| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,844,258 | C→A | 5.8% | T354K (ACG→AAG) | PP_4259 → | iron‑sulfur cluster‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,844,258 | 0 | C | A | 5.8% | 275.3 / 3.1 | 86 | T354K (ACG→AAG) | PP_4259 | iron‑sulfur cluster‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/41); new base A (3/2); total (43/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
CGACAGCATCATGGACAAGATGAACTACCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCACCTCTACGTGCTGGACGC > NC_002947/4844109‑4844405 | cGACAGCATCATGGACAAGATGAACTACCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGAc < 2:1738037/150‑1 (MQ=255) gACAGCATCATGGACAAGATGAACTACCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACg < 2:980370/150‑1 (MQ=255) catcatGGACAAGATGAACTACCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCtt < 1:414793/150‑1 (MQ=255) aCAAGATGAACTACCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑Accc < 1:1298596/150‑1 (MQ=255) aCAAGATGAACTACCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGACGGTTTGGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑Accc < 1:460087/150‑1 (MQ=255) gATGAACTACCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCAACGTATGATTGCCTCACGGGCGGTACTTCGGGGGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTc > 1:717565/1‑150 (MQ=255) tGAACTACCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGc > 2:369994/1‑150 (MQ=255) gAACTACCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCt < 1:9364/150‑1 (MQ=255) aCCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCg < 1:175264/150‑1 (MQ=255) ccAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGtt > 2:1760538/1‑150 (MQ=255) ccAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGtt > 1:499210/1‑150 (MQ=255) gCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGt < 2:1048174/150‑1 (MQ=255) aTCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTc < 2:1454393/128‑1 (MQ=255) aTCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTc > 1:1454393/1‑128 (MQ=255) aTCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGGTGGCGAAGGCCGTCGCC‑Aacccga < 1:1620370/127‑4 (MQ=255) aTCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGGTGGCGAAGGCCGTCGCC‑Aacccga > 2:1620370/1‑124 (MQ=255) aTCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGACGATGCCATTGGGAT‑‑CTATGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGc > 2:542927/1‑150 (MQ=255) tCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCa > 1:605636/1‑150 (MQ=255) cAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCaa < 1:3568/150‑1 (MQ=255) aGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCaaa > 2:1513968/1‑150 (MQ=255) gCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATTGGGTTGGCGACGGCCTTCGc > 2:1783924/1‑115 (MQ=255) gCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATTGGGTTGGCGACGGCCTTCGc < 1:1783924/115‑1 (MQ=255) gCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTTGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAg > 2:881271/1‑150 (MQ=255) caccacCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACcg < 1:430067/150‑1 (MQ=255) caccacCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACcg < 2:605636/150‑1 (MQ=255) caccGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTc > 1:1343595/1‑106 (MQ=255) caccGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTc < 2:1343595/106‑1 (MQ=255) caccGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCgt > 1:1383613/1‑150 (MQ=255) caccGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCACCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCgt > 2:1403423/1‑150 (MQ=255) ccacccacaACCCGTCCGAGCACATGACCCACATGCTTCCCCCCCGTATGATCAGCTATCCCGTGGTACTGCTGGTTATGATG‑‑ATCGGGTTTACGACGGCCTTCTCC‑ACCCGTTCGCTCCTCTGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCgtgt < 2:793274/145‑1 (MQ=255) ccGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCgtgt > 2:571216/1‑150 (MQ=255) aaCCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACcgc > 1:1464512/1‑150 (MQ=255) cTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGAc > 2:892517/1‑86 (MQ=255) cTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGAc < 1:892517/86‑1 (MQ=255) cTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGtgtt < 1:1252207/140‑1 (MQ=255) cTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGtgtt > 2:1252207/1‑140 (MQ=255) cTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGaa > 2:1694199/1‑150 (MQ=255) gggCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGAAGTACGCAAACTCCGAGTGTTGTACCCCGAAAACGcc > 1:336317/1‑150 (MQ=255) ggCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGccc > 1:480882/1‑150 (MQ=255) gaagaCCCATATGCTGCGCCCCCCTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAggg < 2:112764/150‑1 (MQ=255) aCCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCgg > 2:819647/1‑150 (MQ=255) ccACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACcgc < 2:704535/118‑1 (MQ=255) ccACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACcgc > 1:704535/1‑118 (MQ=255) ccACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGAt > 1:866518/1‑150 (MQ=255) ccACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGAt < 2:1021473/150‑1 (MQ=255) ccACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGAt > 1:1021473/1‑150 (MQ=255) ccACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGAt > 1:557776/1‑150 (MQ=255) acaTGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAg < 1:956652/106‑1 (MQ=255) acaTGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAg > 2:956652/1‑106 (MQ=255) aTGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCgag < 2:1464512/150‑1 (MQ=255) cccccGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTa < 1:369994/150‑1 (MQ=255) cccGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCTGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACa > 1:1252610/1‑150 (MQ=255) ccGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATc < 1:1076005/136‑1 (MQ=255) ccGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATc > 2:1076005/1‑136 (MQ=255) ccGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAg > 2:842592/1‑150 (MQ=255) tCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGAc < 1:1546326/85‑1 (MQ=255) tCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGAc > 2:1546326/1‑85 (MQ=255) gATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCgtg < 2:537415/100‑1 (MQ=255) gATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCgtg > 1:537415/1‑100 (MQ=255) gATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGaa > 2:230905/1‑150 (MQ=255) aTCTGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAg > 1:144258/1‑150 (MQ=255) aTCGGCTATGCTGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAg < 1:1561533/150‑1 (MQ=255) aTCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAg < 1:842592/150‑1 (MQ=255) aTCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAg < 2:499210/150‑1 (MQ=255) aTCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAg > 2:1620150/1‑150 (MQ=255) cGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGt < 1:1620150/150‑1 (MQ=255) tATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATg < 2:557776/150‑1 (MQ=255) tGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGaa < 1:819647/150‑1 (MQ=255) tGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGaa < 1:1760538/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAAc < 2:669092/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACa > 2:367289/1‑150 (MQ=255) cGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATATTGGGCTTTTACAGCCTGAAGGTAATGAACaa < 1:542927/150‑1 (MQ=255) tGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAgg > 2:1794243/1‑150 (MQ=255) aCTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCa < 2:1013135/150‑1 (MQ=255) gTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGtgtt > 2:1567756/1‑77 (MQ=255) gTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGtgtt < 1:1567756/77‑1 (MQ=255) gTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGAt < 2:144258/150‑1 (MQ=255) gTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGAGTCGGGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGAt > 1:1667892/1‑150 (MQ=255) gatgatg‑‑atCGGGGTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTAGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCa > 2:1350954/1‑150 (MQ=255) gatg‑‑atCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCACct > 2:1186844/1‑150 (MQ=255) tg‑‑atCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGcc > 1:1060801/1‑86 (MQ=255) tg‑‑atCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGcc < 2:1060801/86‑1 (MQ=255) gggtGGCGAAGGCCGTCGCCAACCCGATCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCACCTCTAc < 2:1428155/144‑1 (MQ=255) gggtGGCGAAGGCCGTCGCCAACCCGATCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCACCTCTAc > 1:1428155/4‑147 (MQ=255) gggtGGCGAAGGCCGTCGCC‑AACCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCACCTCTACGTGc > 2:126491/4‑150 (MQ=255) ggTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCACCTCTACGTGc < 2:480882/150‑1 (MQ=255) ttGGCTACGGCCTCCGCC‑ACCCGTTCGATTGTCGGTTTCGACGTCAGCAAATACCCCGGCTTGTACCGCGAAAACGCGTAGGGCCGTATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCACCTCTACGTGCTg < 2:336317/150‑1 (MQ=255) ttGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCACCTCTACGTGCTg < 1:367289/150‑1 (MQ=255) gACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCACCTCTACGTGCTGGAcgc < 2:717565/150‑1 (MQ=255) | CGACAGCATCATGGACAAGATGAACTACCCCAAAGGGCTGATCAGCTACACCACCGAGCACAACCTGTCCGGGCAGAAGACCCACATGCTGCGCCCCCGTCTGATCGGCTATGCCGTGGTACTGCTGGTGATGATG‑‑ATCGGGTTGGCGACGGCCTTCGCC‑ACCCGTTCGCTGGTCGGTTTCGACGTCAGCAAAGACCGCGTGTTGTACCGCGAAAACGCCCAGGGCCGGATCGAGAACGTGTACAGCCTGAAGGTAATGAACAAGGATCAGCGCGATCACCTCTACGTGCTGGACGC > NC_002947/4844109‑4844405 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |