| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,158,869 | C→G | 5.4% | T306S (ACT→AGT) | PP_4542 → | ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,158,869 | 0 | C | G | 5.4% | 285.9 / 4.2 | 90 | T306S (ACT→AGT) | PP_4542 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/38); new base G (2/3); total (49/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
CGAGAAAACCCAGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCAATGCGCCGG > NC_002947/5158720‑5159012 | cGAGAAAACCCAGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGCCGAGCACAACAACACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCATAGCACTGGGACGGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCAc > 1:1020347/1‑150 (MQ=255) aaCCCAGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACAACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCt > 1:88348/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTg < 1:1723246/150‑1 (MQ=255) aCCCAGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTg > 1:1185976/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCAACTGGCCTg < 2:857948/150‑1 (MQ=255) cccAGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTgg > 1:65599/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGt > 2:1692430/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGt < 2:891034/150‑1 (MQ=255) aGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGa < 2:529706/150‑1 (MQ=255) tCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATc > 2:1268181/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACAGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGt > 2:304117/1‑150 (MQ=255) ggTGATCACCAGCATGGACGTCGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCaa < 2:1699785/150‑1 (MQ=255) tCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGt > 1:147488/1‑150 (MQ=255) tCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGt > 2:890750/1‑150 (MQ=255) tGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGa < 1:189097/150‑1 (MQ=255) tGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGa < 2:1580142/150‑1 (MQ=255) tGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGa < 2:130818/150‑1 (MQ=255) gACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGGCCCGCCTCGTCAACATGTCGGGCTGGATc > 2:1902538/1‑150 (MQ=255) gACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATc < 1:1268181/150‑1 (MQ=255) aCGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCa > 1:1112790/1‑150 (MQ=255) aCGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCa > 2:1016851/1‑150 (MQ=255) gTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCGGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGGCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCGATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGTTCCGCATCGTCCACAGGTCGGGCTgcgtgctg > 2:529774/1‑143 (MQ=255) tcatcaCCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGAGCCGCATCGTCAACAGGTCGGTCTGGATAATgtcgg > 2:892601/1‑150 (MQ=255) catcaCCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATgtgggt > 2:224217/1‑150 (MQ=255) atcaCCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCAGGCCAGTGGccaggg > 1:833543/1‑106 (MQ=255) atcaCCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCAGGCCAGTGGCCAggg < 2:833543/110‑2 (MQ=255) tcaCCACCCTCAATGGCCGGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGATATCGACTTGGATGGCTTCGGTGTGGTTCTCATCGTGAACATGTCGGGCTGGATCATgtgggtgg < 1:529774/150‑1 (MQ=255) ccaccCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCa > 1:1461923/1‑150 (MQ=255) caccCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCaa > 2:1532208/1‑150 (MQ=255) cccTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACg < 1:304117/150‑1 (MQ=255) cccTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACg < 2:147488/150‑1 (MQ=255) cccTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGACTTTTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACg < 1:542428/150‑1 (MQ=255) cTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGc > 2:1812635/1‑150 (MQ=255) cTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACAACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGc < 2:88348/150‑1 (MQ=255) aTGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATc > 2:522260/1‑128 (MQ=255) aTGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATc < 1:522260/128‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCga < 1:1532208/150‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCgaga > 1:581478/1‑150 (MQ=255) ctgGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAAc > 2:569232/1‑150 (MQ=255) tggtCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCg < 1:1812635/150‑1 (MQ=255) gtCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGc < 1:1016851/150‑1 (MQ=255) tCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACa < 2:77148/144‑1 (MQ=255) tCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACa > 1:77148/1‑144 (MQ=255) gCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCTTCGCCCTGGCCACTCGCTTTTTGCTCCGCCTGGGCCAGATTTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATg < 1:1692430/150‑1 (MQ=255) accaccGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTg < 1:858251/150‑1 (MQ=255) caccGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCa > 1:1314867/1‑150 (MQ=255) accGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAg > 2:1745965/1‑150 (MQ=255) ttGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTc > 1:1271802/1‑88 (MQ=255) ttGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTc < 2:1271802/88‑1 (MQ=255) ccTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCa > 2:1644552/1‑150 (MQ=255) tgtggctgtggAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGa < 1:488284/150‑1 (MQ=255) ctgtggAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTc < 2:931425/111‑1 (MQ=255) ctgtggAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTc > 1:931425/1‑111 (MQ=255) tgtggGGCCAATCGCTGAGCGCCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCg < 2:440865/150‑1 (MQ=255) ccAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGaa < 2:461280/108‑1 (MQ=255) ccAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGaa > 1:461280/1‑108 (MQ=255) aaTCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGGATGGTGAAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCgg > 1:1773618/1‑150 (MQ=255) cTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGt > 1:1903573/1‑113 (MQ=255) cTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGt < 2:1903573/113‑1 (MQ=255) tGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCCGCCGgtcaccc > 2:787964/1‑149 (MQ=255) tGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGgtcaccg > 1:1934837/1‑150 (MQ=255) tCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCg > 2:434495/1‑102 (MQ=255) tCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGgtcaccgtca < 2:581478/150‑1 (MQ=255) 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gTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCgag > 1:903281/1‑86 (MQ=255) gTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGAc < 2:970686/118‑1 (MQ=255) gTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGAc > 1:970686/1‑118 (MQ=255) tGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCa < 2:799920/102‑1 (MQ=255) tGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCa > 1:799920/1‑102 (MQ=255) gCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGccc > 1:834709/1‑150 (MQ=255) gCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGccc < 1:224217/150‑1 (MQ=255) ccATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCGCTGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCCTCTTCGGGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCa > 1:155600/1‑150 (MQ=255) ccATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCa > 1:1634494/1‑150 (MQ=255) cATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGTGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCaa > 1:1178875/1‑150 (MQ=255) cATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCaa < 1:890750/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCAAt > 1:1892233/1‑150 (MQ=255) gCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCAATgcg > 1:384152/1‑150 (MQ=255) cccTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCAATgcgc > 1:635511/1‑150 (MQ=255) cgtGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTGGGGCTAGAGCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCAATGCGcc < 1:110241/148‑1 (MQ=255) ccTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCAATGCGcc > 1:1940535/1‑150 (MQ=255) caggCCAGTGGCCAGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCAtg < 2:119768/49‑1 (MQ=255) caggCCAGTGGCCAGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCAtg > 1:119768/3‑51 (MQ=255) tGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCAATGCGCCgg > 1:1603391/1‑150 (MQ=255) ccACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCa > 1:790337/1‑88 (MQ=255) ccACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCa < 2:790337/88‑1 (MQ=255) | CGAGAAAACCCAGCTGGCCTCCCGGGTGATCACCAGCATGGACGTGGTCATCACCACCCTCAATGGCCTGCTGGTGGTCGCCACCACCGGCCTTGCCCTGTGGCTGTGGAGCCAATCGCTGATCACCGTGGGTGCCATCGCCCTGGCCACTGGCCTGGTGATCCGCATCGTCAACATGTCGGGCTGGATCATGTGGGTGGTCAACGGCATCTTCGAGAACATCGGCATGGTGCAGGACGGCCTGCAGACCATCGCCCAGCCGGTCACCGTCACCGACCCGCCCAATGCGCCGG > NC_002947/5158720‑5159012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |