| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 27,581 | C→T | 11.3% | intergenic (‑428/+18) | PP_0022 ← / ← PP_0023 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 27,581 | 0 | C | T | 11.3% | 206.0 / 14.8 | 81 | intergenic (‑428/+18) | PP_0022/PP_0023 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/33); new base T (4/5); total (43/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
TATCAGTCTCGTCGTCCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGATGCTCAT > NC_002947/27432‑27727 | tatCAGTCTCGTCGTCCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTcc > 1:1767567/1‑150 (MQ=255) atCAGTCTCGTCGTCCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTccc > 1:1907987/1‑150 (MQ=255) cgtcCGCACTGAAGGGATAACCGATACGTAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGAGCTGCtt < 1:492957/150‑1 (MQ=255) tcCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGAGCTGCtttt > 2:1239505/1‑150 (MQ=255) tcCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGAGCTGCtt > 2:1580363/1‑148 (MQ=255) tcCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGAGCTGCtt < 1:1580363/148‑1 (MQ=255) gCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCACC‑AAAAAAAAAGAAGATCCCGAGCGCTGCTTTTTTc > 1:1789053/1‑150 (MQ=255) cACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTccc < 1:1300696/133‑1 (MQ=255) cACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTccc > 2:1300696/1‑133 (MQ=255) cTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGAGCTGCTttttttttt < 1:1239505/150‑2 (MQ=255) cTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGAGCTGCTttttttttg < 1:1374763/150‑2 (MQ=255) aaaagATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATAAAGACAACCGGAAGAATCACGACGCGGTCCGATTCATCAACGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCGGCTCCCGAGAGCTGCTTTCTTCTTCCTc < 2:122447/146‑1 (MQ=255) aaGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTc > 2:1725866/1‑150 (MQ=255) gATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTccccc > 1:1528781/1‑150 (MQ=255) ccGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCttttt < 1:1930469/150‑1 (MQ=255) ccGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑‑AAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCtt < 2:1041303/150‑1 (MQ=255) cGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCtt < 1:1514239/150‑1 (MQ=255) gTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTggg > 1:1085480/1‑150 (MQ=255) cTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGttt > 2:850596/1‑150 (MQ=255) ttCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGAGCTGCttt > 1:469810/1‑115 (MQ=255) ttCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGAGCTGCttt < 2:469810/115‑1 (MQ=255) ttCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTc > 2:1117517/1‑150 (MQ=255) aTCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTcc < 2:1907987/150‑1 (MQ=255) aTCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGCCGGCCGCGAGGGCTTCCACGCAGCCAC‑AAAAATAAATGACCTTGTGATGGCTGCTTTGTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGAt > 2:219283/1‑150 (MQ=255) aTCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGAt > 2:1631786/1‑150 (MQ=255) caagcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCtt > 1:710602/1‑150 (MQ=255) caagcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCtt > 1:1920213/1‑150 (MQ=255) aagcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTc > 1:1711640/1‑150 (MQ=255) cGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTtgt < 1:1887468/121‑1 (MQ=255) cGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTtgt > 2:1887468/1‑121 (MQ=255) gAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCtt < 1:1448979/150‑1 (MQ=255) aaGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCa < 1:825571/127‑1 (MQ=255) aaGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCa > 2:825571/1‑127 (MQ=255) tCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTTGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAgg > 2:715830/1‑150 (MQ=255) tCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAgg > 1:344025/1‑150 (MQ=255) tCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAgg > 2:133923/1‑150 (MQ=255) tCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCCTTTCAgg < 2:1528781/150‑1 (MQ=255) cACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTTGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAggg < 1:715830/150‑1 (MQ=255) ggTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCg > 1:418356/1‑150 (MQ=255) tCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTc > 1:937663/1‑110 (MQ=255) tCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTc < 2:937663/110‑1 (MQ=255) gATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGATGCTTTTTTGTTTCTCCCCCTTTTTGTGCTTGCGGGGTTTACGGTGCTGATGTTCTTTCTGCTTTTTTGGGGTGGCTCGCTGcc > 1:1097598/1‑150 (MQ=255) aTTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTAGCTGCCt > 2:624562/1‑150 (MQ=255) tGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCttt < 2:1711640/150‑1 (MQ=255) aTCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTg < 2:1767567/150‑1 (MQ=255) aTCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTg > 2:969808/1‑150 (MQ=255) tCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTgg > 1:1635348/1‑95 (MQ=255) tCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTgg < 2:1635348/95‑1 (MQ=255) tCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGt < 2:710602/150‑1 (MQ=255) aGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTcc > 2:1115206/1‑150 (MQ=255) agaCGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAggg > 1:1726262/1‑125 (MQ=255) agaCGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAggg < 2:1726262/125‑1 (MQ=255) cGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTATCCGGAGTGc < 2:344025/150‑1 (MQ=255) gTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCa < 1:1115206/150‑1 (MQ=255) tCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCAt < 1:133923/150‑1 (MQ=255) gTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCa > 2:1542051/1‑88 (MQ=255) gTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCa < 1:1542051/88‑1 (MQ=255) gTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCt > 1:1474215/1‑150 (MQ=255) gTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCt > 1:793439/1‑150 (MQ=255) tGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCtt > 2:271984/1‑150 (MQ=255) gAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCtttt > 1:204565/1‑132 (MQ=255) gAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCtttt < 2:204565/132‑1 (MQ=255) gAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTc < 1:1300749/150‑1 (MQ=255) gggTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGt < 2:299922/96‑1 (MQ=255) gggTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGt > 1:299922/1‑96 (MQ=255) ggTTTGCACACAGCCCC‑AACAAAAAAACAGCTTACTTTGGCGGCGTGTTGCTTACGACACATTTTTGTGCTTGTGGGATGTAACACGCCCCTGGCCGGTCGGCTTGTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTAAGTATTGTCATCTTCAtt > 1:926091/1‑150 (MQ=255) gTTTGCACACAGCCCCAAAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATg < 1:455313/93‑1 (MQ=255) gTTTGCACACAGCCCCAAAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATg > 2:455313/1‑93 (MQ=255) gTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTg < 1:1631786/150‑1 (MQ=255) gTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTg < 2:1474215/150‑1 (MQ=255) ttGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGt < 1:969808/150‑1 (MQ=255) cccc‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGcc < 2:1522156/128‑1 (MQ=255) cccc‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGcc > 1:1522156/1‑128 (MQ=255) cccc‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTggg > 1:464254/1‑150 (MQ=255) c‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCt < 1:271984/150‑1 (MQ=255) c‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCACATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGCGAGACTAGGCAGCTTTTGGTCGTAGTGCCGTCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCt > 1:1399276/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaaaGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCg < 2:396302/117‑1 (MQ=255) 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aaaaGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTAGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTg < 1:624562/150‑1 (MQ=255) ctctCGGGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGATGCTCAt < 1:381317/150‑1 (MQ=255) tCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGc > 1:1378127/1‑138 (MQ=255) tCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGc < 2:1378127/138‑1 (MQ=255) | TATCAGTCTCGTCGTCCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGATGCTCAT > NC_002947/27432‑27727 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |