240,286 | T→G | 7.2% | R16S (AGA→AGC) | PP_3717 ← | LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,240,286 | 0 | T | G | 7.2% | 197.6 / 6.5 | 69 | R16S (AGA→AGC) | PP_3717 | LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/28); new base G (2/3); total (38/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.22e-01 | |||||||||||
AACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGTGATGATC > NC_002947/4240137‑4240435 | aaCTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGt < 1:203488/150‑1 (MQ=255) ggCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAg < 2:1080292/150‑1 (MQ=255) gCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGc > 2:1780815/1‑150 (MQ=255) cGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCt > 2:561940/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCTGCAGTCTAGCCTGCCa < 1:1246021/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCTGGCAGGCTAGACTGccgg < 2:276536/150‑3 (MQ=255) gCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGAAGCGCGCCCATTGCGAGGCTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAg < 1:237581/150‑1 (MQ=255) aGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGc < 1:1780815/150‑1 (MQ=255) cGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGAGGTAAGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAgatcg > 1:990964/1‑146 (MQ=255) cacaTACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGccc < 1:1178958/150‑1 (MQ=255) acaTACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCcg > 2:888152/1‑150 (MQ=255) tcagccAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCgcgc > 1:1542936/5‑150 (MQ=255) tCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGcaca < 1:1580471/150‑1 (MQ=255) 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cccgcttaccctcacaatGGGCGCGCTGCAGCAGTGGCACGTGGC‑‑‑GTTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCa < 1:258868‑M1/132‑1 (MQ=255) aCCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCAt > 2:1054698/1‑150 (MQ=255) tcacaatgggcgcgctgcagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGc < 2:258868‑M2/102‑1 (MQ=255) GCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCTGGCAGGCTAGACTGCCGggcatga > 2:1941586‑M1/1‑103 (MQ=255) GCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCTGGCAGGCTAGACTGCCGggcatga < 1:1941586‑M1/106‑4 (MQ=255) CAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAgc > 2:1516383‑M1/1‑150 (MQ=255) cagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAgc > 1:1625383‑M2/32‑150 (MQ=255) c‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGcc < 2:1329815/150‑1 (MQ=255) ccACGTGCCACTGTTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGt > 1:15095/1‑150 (MQ=255) ccACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCCCACAAACTTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGCACAGGCCAAGCGCCGt < 1:1901249/150‑1 (MQ=255) aCGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTg < 1:1561968/130‑1 (MQ=255) aCGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTg > 2:1561968/1‑130 (MQ=255) gCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTc > 2:761727/1‑150 (MQ=255) aCTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcg > 1:672530/1‑150 (MQ=255) aCTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcg > 1:1115718/1‑150 (MQ=255) ctgcAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcgcgcg < 1:761727/150‑1 (MQ=255) gcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGt > 2:476643‑M2/12‑150 (MQ=255) gcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCaa < 1:1054698‑M2/144‑1 (MQ=255) gcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCaa < 1:1396099‑M2/144‑1 (MQ=255) ccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGGGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAatgat > 1:1724341‑M2/3‑150 (MQ=255) ccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAat < 2:1704604‑M2/145‑1 (MQ=255) ccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAat > 1:1704604‑M2/3‑147 (MQ=255) cATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGTGCCAGGTTCATCGGCCTTg < 1:1034515‑M2/106‑1 (MQ=255) cATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGTGCCAGGTTCATCGGCCTTg > 2:1034515‑M2/2‑107 (MQ=255) aTTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGc > 1:1211834/1‑150 (MQ=255) ttGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCa > 1:1145190/1‑150 (MQ=255) tgtgAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGGGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCAc < 2:1724341/150‑1 (MQ=255) tgtgAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCAc > 1:135203/1‑150 (MQ=255) gtgAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACt > 2:757227/1‑150 (MQ=255) tgAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTg < 2:1625383/150‑1 (MQ=255) gTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCa > 2:656102/1‑150 (MQ=255) gTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCa > 1:349212/1‑150 (MQ=255) tAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAg < 2:187644/150‑1 (MQ=255) gggTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGtctc < 1:888152/150‑1 (MQ=255) gggAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCTACGAtc < 1:476643/150‑1 (MQ=255) gagaGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGAtctc > 1:327096/1‑150 (MQ=255) agGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTg < 2:868836/126‑1 (MQ=255) agGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTg > 1:868836/1‑126 (MQ=255) gCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGAtc < 2:868945/143‑1 (MQ=255) gCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGAtc > 1:868945/1‑143 (MQ=255) gggTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTg > 1:742301/1‑150 (MQ=255) tCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCaa > 1:796906/1‑107 (MQ=255) tCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCaa < 2:796906/107‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATgg > 2:184384/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATgg < 1:561940/150‑1 (MQ=255) cccGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATggg > 2:1010639/1‑150 (MQ=255) ctggCAGGCTAGACTGCCGGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcgcgcg < 2:1918634/92‑1 (MQ=255) ctggCAGGCTAGACTGCCGGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcgcgcg > 1:1918634/3‑94 (MQ=255) ccGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGt > 2:938945/1‑150 (MQ=255) ggCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAatga > 2:1897874/1‑102 (MQ=255) ggCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAatga < 1:1897874/102‑1 (MQ=255) gCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGtgat < 2:135203/150‑1 (MQ=255) tCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGTGATGATc > 2:325545/1‑150 (MQ=255) tCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCACTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACt < 2:126134/103‑1 (MQ=255) tCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCACTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACt > 1:126134/1‑103 (MQ=255) | AACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGCACTGGCGCAGGGTCTCGACGATCTCGTCCACCTGCGCATGGGTGATGATC > NC_002947/4240137‑4240435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |