| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,950,510 | C→G | 5.1% | G129A (GGG→GCG) | fliL ← | flagellar protein FliL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,950,510 | 0 | C | G | 5.1% | 285.9 / 4.8 | 91 | G129A (GGG→GCG) | fliL | flagellar protein FliL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/45); new base G (3/2); total (43/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTGGGACAGCAGGTCCTGTACGGCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATACTCAGCTGCATGTAGCGCTGG > NC_002947/4950362‑4950659 | cTGGGACAGCAGGTCCTGTACGGCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGccc > 1:914297/1‑150 (MQ=255) ggACAGCAGGTCCTGTACGGCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAc < 1:924168/150‑1 (MQ=255) ggACAGCAGGTCCTGTACGGCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAc < 1:1495235/150‑1 (MQ=255) aCAGCAGGTCCTGTACGGCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑Cg < 2:563584/150‑1 (MQ=255) gcagGTCCTGTACGGCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGgc > 1:1612629/1‑150 (MQ=255) ggTCCTGTACGGCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGgctgc > 1:1660690/1‑150 (MQ=255) tCCTGTACGGCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGATCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGctgctg > 2:1260533/1‑150 (MQ=255) gTACGGCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGa < 2:489148/150‑1 (MQ=255) ggCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGgt < 2:1895445/150‑1 (MQ=255) ggCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGgt > 2:468610/1‑150 (MQ=255) cATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGgct > 1:685998/1‑135 (MQ=255) cATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGgct < 2:685998/135‑1 (MQ=255) cATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTc < 2:450935/150‑1 (MQ=255) cATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTc < 1:583375/150‑1 (MQ=255) gCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGCCTTGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGTTGGCGAGGGTGTCGAAc < 1:1087635/150‑1 (MQ=255) gCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAAc < 1:468610/150‑1 (MQ=255) cGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAAcc < 2:212672/150‑1 (MQ=255) cGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAAcc < 1:351358/150‑1 (MQ=255) cGGACTCCTACTGCAATACGAAATGGGAGAACAGCAACTGGTCGATGCCCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAA‑CGGGGTGCTGCCGAGGGTGTGGAAcc > 1:651770/1‑150 (MQ=255) tCCTACTGCAATACGAAATTGGTGACCGGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTACTTATGCGCCTCTTCCTAGACGACCGGGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCGCCTTCGCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGCGTGTCGAACCCTTGc > 2:255877/1‑150 (MQ=255) tCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCtt < 1:1715459/148‑1 (MQ=255) tCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCtt > 2:1715459/1‑148 (MQ=255) cTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCGCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGccc > 1:1759133/1‑150 (MQ=255) cTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCGCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGccc > 1:1760542/1‑150 (MQ=255) tACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCg > 1:1805571/1‑150 (MQ=255) tACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCg > 2:1619330/1‑150 (MQ=255) aCTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCgg > 2:256661/1‑150 (MQ=255) aCTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCgg > 1:1712994/1‑150 (MQ=255) cTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCAGCACTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGCACCCTTGCCCGga < 1:1214184/150‑1 (MQ=255) tACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCGACGCCGTCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAAcat < 2:1627350/150‑1 (MQ=255) gAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑Cggg < 1:620000/109‑1 (MQ=255) gAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑Cggg > 2:620000/1‑109 (MQ=255) aaaTTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACatcatc < 2:821416/150‑1 (MQ=255) aaTTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACAtcatca > 2:3850/1‑150 (MQ=255) aTTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCAc < 1:256661/150‑1 (MQ=255) gTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAgg > 2:647821/1‑150 (MQ=255) aGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCa > 2:30633/1‑142 (MQ=255) aGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCa < 1:30633/142‑1 (MQ=255) gCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGc > 2:265587/1‑150 (MQ=255) aaCTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCg < 1:700034/123‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCg < 1:699463/123‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCg > 2:700034/1‑123 (MQ=255) aaCTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCg > 2:699463/1‑123 (MQ=255) tGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAgg > 2:495636/1‑102 (MQ=255) tGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAgg < 1:495636/102‑1 (MQ=255) tGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATc > 1:1050646/1‑150 (MQ=255) gTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCAc > 2:93548/1‑150 (MQ=255) gTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCAc > 1:1469441/1‑150 (MQ=255) gTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTCAATGGACCACCGCGGTGGCCTTTTGGCGCAGCATCTACTGATGCACTCGTAGCGCTTG‑GAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCAc > 1:925015/1‑150 (MQ=255) gATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGa < 2:1868724/95‑1 (MQ=255) gATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGa > 1:1868724/1‑95 (MQ=255) gATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGgttgtt > 2:1267135/1‑138 (MQ=255) gATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGgttgtt < 1:1267135/138‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAgg < 2:1243302/91‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAgg > 1:1243302/1‑91 (MQ=255) cTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCAc < 2:1660690/150‑1 (MQ=255) ccGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTg > 1:609479/1‑150 (MQ=255) cGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCGCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGa < 2:1759133/150‑1 (MQ=255) 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ccTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCt < 1:431673/141‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATa < 2:925015/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATa < 1:632516/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATACTCa < 2:1469441/150‑1 (MQ=255) caTCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTgg < 2:885730/118‑1 (MQ=255) caTCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATACTCAGCTGCAt < 1:3850/150‑1 (MQ=255) caTCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGCTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTgg > 1:885730/1‑118 (MQ=255) tctcCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATACTCAGCTGCATGt > 1:522845/1‑150 (MQ=255) ctcCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATACTCAGCTGCATGTa > 1:1267466/1‑150 (MQ=255) ctcCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATACTCAGCTGCATGTa < 2:1267466/150‑1 (MQ=255) cTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATACTCAGCTGCATGTAgcg > 1:87218/1‑150 (MQ=255) gCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCg < 1:274332/67‑1 (MQ=255) gCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCg > 2:274332/1‑67 (MQ=255) ccTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATACTCAGCTGCATGTAGCGCTgg > 2:1360702/1‑150 (MQ=255) | CTGGGACAGCAGGTCCTGTACGGCCATTGCGGACTCCTACTGCAATACGAAATTGGTGAACAGCAACTGGTCGATGACCGGCTTGCCGACTTCCTTCTGCGCCACTTCCTGGACCACCGCGGTGGCCTTCTGGCGCAGCATCTCCTGCCCTAC‑CGGGCTGCTGGCGAGGGTGTCGAACCCTTGCCCGGAGAACATCATCACCAGGTTGTTGCGGATCACCGGCATGTGCACCTTGAGGGCATCCAGGTCGGCCTGGTTACGCGCCTGTAGGGTGATACTCAGCTGCATGTAGCGCTGG > NC_002947/4950362‑4950659 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |