| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,293,265 | T→C | 5.8% | intergenic (+37/+33) | PP_3762 → / ← PP_3763 | two‑component system response regulator/precorrin‑6A synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,293,265 | 0 | T | C | 5.8% | 200.9 / 2.2 | 69 | intergenic (+37/+33) | PP_3762/PP_3763 | two‑component system response regulator/precorrin‑6A synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/26); new base C (2/2); total (41/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
CAGCGGCTACGCCGACAGTTTCAATGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGCCTGCAACGGCCCGGCAATCAGCAC > NC_002947/4293117‑4293414 | cAGCGGCTACGCCGACAGTTTCAATGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTg > 1:594763/1‑150 (MQ=255) aGCGGCTACGCCGACAGTTTCAATGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGc > 2:1411544/1‑150 (MQ=255) gCGGCTACGCCGACAGTTTCAATGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGcc > 2:1645609/1‑150 (MQ=255) gCCGACAGTTTCAATGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAaga < 2:1345891/150‑1 (MQ=255) tttCAATGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCACGCCcgcgcctacga > 1:46553/1‑138 (MQ=255) tttCAATGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCACGCCcgcgcctacga < 2:46553/145‑8 (MQ=255) cAATGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAg < 2:1048094/150‑1 (MQ=255) aaTGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAgg > 1:1395108/1‑150 (MQ=255) aaTGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAgg < 1:1411544/150‑1 (MQ=255) ccGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAAccc < 1:151589/150‑1 (MQ=255) gCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGct > 1:1487610/1‑150 (MQ=255) ttGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGctctct > 2:178666/1‑150 (MQ=255) ttGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACACGCAACCCACCTCATAGctctct > 1:428662/1‑150 (MQ=255) gATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTgc > 2:482875/1‑150 (MQ=255) ggCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCgcag > 1:1439965/1‑150 (MQ=255) gCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCgcagc > 2:1436844/1‑150 (MQ=255) gCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCgcagc < 2:1499913/150‑1 (MQ=255) cAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCgcagca < 2:1487610/150‑1 (MQ=255) aGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGTCGCTGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGa > 2:710347/1‑150 (MQ=255) cGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAg < 1:482875/150‑1 (MQ=255) cGTTCAGCATCCACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAg < 2:594763/150‑1 (MQ=255) gCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATcc > 1:63553/1‑150 (MQ=255) tCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACAAATTGCGAAGGGACGCGCCTGTTTCGCGCGGAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATg > 1:529460/1‑150 (MQ=255) gACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGa > 1:1242894/1‑99 (MQ=255) gACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGa < 2:1242894/99‑1 (MQ=255) gACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGAt > 2:710407/1‑150 (MQ=255) gACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGAt > 1:707313/1‑150 (MQ=255) gTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGctct < 1:1319020/119‑1 (MQ=255) gTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGctct > 2:1319020/1‑119 (MQ=255) gTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCAcc > 1:54693/1‑150 (MQ=255) cGGGACACGGTGGTGGGTATACTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGAGAAGAGGCCGACACAGGCAACCGACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCtt > 2:695147/1‑150 (MQ=255) gggACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCAccc < 2:1820304/146‑1 (MQ=255) gggACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCAccc > 1:1820304/1‑146 (MQ=255) gACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTAcg > 2:865292/1‑150 (MQ=255) cGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGcc < 2:707313/150‑1 (MQ=255) gtggtgGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGcccg > 1:966318/1‑150 (MQ=255) tggtggGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCaa < 2:1620091/89‑1 (MQ=255) tggtggGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCaa > 1:1620091/1‑89 (MQ=255) tggtggGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGcccgc < 2:63553/150‑1 (MQ=255) gtggGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGcccgctc > 1:1687279/1‑150 (MQ=255) ggTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTCACGCGcccgctcccg > 2:1732153/1‑150 (MQ=255) ttCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTcg > 1:1190896/1‑150 (MQ=255) tGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTTTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGAt < 2:1232167/119‑1 (MQ=255) tGGGTACCCCTTGAGCACGGCCACGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGAt > 1:1232167/1‑119 (MQ=255) ggTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTgcgc < 1:1737940/97‑1 (MQ=255) ggTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTgcgc > 2:1737940/1‑97 (MQ=255) cccTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTAt > 2:1041436/1‑105 (MQ=255) cccTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTAt < 1:1041436/105‑1 (MQ=255) cccTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCa < 1:178666/150‑1 (MQ=255) cccTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCa < 2:1190896/150‑1 (MQ=255) ccTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCGCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAg < 2:1395108/150‑1 (MQ=255) gCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTg > 2:769177/1‑150 (MQ=255) aCGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGa < 1:362264/102‑1 (MQ=255) aCGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGa > 2:362264/1‑102 (MQ=255) ggCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGcc < 2:54693/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCa < 1:1436844/150‑1 (MQ=255) cgcCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTCACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCAc < 1:1732153/150‑1 (MQ=255) gcCTGTTTCGCTCGTAGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCAACCGCTTATGCGCCCGCGCCCGTTTGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCAcc > 2:425125/1‑150 (MQ=255) cTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGc > 2:1464919/1‑150 (MQ=255) gTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGCCt > 2:634513/1‑150 (MQ=255) gTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTCCAACGCCt < 2:966318/150‑1 (MQ=255) cTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGCCTGCAACg > 1:306890/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTGTCTGCTCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGCCTGCAACgg > 2:1719167/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGCCTGCAACgg > 2:1446090/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGCCTGCAACgg > 1:1073556/1‑150 (MQ=255) ttcgcgGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGctctct > 2:230696/3‑55 (MQ=255) ttcgcgGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGctctct < 1:230696/53‑1 (MQ=255) ttcgcgGGCACGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGCCTGCAACGGccc > 2:1512948/3‑148 (MQ=255) ttcgcgGGCACGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGCCTGCAACGGccc < 1:1512948/146‑1 (MQ=255) tGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGCCTGCAACGGCCCGGCAATCAGCAc < 1:710407/150‑1 (MQ=255) | CAGCGGCTACGCCGACAGTTTCAATGTGCCGGAGGGCATGCACTTGATCGGCAAGCCGTTCAGCATCGACCAGTTGCGGGACACGGTGGTGGGTATTCTGGGTACCCCTTGAGCACGGCCGCGCCTGTTTCGCTCGTAGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGACACAGGCAACCCACCTCACAGCTCTCTGCGCAGCAGATAGGTATCCATGATCCACCCCTTACGCGCCCGCTCCCGCTCGCGCACTTCCAGTATCTGCGCCTTCACCGCCTGCAACGGCCCGGCAATCAGCAC > NC_002947/4293117‑4293414 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |