| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,300,336 | C→T | 6.0% | R1162Q (CGG→CAG) | recB ← | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,300,336 | 0 | C | T | 6.0% | 195.3 / 2.2 | 67 | R1162Q (CGG→CAG) | recB | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/32); new base T (2/2); total (33/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
CGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACCCAGCCAGTTGGACTTGTAGTCGGTCACG > NC_002947/5300187‑5300479 | cgTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGcc < 1:237103/150‑1 (MQ=255) gCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCcgcgcgcg > 2:255191/1‑150 (MQ=255) cACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCa > 2:40237/1‑150 (MQ=255) aGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCgg > 1:53143/1‑150 (MQ=255) gcgcATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGTTGCGCGCGCGGCTGGCgga < 2:351128/150‑2 (MQ=255) tCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAAGTGCCGGTGCggg > 2:699893/1‑150 (MQ=255) cGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAggg < 1:1395502/150‑1 (MQ=255) gCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGATGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCcag > 2:1441129/1‑150 (MQ=255) tCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAgg < 1:1595296/150‑1 (MQ=255) gATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCCACCGCCCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTa > 2:941911/1‑150 (MQ=255) gATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTa < 2:53143/150‑1 (MQ=255) tCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACa > 1:1860937/1‑150 (MQ=255) cTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGcac < 1:1191965/150‑1 (MQ=255) tCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGcaca < 2:1860937/150‑1 (MQ=255) aCGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGACCGCTGCTGCTGGCCCCGCGCCGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAgg > 2:91361/1‑130 (MQ=255) aCGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGACCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAgg < 1:91361/130‑1 (MQ=255) gcgGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACt > 1:1111569/1‑150 (MQ=255) gTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCa < 1:40237/150‑1 (MQ=255) ggCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGATGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAAGTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAgg < 2:161570/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGTTGCGCGCGCGGCTGGCggac < 2:590333/116‑3 (MQ=255) ttGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGTTGCGCGCGCGGCTGGCggac > 1:590333/1‑114 (MQ=255) ttGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCa < 2:853596/118‑1 (MQ=255) ttGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCa > 1:853596/1‑118 (MQ=255) ttGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCg > 2:1279790/1‑150 (MQ=255) ttGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCg > 1:1817728/1‑150 (MQ=255) ttGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCg > 2:877790/1‑150 (MQ=255) gCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATa < 1:260524/137‑1 (MQ=255) gCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATa > 2:260524/1‑137 (MQ=255) tGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCgg < 2:628849/150‑1 (MQ=255) ggTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGt < 2:1817728/150‑1 (MQ=255) tACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCcagca < 1:257374/118‑1 (MQ=255) tACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCcagca > 2:257374/1‑118 (MQ=255) cacGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTc < 1:1873221/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATc < 1:1441129/150‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCt > 2:462723/1‑150 (MQ=255) gctgctgctGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGTCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAg < 2:62843/111‑1 (MQ=255) gctgctgctGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGTCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAg > 1:62843/1‑111 (MQ=255) ctgGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTccatg < 1:1279790/150‑1 (MQ=255) ctgGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTccatg > 1:1468815/1‑150 (MQ=255) ctgGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCCCCGCCAACATGGTGGTCATAATCGTAGACCGCCAGCCGCGCGCCCAACTGGCGCTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAAAATCGTCTTTCccatg > 2:334488/1‑150 (MQ=255) tgGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGAAGTTCTTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTccatgg < 1:941911/150‑1 (MQ=255) gCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTccatggcc > 2:1292040/1‑150 (MQ=255) cACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTccatggcca < 2:1111569/150‑1 (MQ=255) ccGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTccatggccatg < 2:1632012/150‑1 (MQ=255) ccGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTccatggccatg > 1:1377777/1‑150 (MQ=255) cgcgCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGc > 2:272994/1‑85 (MQ=255) cgcgCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGc < 1:272994/85‑1 (MQ=255) gAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAg < 1:1534158/102‑1 (MQ=255) gAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAg > 2:1534158/1‑102 (MQ=255) gAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTa < 2:1810667/150‑1 (MQ=255) gATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATAc > 2:1826597/1‑94 (MQ=255) gATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATAc < 1:1826597/94‑1 (MQ=255) aTGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGcc < 2:1468815/150‑1 (MQ=255) aCAGGGCTCCGCAAACATGGCGGTAATAATCGTAGTACGCGGGCCCCTCGCGAAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAACAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGa < 1:699893/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGAt < 1:462723/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTcc < 2:309064/150‑1 (MQ=255) gccgccAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCAGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGc > 1:1046826/1‑150 (MQ=255) gccAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCAcc > 2:1614309/1‑150 (MQ=255) ccAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGACATAAAATCTCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCAcgc > 1:119184/1‑148 (MQ=255) cAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACcca < 2:1533748/150‑1 (MQ=255) aaCATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACccag > 2:1702172/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACccagcca < 1:947152/150‑1 (MQ=255) gCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACCCAGCCAGtt > 1:31232/1‑150 (MQ=255) cATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACCCAGCCAGTTGGACt > 2:1754692/1‑150 (MQ=255) aTCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACCCAGCCAGTTGGACTTGTa > 2:1431046/1‑150 (MQ=255) aTCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTCCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACCCAGCCAGTTGGACTTGTa < 1:331398/150‑1 (MQ=255) tAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACCCAGCCAGTTGGACTTGTAGTCg > 2:588311/1‑150 (MQ=255) gcaccGCCAGTTGCGCGCGCGGCTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACCCAGCCAGTTGGACTTGTAGTCgg > 2:620520/4‑150 (MQ=255) gCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACCCAGCCAGTTGGACTTGTAGTCGGTCACg < 2:1046826/150‑1 (MQ=255) | CGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCGTAGTCCGCCAGCCGCGCGCGCAACTGGCGGTGCAGGGCCAGCAGGTACAGCACATACTGCAGGTCGTAGCGGTGCTCAAGAATCGCCTTTTCCATGGCCATGGCATCGTAGGCCTGGATGTCCGCACCCAGCCAGTTGGACTTGTAGTCGGTCACG > NC_002947/5300187‑5300479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |