Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,081,371 | C→T | 6.1% | T72T (ACG→ACA) | lysC ← | aspartokinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,081,371 | 0 | C | T | 6.1% | 192.1 / 2.3 | 65 | T72T (ACG→ACA) | lysC | aspartokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/28); new base T (2/2); total (35/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.73e-01 |
CTGGTCGTCGATTTGCAGAATGCGCGCCTTGTTGTGCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGGTCGTCGCCCGCTTCACGGTGTTTCTTGACCTTTTCGG > NC_002947/5081230‑5081519 | ctGGTCGTCGATTTGCAGAATGCGCGCCTTGTTGTGCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGTTGACCGGCTCACCCGTCGacac > 2:1859639/1‑150 (MQ=255) cgtcgATTTGCAGAATGCGCGCCTTGTTGTGCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCa > 2:1744984/1‑150 (MQ=255) gtcgATTTGCAGAATGCGCGCCTTGTTGTGCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCAc > 2:1363445/1‑150 (MQ=255) tcgATTTGCAGAATGCGCGCCTTGTTGTGCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCTGTCGACACGATCACg > 2:1736636/1‑150 (MQ=255) tcgATTTGCAGAATGCGCGCCTTGTTGTGCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCTGTCGACACGATCACg > 2:1735716/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTGTTGTGCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGaa > 2:836487/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTGTTGTGCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGaa > 1:584249/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTGTTGTGCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGaa > 2:1423075/1‑150 (MQ=255) tgCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATc > 2:352402/1‑120 (MQ=255) tgCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATc < 1:352402/120‑1 (MQ=255) gAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTAGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTg < 1:977803/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGAt < 1:1739282/150‑1 (MQ=255) ggTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAATCGGCTGATCGGTGATCTGCtt > 1:324745/1‑150 (MQ=255) gTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTg < 1:212233/150‑1 (MQ=255) tACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGTTCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGt < 1:541042/150‑1 (MQ=255) tACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCa < 2:1435385/113‑1 (MQ=255) tACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCa > 1:1435385/1‑113 (MQ=255) tACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGt > 1:115775/1‑150 (MQ=255) aCGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTc < 1:1744984/150‑1 (MQ=255) gCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCAc < 2:1533494/100‑1 (MQ=255) gCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCAc > 1:1533494/1‑100 (MQ=255) gCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGa > 1:1237617/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCa < 1:1423075/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAg < 1:836487/150‑1 (MQ=255) tGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAgg < 2:115775/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGAt < 2:92260/126‑1 (MQ=255) gTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGAt > 1:92260/1‑126 (MQ=255) gCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGAtt > 1:1803103/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGAtt < 1:1363445/150‑1 (MQ=255) ggTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGTCACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGACCAGGTCGATCAGGCGATTGGt > 1:678249/1‑150 (MQ=255) ggTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCgg < 1:1324379/108‑1 (MQ=255) ggTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCgg > 2:1324379/1‑108 (MQ=255) ggTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGt > 1:1803315/1‑150 (MQ=255) ggTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGt > 1:1695900/1‑150 (MQ=255) gtgtAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCtt > 2:714778/1‑125 (MQ=255) gtgtAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCtt < 1:714778/125‑1 (MQ=255) ggACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCAcc < 2:584249/150‑1 (MQ=255) gACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCg > 2:1238577/1‑150 (MQ=255) gACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTCGCTGCACCg > 1:81996/1‑150 (MQ=255) acCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAg < 2:1460881/122‑1 (MQ=255) acCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAg > 1:1460881/1‑122 (MQ=255) acCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGt > 1:256368/1‑124 (MQ=255) acCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGt < 2:256368/124‑1 (MQ=255) gCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTc > 2:1704365/1‑118 (MQ=255) gCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTc < 1:1704365/118‑1 (MQ=255) acacCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGAc > 1:1613189/1‑150 (MQ=255) accacGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATc < 2:252538/100‑1 (MQ=255) accacGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATc > 1:252538/1‑100 (MQ=255) accacGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATc > 1:1595144/1‑118 (MQ=255) accacGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATc < 2:1595144/118‑1 (MQ=255) accacGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAg > 1:405599/1‑150 (MQ=255) cacGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGca > 1:200455/1‑150 (MQ=255) cTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGCCAGcacatc < 2:1449868/150‑3 (MQ=255) aTCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAaccacc > 2:1161593/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGc < 2:1581974/97‑1 (MQ=255) tCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGc > 1:1581974/1‑97 (MQ=255) aaGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAgg < 2:1237617/150‑1 (MQ=255) aaGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAgg < 2:1803103/150‑1 (MQ=255) aGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGgt < 2:1803315/150‑1 (MQ=255) ccATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGgtcgt > 1:1653073/1‑150 (MQ=255) ccATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTCCTCACCCCTCCACACGATCACCTACAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGCCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGgtcgt < 1:1859639/150‑1 (MQ=255) cATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCTGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGgtcgtc < 1:1735716/150‑1 (MQ=255) cATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCTGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGgtcgtc < 1:1736636/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGGTCGTCGCCCGCTTCACGGTGTTTCTTg > 2:786652/1‑150 (MQ=255) ccggcgcACCCGTCGACACGAGCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATTGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGGTCGTCGCCCGCTTCACGGTGTTTCTTGa < 2:324745/144‑1 (MQ=255) cccGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGGTCGTCGCCCGCTTCACGGTGTTTATTGACCTTTTCg < 1:1161593/150‑1 (MQ=255) ccGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGcc > 2:1111199/1‑59 (MQ=255) ccGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGcc < 1:1111199/59‑1 (MQ=255) ccGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGGTCGTCGCCCGCTTCACGGTGTTTCTTGACCTTTTCgg > 2:560620/1‑150 (MQ=255) cGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCAcc < 1:1470105/84‑1 (MQ=255) cGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCAcc > 2:1470105/1‑84 (MQ=255) | CTGGTCGTCGATTTGCAGAATGCGCGCCTTGTTGTGCGAGCTGTCGGTGAGAATACGCACCTGGTTGCCGGTGTAGGACACCGCTGGCACACCACGCTTGATCAAGGCCATGGTCAGCAGGGCAATGGTGACCTGCTCACCCGTCGACACGATCACGTCCAGTTCACGAGGAACCGGCTGATCGGTGATCTGCTTGGCCAGGTCGATCAGGCGATTGGTTTCACCGCTCATGGCCGACAGCACAACCACCAGGTCGTCGCCCGCTTCACGGTGTTTCTTGACCTTTTCGG > NC_002947/5081230‑5081519 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |