| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,484,207 | C→A | 5.8% | T165N (ACC→AAC) | PP_3976 → | isochorismatase family hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,484,207 | 0 | C | A | 5.8% | 251.8 / 2.3 | 80 | T165N (ACC→AAC) | PP_3976 | isochorismatase family hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/37); new base A (2/3); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
AGAGGTCTGCAACACCACCTTCGCGCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTACGCCTATACCATGGTGCACAAAGCGCCAGAGC > NC_002947/4484058‑4484353 | agagGTCTGCAACACCACCTTCGCGCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTAc < 1:712132/150‑1 (MQ=255)agagGTCTGCAACACCACCTTCGCGCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTAc > 1:269106/1‑150 (MQ=255) tGCAACACCACCTTCGCGCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGgcag > 2:191652/1‑150 (MQ=255) gCAACACCACCTTCGCGCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGgcagc > 2:238965/1‑150 (MQ=255) cAACACCACCTTCGCGCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGCTGCCAGGTAACTGgcacca < 1:901586/150‑1 (MQ=255) aaCACCACCTTCGCGCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGcagcag < 2:1509610/150‑1 (MQ=255) ccaccTTCGCGCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGc > 1:707515/1‑150 (MQ=255) cTTCGCGCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACt < 2:269106/150‑1 (MQ=255) cgcgCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGa < 2:707515/150‑1 (MQ=255) cgcTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGt > 2:337084/1‑150 (MQ=255) cgcTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGt > 2:139705/1‑150 (MQ=255) gcTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTg > 1:1769074/1‑150 (MQ=255) tCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAg > 2:1925604/1‑150 (MQ=255) ccATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGcgcg > 1:248356/1‑150 (MQ=255) cACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGt > 1:578167/1‑136 (MQ=255) cACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGt < 2:578167/136‑1 (MQ=255) aCGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTg < 2:943376/125‑1 (MQ=255) aCGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTg > 1:943376/1‑125 (MQ=255) tGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGaaaaa < 2:1769074/150‑1 (MQ=255) cAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCGGCAGGTGATACTGGAGTGGCAGAGCGACTGGAAAAAcc > 2:371289/1‑150 (MQ=255) aGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACcg > 1:1767364/1‑150 (MQ=255) aGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACcg > 1:232389/1‑150 (MQ=255) aGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACcg < 2:232389/150‑1 (MQ=255) gCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCAAGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGGGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACcgcg > 1:1711859/1‑150 (MQ=255) aTCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTAc < 1:618029/150‑1 (MQ=255) atatGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATg > 2:1242604/1‑150 (MQ=255) atatGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATg > 2:1754933/1‑150 (MQ=255) atGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTCAGCTATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCt < 1:1573427/150‑1 (MQ=255) tGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTg > 1:183355/1‑150 (MQ=255) gACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGAATACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGAGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGAGCGAATCGAAAAAACGCGACACCTACGATGCTGTCATGgcg > 2:1852473/1‑150 (MQ=255) cTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGTAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTgg < 1:1568948/150‑1 (MQ=255) cTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTgg < 1:1925604/150‑1 (MQ=255) ttCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTg < 2:1125744/148‑1 (MQ=255) ttCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTg > 1:1125744/1‑148 (MQ=255) ttCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGt > 1:546353/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGGGCACGACAAAAGAGGATCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACCGGCGTGCGAGCCCTACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGt < 2:759542/150‑1 (MQ=255) ccGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCa > 2:1353474/1‑150 (MQ=255) gggggCACGACCAAGGAGGCTAAAGACAACGCGAAGGAGCGCAGTAGGCAGGCGGGGGTGGGGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCaaa < 2:211964/150‑1 (MQ=255) gggCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAaga < 1:1310503/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATTATCCAGGCGGGCGTGGGGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGc < 2:459080/150‑1 (MQ=255) aCGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCAt > 1:552381/1‑150 (MQ=255) aCGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTCCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCGACTGGATTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCAt > 1:1691119/1‑150 (MQ=255) gACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTg > 1:15075/1‑76 (MQ=255) gACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTg < 2:15075/76‑1 (MQ=255) gACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGAGTGGTAAAACCGCGGCACATATGATGCTGTCATGGCGCTGGTAAAAGAGCATTc > 2:543985/1‑150 (MQ=255) gACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTc > 1:696480/1‑150 (MQ=255) gACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGCGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCCACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTc < 1:1852473/150‑1 (MQ=255) aaGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGgc < 2:1570660/150‑1 (MQ=255) aaGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGgc < 2:1767364/150‑1 (MQ=255) gCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTAc < 1:371289/150‑1 (MQ=255) tCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCt > 2:1352423/1‑112 (MQ=255) tCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCt < 1:1352423/112‑1 (MQ=255) tCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACgg > 2:439758/1‑150 (MQ=255) cACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGc < 1:1353474/150‑1 (MQ=255) aCTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATgg < 1:1242604/150‑1 (MQ=255) tACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGc > 2:739450/1‑150 (MQ=255) cATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGTCGCCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGa < 2:469527/150‑1 (MQ=255) cATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTgg < 1:677655/113‑1 (MQ=255) cATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTgg > 2:677655/1‑113 (MQ=255) cATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGa > 2:435125/1‑150 (MQ=255) cATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGa > 1:1166940/1‑150 (MQ=255) aTGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTg > 2:1545492/1‑74 (MQ=255) aTGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTg < 1:1545492/74‑1 (MQ=255) cAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTAc < 1:439758/150‑1 (MQ=255) cAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTAc < 1:1754933/150‑1 (MQ=255) aGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCaaa > 2:1688274/1‑113 (MQ=255) aGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCaaa < 1:1688274/113‑1 (MQ=255) gcgcAGGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATCGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCACCTACGGCATGGGCGTCGACTACGc < 1:446467/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTCCCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAANAGCATTCGGNCGCCTACGNGATGGGCGTCGACTACGCCTATACCATg < 1:543985/150‑1 (MQ=255) gcgggcgTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTTGACTACGCCTATACCATGGTg < 1:238965/150‑1 (MQ=255) acctgctgCCAGGTAACTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTACGCCTATACCATGGTGcaca > 1:942538/7‑150 (MQ=255) tgctgCCAGGTAACTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTc > 1:706825/4‑122 (MQ=255) tgctgCCAGGTAACTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTc < 2:706825/119‑1 (MQ=255) gctgCCAGGTAACTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTACGCCTATACCATGGTGCACAAAgc < 2:942538/148‑1 (MQ=255) tgCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGCAAACCCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTACGCCTATACCATGGTGCACAAAgcgc < 2:52291/150‑1 (MQ=255) gCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTACGCCTATACCATGGTGCACAAAGCGcc < 1:139705/150‑1 (MQ=255) aGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTACGCCTATACCATGGTGCACAAAGCGCCaga > 2:1138605/1‑150 (MQ=255) aGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATAAGCCTCGACTACGCCTATACCATGGTGCACAAAGCGCCaga > 1:990997/1‑150 (MQ=255) gTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAag > 1:1310243/1‑85 (MQ=255) gTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAag < 2:1310243/85‑1 (MQ=255) ttACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTACGCCTATACCATGGTGCACAAAGCGCCAGAgc > 1:423775/1‑150 (MQ=255) ttACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGATACGTTTTTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTACGCCTATACCATGGTGCACAAAGCGCCAGAgc < 1:337084/150‑1 (MQ=255) | AGAGGTCTGCAACACCACCTTCGCGCTGTCCGCCATGCACGATGCAGGCTATGAGATCTATATGGTTGCCGACGCTTCCGGGGGCACGACCAAGGAGGCTCACGACTACGCCATGCAGCGCATGATCCAGGCGGGCGTGGTGCCAGTTACCTGGCAGCAGGTGCTACTGGAGTGGCAGCGCGACTGGAAAAACCGCGACACCTACGATGCTGTCATGGCGCTGGTCAAAGAGCATTCGGGCGCCTACGGCATGGGCGTCGACTACGCCTATACCATGGTGCACAAAGCGCCAGAGC > NC_002947/4484058‑4484353 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |