| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,096,513 | C→T | 5.9% | V101I (GTC→ATC) ‡ | argT ← | lysine/arginine/ornithine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,096,513 | 0 | C | T | 5.9% | 200.4 / 2.2 | 68 | V101I (GTC→ATC) ‡ | argT | lysine/arginine/ornithine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/31); new base T (2/2); total (35/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.25e-01 | |||||||||||
CAGCACTTCCTTGGCGAAGCGGTCGTGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCATCTCTTCGCACAGCGCGTTGCCGATATC > NC_002947/5096364‑5096660 | cAGCACTTCCTTTGCGAAGCGGTCGTGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTcgac < 1:1588187/150‑1 (MQ=255) cTTCCTTGGCGAAGCGGTCGTGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGAct > 1:1756386/1‑150 (MQ=255) ttCCTTGGCGAAGCGGTCGTGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTcgaccga > 2:1221267/1‑147 (MQ=255) ttCCTTGGCGAAGCGGTCGTGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTcgaccga < 1:1221267/147‑1 (MQ=255) ttGGCGAAGCGGTCGTGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTg > 2:1793039/1‑150 (MQ=255) cGGTCGTGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCg > 1:296542/1‑150 (MQ=255) ctggAAGGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGa < 2:700088/147‑1 (MQ=255) gTGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGGTCGActtcac < 1:433360/135‑3 (MQ=255) gTGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGGTCGActtcac > 2:433360/1‑133 (MQ=255) tGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATc < 2:782272/150‑1 (MQ=255) tGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGACACCTCGTTCTCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATc < 2:52415/150‑1 (MQ=255) gAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCg > 1:1178096/1‑150 (MQ=255) tGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACa > 2:153376/1‑150 (MQ=255) cACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGAt < 1:153376/150‑1 (MQ=255) aCGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATg < 1:1793039/150‑1 (MQ=255) cGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGAc < 1:95941/134‑1 (MQ=255) cGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGAc > 2:95941/1‑134 (MQ=255) gCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGc > 1:194028/1‑150 (MQ=255) gATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTc > 2:736199/1‑150 (MQ=255) aTCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCg > 1:968735/1‑150 (MQ=255) cttcttGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACa > 2:813046/1‑128 (MQ=255) cttcttGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACa < 1:813046/128‑1 (MQ=255) cttGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCtt < 2:1756386/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCTGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTg < 1:219086/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTTCAGTTCGTCCAGGATGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTg < 2:1628741/150‑1 (MQ=255) ccTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTgcgc > 1:1649856/1‑150 (MQ=255) tttCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGt > 1:1324642/1‑137 (MQ=255) tttCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCAc > 1:1710838/1‑150 (MQ=255) tttCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCAc > 1:923595/1‑150 (MQ=255) tttCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGCTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGt < 2:1324642/137‑1 (MQ=255) gTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTcgacc > 2:850502/1‑86 (MQ=255) gTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTcgacc < 1:850502/86‑1 (MQ=255) ttCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAg < 2:968735/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGGCCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGa > 1:1063970/1‑103 (MQ=255) tCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGGCCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGa < 2:1063970/103‑1 (MQ=255) cAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCgg < 1:1055955/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCgg > 2:360507/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCgg < 1:479886/150‑1 (MQ=255) tGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCa > 1:40369/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGACGGTAGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAg < 1:1546381/150‑1 (MQ=255) tCGCTGACGGTGGTGCCGTGCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAgg < 2:528678/150‑1 (MQ=255) cGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGc < 1:360507/150‑1 (MQ=255) cTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCg > 2:1786137/1‑150 (MQ=255) gtggtgCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGATTTCTTGCGGTACTCCGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAAc < 1:1105105/150‑1 (MQ=255) ccTTCATGACCAGGCGGGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCGTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACATGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTcca < 2:827477/150‑3 (MQ=255) cATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCa > 2:691874/1‑150 (MQ=255) aTGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAg < 1:1786137/150‑1 (MQ=255) gACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGt > 1:1065949/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTaca > 2:1409798/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTaca > 2:1272031/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACt > 1:340571/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACAt > 2:174021/1‑69 (MQ=255) 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ggAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTc < 2:923595/150‑1 (MQ=255) gAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCa > 1:623713/1‑150 (MQ=255) aGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCAt < 2:340571/150‑1 (MQ=255) tCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCAtct > 1:1818769/1‑150 (MQ=255) tCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCAtct > 1:734747/1‑150 (MQ=255) aGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCATctct > 1:1911249/1‑150 (MQ=255) gtagtaGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCATCTCTTc < 2:1649856/150‑1 (MQ=255) agCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCATCTCTTCGcaca < 1:691874/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGCCATGGACGACAGGGTGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCCGGTACACTTGGTTTTCATCTCTTCGCACAg > 1:931745/1‑150 (MQ=255) gcTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACAATTGGTTTTCATCTCTTCACACAgcg > 1:286644/1‑150 (MQ=255) tGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCATCTCTTCGCACAGCGCGTTGc < 1:736199/150‑1 (MQ=255) aacaGTCGACCTAGGTCTTGCCGTCTTCGGTGACGTGCAGGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCGTGCTCTGCCCAGGTACACTTGGTTTTCATCTCTTCGCACAGCGCGTTGc < 2:836351/147‑1 (MQ=255) gAAGTCGGTCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACa > 2:28938/1‑38 (MQ=255) gAAGTCGGTCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACa < 1:28938/38‑1 (MQ=255) gTCGACCGACTTCTTGCGTTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCATCTCTTCGCACAGCGCGTTGCCGat > 2:572845/1‑150 (MQ=255) gaccgacGTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGCTGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGAACTTTCACCGCCGGGATCAGGCCACCGAACTCCCGCTCGACCCACGTACACTTCGTTCTAATCTCTTAGCCCAGCGCGTTGCCGATATc > 2:55070/1‑150 (MQ=255) | CAGCACTTCCTTGGCGAAGCGGTCGTGAATGGAGCCGCGCTGCACGCCGATCTTCTTGCCTTTCAGTTCGTCCAGGCTGTCGCTGACGGTGGTGCCGTCCTTCATGACCAGGCGCGCCGGAGTCAGGTAGTAGCGCTTGGTGAAGTCGACCGACTTCTTGCGGTCATCGGTGATCGACATGGACGACAGGATGGCGTCGATCTTGCGCACTTTCAGCGCCGGGATCAGGCCGTCGAACTCCTGCTCGACCCAGGTACACTTGGTTTTCATCTCTTCGCACAGCGCGTTGCCGATATC > NC_002947/5096364‑5096660 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |