| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,248,948 | C→G | 5.6% | G375R (GGC→CGC) ‡ | PP_3724 ← | acyl‑CoA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,248,948 | 0 | C | G | 5.6% | 393.8 / 10.0 | 124 | G375R (GGC→CGC) ‡ | PP_3724 | acyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (56/60); new base G (3/4); total (59/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
AGGCAACAGTTCCGGGAAAGCCGAGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCACCTGCCCTTGCTCGAGCTTCG > NC_002947/4248802‑4249097 | aggcaACAGTTCCGGGAAAGCCGAGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCcgc < 2:1694886/150‑1 (MQ=255) aGTTCCGGGAAAGCCGAGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGcgccg > 2:1307516/1‑150 (MQ=255) aGTTCCGGGAAAGCCGAGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTCGCGTTCGCCGGACATCGCCGCCGCGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCATcgcct < 2:1529715/150‑2 (MQ=255) ttCCGGGAAAGCCGAGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGcgcc < 1:225349/147‑1 (MQ=255) ttCCGGGAAAGCCGAGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGGAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGcgcc > 2:225349/1‑147 (MQ=255) ccGGGAAAGCCGAGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCa < 1:748102/150‑1 (MQ=255) ggAAAGCCGAGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGCTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAggg > 2:1434023/1‑150 (MQ=255) aGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGGGCgcggcgat > 1:1323370/1‑131 (MQ=255) aGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGGGCgcggcgat < 2:1323370/133‑3 (MQ=255) aGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGa < 2:41196/150‑1 (MQ=255) gACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCAt > 1:1210079/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCg > 2:513793/1‑150 (MQ=255) aGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGtt < 1:1029289/150‑1 (MQ=255) gCCGATCTTGCCGTGGGGTTCAACGGGATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTg > 1:263409/1‑150 (MQ=255) gCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCACCCGCTTTGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTg > 2:645999/1‑150 (MQ=255) gCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCTGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCCGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGggcggg < 2:605826/150‑2 (MQ=255) gCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAgg < 2:1621743/145‑1 (MQ=255) gCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAgg > 1:1621743/1‑145 (MQ=255) gCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGggcggc < 1:1451912/150‑1 (MQ=255) ccGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCt > 1:678820/1‑150 (MQ=255) ccGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCt > 1:1618432/1‑150 (MQ=255) cGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGgcgc < 1:1188035/111‑1 (MQ=255) tGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCa > 1:366641/1‑150 (MQ=255) tGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCa > 1:1895974/1‑150 (MQ=255) gTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGc > 1:949484/1‑150 (MQ=255) gTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGc > 1:985587/1‑150 (MQ=255) gTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGc < 1:1292647/150‑1 (MQ=255) gTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCACCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGc > 1:628017/1‑150 (MQ=255) ttCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGcc < 2:1210079/150‑1 (MQ=255) cGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGa < 2:231484/150‑1 (MQ=255) cATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATgg < 1:1068176/150‑1 (MQ=255) aTCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCa > 2:871505/1‑116 (MQ=255) aTCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCa < 1:871505/116‑1 (MQ=255) tCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGgtg > 2:1626799/1‑105 (MQ=255) tCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGgtg < 1:1626799/105‑1 (MQ=255) gCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAgt < 2:1491153/150‑1 (MQ=255) cAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAgtg < 2:1737958/150‑1 (MQ=255) cAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAgtg < 2:1618432/150‑1 (MQ=255) tACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAgtggtg > 2:941452/1‑150 (MQ=255) tACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAgtggtg > 1:680176/1‑150 (MQ=255) tACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAgtggtg > 2:1144026/1‑150 (MQ=255) aGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAg > 2:1199039/1‑150 (MQ=255) ccccAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAgtggtg > 1:615374/1‑145 (MQ=255) ccccAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAgtggtg < 2:615374/145‑1 (MQ=255) ccccAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTc > 1:1713477/1‑150 (MQ=255) cagcagcagGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATc < 2:1671225/123‑1 (MQ=255) agcagcagGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGt < 2:678820/150‑1 (MQ=255) cagcagCTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTgg < 1:1434023/150‑1 (MQ=255) gcagGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGt < 1:1292273/150‑1 (MQ=255) gcagGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGt > 1:2633/1‑150 (MQ=255) gTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTg < 1:1390419/143‑1 (MQ=255) cGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGt > 2:1452050/1‑140 (MQ=255) cGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGt < 1:1452050/140‑1 (MQ=255) gCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAg > 1:1119461/1‑150 (MQ=255) gCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCACCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAg > 2:386301/1‑150 (MQ=255) cATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGccc > 2:1443569/1‑114 (MQ=255) cATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGccc < 1:1443569/114‑1 (MQ=255) tCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTg < 1:1144026/150‑1 (MQ=255) cTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGaa > 1:1779935/1‑126 (MQ=255) cTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGc < 2:1895974/150‑1 (MQ=255) ttGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGcccc < 2:1289923/109‑1 (MQ=255) ttGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGcccc > 1:1289923/1‑109 (MQ=255) ttGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTAGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCa > 2:140836/1‑150 (MQ=255) gTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATgg > 2:1799651/1‑111 (MQ=255) gTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATgg < 1:1799651/111‑1 (MQ=255) tCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGccc < 2:1119461/150‑1 (MQ=255) gCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTc > 2:307350/1‑93 (MQ=255) gCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTc < 1:307350/93‑1 (MQ=255) gCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCgg > 1:1045117/1‑150 (MQ=255) ccGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGGGCgcggcga > 1:732171/1‑51 (MQ=255) ccGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGGGCgcggcga < 2:732171/52‑2 (MQ=255) cGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGGGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCa > 1:1860035/1‑150 (MQ=255) ggTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCa > 1:1205574/1‑119 (MQ=255) ggTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCa < 2:1205574/119‑1 (MQ=255) cgccgcCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTc < 2:1110468/150‑1 (MQ=255) cgccgcCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGGTGTCGATCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGGCTAGGTTGGCATAGCCCCGCCACACCTc > 2:330322/1‑150 (MQ=255) cgcggGGTAGACCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCGCAGGGTTGTGTTGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTCGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGc < 2:53198/150‑1 (MQ=255) ccgGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTGCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGCGCAGGTTGGAACAGCCCGGCAACACCTCGGCCa > 1:1556050/1‑150 (MQ=255) ggTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCATGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTg > 2:1594060/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCTCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTgccgc < 1:1420402/150‑1 (MQ=255) tCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCg > 2:1487511/1‑138 (MQ=255) tCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCACCAGATGGCAGTTTTGAATTCCAGTGGGGTGAACAGGTTGGCATAGCCCGGCAAAACCTCGACCAGTgccgcc > 1:1406008/1‑150 (MQ=255) ccagcaccagcaTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCa > 1:879431/1‑150 (MQ=255) cagcaccagcaTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCAc > 1:1897342/1‑150 (MQ=255) cagcaccagcaTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCAc > 2:1127111/1‑150 (MQ=255) accagcaTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCATGGCGGCTGCATAGCACCAGATGTCAGTGTTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGTCCAGTGCCGCCACCTGc < 2:263409/150‑1 (MQ=255) accagcaTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTggg < 2:665327/99‑1 (MQ=255) cagcaTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCACCTGccc > 1:878250/1‑150 (MQ=255) cagcaTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCACCTGccc > 2:1221356/1‑150 (MQ=255) gcaTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGc < 1:204204/119‑1 (MQ=255) gcaTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCACCTGCCCtt > 1:1831078/1‑150 (MQ=255) caTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAg < 2:1931753/51‑1 (MQ=255) caTCGCCCCGCCCGCGGCGCGGCTCAGGGCGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGGTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCACCTGCCCTTg > 2:1445444/1‑150 (MQ=255) aTCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCACCTGCCCTTGc < 1:513793/150‑1 (MQ=255) gcgccgcGGGCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTgg < 2:667679/104‑1 (MQ=255) gcgccgcGGGCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTgg > 1:667679/2‑105 (MQ=255) cgccgcGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCACCTGCCCTTGCTc < 2:1831078/150‑1 (MQ=255) cgccgcGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCAGACAACACCTCGGCCAGTGCCGCCACCTGCCCTTGCTc < 1:941452/150‑1 (MQ=255) cccGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCTTCCAGTGCCGCCACCTGCCCTTGCTCGAGCTTc < 1:645999/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCACCAAATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCACCTGCCCTTGCTCGAGCTTCg < 1:319926/150‑1 (MQ=255) | AGGCAACAGTTCCGGGAAAGCCGAGGTGACGAAGCCGATCTTGCCGTGGCGTTCAACGGCATCGCAGTACAGCCCCAGCAGCAGGTCGCATTCCTTGCGTTCGCCGGTAAACGCCGCCGGGTAGTCCAGCACCAGCATCGCCGCGCCCGCGGCGCCGCTCAGGGTGTTGTCGAGCATGCGTTGCAGGGCGGCTTCATCGCCCCAGATGGCAGTGGTGAAGTCCAGTGGGTTGACCAGGTTGGCATAGCCCGGCAACACCTCGGCCAGTGCCGCCACCTGCCCTTGCTCGAGCTTCG > NC_002947/4248802‑4249097 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |