Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,155,372 | G→A | 6.0% | A57V (GCG→GTG) | PP_5698 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,155,372 | 0 | G | A | 6.0% | 200.0 / 2.2 | 67 | A57V (GCG→GTG) | PP_5698 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/30); new base A (2/2); total (35/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.53e-01 |
ATTCCGCGCTGCAGTTCAAGGCGATCCGCAGTTTGATGATTTGCCGATTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGCCATGGCCCCGAGGGGCAGGCACATCAGTATT > NC_002947/5155229‑5155521 | aTTCCGCGCTGCAGTTCAAGGCGATCCGCAGTTTGATGATTTGCCGATTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGccgccg > 2:1886483/1‑150 (MQ=255) cAGTTCAAGGCGATCCGCAGTTTGATGATTTGCCGATTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGGGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCa > 1:1631246/1‑150 (MQ=255) cAGTTCAAGGCGATCCGCAGTTTGATGATTTGCCGATTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCa > 1:1618064/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGCGATCCGCAGTTTGATGATTTGCCGCTTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAg > 1:780351/1‑150 (MQ=255) cGATCCGCAGTTTGATGATTTGCCGATTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGa < 2:1235065/150‑1 (MQ=255) gTTTGATGATTTGCCGATTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATgg > 1:1396484/1‑150 (MQ=255) tgatgaTTTGCCGATTGAATTTCGAGGTGCCATCGCCGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGgcgc < 2:1286384/150‑1 (MQ=255) ccGATTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATa < 2:1365696/150‑1 (MQ=255) gATTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAgttgtt > 1:812086/1‑124 (MQ=255) gATTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAgttgtt < 2:812086/124‑1 (MQ=255) tttCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTc > 1:966295/1‑150 (MQ=255) cgGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAgg < 1:1663541/150‑1 (MQ=255) gTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGACTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCg < 1:1812013/150‑1 (MQ=255) aTCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTa > 2:1901352/1‑150 (MQ=255) tCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGGGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAg < 2:1631246/150‑1 (MQ=255) gACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTc > 1:637751/1‑150 (MQ=255) ttttACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGgt > 2:1774440/1‑139 (MQ=255) ttttACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGgt < 1:1774440/139‑1 (MQ=255) ttttACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCt > 1:1083440/1‑150 (MQ=255) tttACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGcat < 1:68283/150‑3 (MQ=255) tttACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCtt < 2:780351/150‑1 (MQ=255) cccGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCTAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGc < 1:1568155/144‑1 (MQ=255) cccGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGc > 2:1568155/1‑144 (MQ=255) ccgccgGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACACCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGa < 2:1119898/141‑1 (MQ=255) ccgccgGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACACCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGa > 1:1119898/1‑141 (MQ=255) cgccgGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTATGGCAGACGTGTGATCTTCAGCTTTCACGCCGCCGGCCAATGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGAcccc < 1:1886483/150‑1 (MQ=255) aCGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGc > 2:273562/1‑150 (MQ=255) aCGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATGACAGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGc < 1:1469934/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCCCGCAGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTc > 2:752261/1‑150 (MQ=255) gTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCg < 2:68491/121‑1 (MQ=255) gTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCg > 1:68491/1‑121 (MQ=255) gTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTc < 2:1396484/150‑1 (MQ=255) ttCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGTCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCGCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTcc > 1:1323014/1‑150 (MQ=255) ttCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTcc > 2:532772/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCGCACTCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAg < 1:1575147/72‑1 (MQ=255) cccGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGcc < 1:1203640/104‑1 (MQ=255) cccGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGcc > 2:1203640/1‑104 (MQ=255) cccGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTtct < 2:995441/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTtctc < 1:499061/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTtc > 1:1049963/1‑148 (MQ=255) ccGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTtc < 2:1049963/148‑1 (MQ=255) ggCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCca > 1:446746/1‑150 (MQ=255) gcgcACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCcaa > 1:988561/1‑149 (MQ=255) cACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAgg < 2:398714/107‑1 (MQ=255) cACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAgg > 1:398714/1‑107 (MQ=255) aCCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGc < 2:1734749/107‑1 (MQ=255) aCCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGc > 1:1734749/1‑107 (MQ=255) ccGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACACCGCCGGGACCTGCCCATAgttgtt > 1:1196515/1‑66 (MQ=255) ccGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACACCGCCGGGACCTGCCCATAgttgtt < 2:1196515/66‑1 (MQ=255) ggTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGa < 2:1618064/150‑1 (MQ=255) ccTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGCCCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCg > 1:930865/1‑119 (MQ=255) ccTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCg < 2:930865/119‑1 (MQ=255) ccTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAg < 1:273562/150‑1 (MQ=255) tctGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTTGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGcc > 2:1822244/1‑150 (MQ=255) tctGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTcc > 1:1148696/1‑132 (MQ=255) tctGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTcc < 2:1148696/132‑1 (MQ=255) tctGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGcc > 2:340292/1‑150 (MQ=255) ctGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGCCa < 1:340292/150‑1 (MQ=255) gCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGCCATGGc > 2:850842/1‑150 (MQ=255) ttACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGCCATGGCCCCg > 2:1779114/1‑150 (MQ=255) ggAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGCGGTCGCTGGCCGCCGACTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGCCATGGCCCCGAggg > 2:1506509/1‑150 (MQ=255) aaGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGCCATGGCCCCGAGGggc > 2:1128237/1‑150 (MQ=255) ggTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGCCATGGCCCCGAGGggcag < 1:1901352/150‑1 (MQ=255) tCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAgg > 2:293519/1‑41 (MQ=255) tCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAgg < 1:293519/41‑1 (MQ=255) tCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCAAATCGATGGGATAAGCCATGGCCCCGAGGggcaggc < 2:988561/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGCCATGGCCCCGAGGGGCAGGCACATCAGTa > 2:1926555/1‑150 (MQ=255) gccgccGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGGATTCGAGCTTGACGGCGGACAGCTTCTTCTCCACATCGATGGGATAAGCCATGGCCCCGAGGGGCAGGCACATCTGCAtt > 1:627975/1‑150 (MQ=255) | ATTCCGCGCTGCAGTTCAAGGCGATCCGCAGTTTGATGATTTGCCGATTGAATTTCGCGGTGACATCGACGCTTTTACCCGCCGGTACGTTCACCCGGCGCACCCGCGGTGCCTCTGGGCCATTACGGAAGGTCACCTTGCACGCCGCCGGGACCTGCCCATAGTTGTTGAGGGTGATGGCGCCAATGTCATAGGCCGTGTCATAGGCGGTGTAGTCGAGCTTGACCCCGGTCAGCTCCTTCTCCACATCGATGGGATAAGCCATGGCCCCGAGGGGCAGGCACATCAGTATT > NC_002947/5155229‑5155521 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |