| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,331,457 | A→C | 5.1% | V51G (GTC→GGC) | PP_4692 ← | aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,331,457 | 0 | A | C | 5.1% | 210.6 / 2.1 | 74 | V51G (GTC→GGC) | PP_4692 | aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/35); new base C (2/2); total (37/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
CGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCACTGTAGGGTTGG > NC_002947/5331311‑5331603 | cGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGTCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGcgacga < 2:757061/150‑1 (MQ=255) gggggTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGAt > 1:300841/1‑150 (MQ=255) gggggCAATAAGGATGTGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAACCCGGCAATTTCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGAt < 2:223645/150‑1 (MQ=255) ggggTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATg > 1:1048338/1‑150 (MQ=255) gggTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATgg > 1:1936074/1‑150 (MQ=255) gTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGt < 2:300841/150‑1 (MQ=255) gTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGt < 1:1503072/150‑1 (MQ=255) aataaGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGc > 1:1247329/1‑150 (MQ=255) taaGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCgg < 2:1872051/150‑1 (MQ=255) aTGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgtg < 2:1206494/150‑1 (MQ=255) tGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgtgg < 1:1905885/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgtggt < 1:1564245/150‑1 (MQ=255) gTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGcga > 2:1230758/1‑129 (MQ=255) gTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGcga < 1:1230758/129‑1 (MQ=255) gTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGa < 1:272299/150‑1 (MQ=255) gTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCgg < 1:1863725/150‑1 (MQ=255) gTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCgg < 1:1881332/150‑1 (MQ=255) tCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCATTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTATGCCCTGCGGCCAGCGCGGCGTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGc > 1:1189138/1‑150 (MQ=255) tCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGc > 1:1470978/1‑150 (MQ=255) tGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGc < 1:1468203/150‑1 (MQ=255) tGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGAGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGc > 1:923425/1‑150 (MQ=255) gCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTc > 2:649400/1‑150 (MQ=255) aTAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAg > 1:1501014/1‑150 (MQ=255) aGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTACCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGt < 1:1461007/150‑1 (MQ=255) cTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCACGTGCCGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GCCCGGCCCTAGGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGAt < 1:1506232/150‑1 (MQ=255) ccATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCAcg < 1:577987/150‑1 (MQ=255) aTAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGTCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCAcgtc > 2:187938/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCAcgtcgt < 1:1002064/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGTCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGc < 2:142342/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGc < 1:1535463/150‑1 (MQ=255) acgggCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGGGGTGTAGGGAGTGTGCCTTGCGGCCGGCG‑GGGGTGGCGC‑TGGCGAGACGATGGGTGCGGCAGTGGTGAAGTCCGGCTCGCGGATTTGCAGGGGGGTGACGTGGTGcca > 2:750117/4‑149 (MQ=255) gCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGgcc < 2:1048338/150‑1 (MQ=255) aaTTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGgccgc > 1:1132049/1‑150 (MQ=255) aTTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGgccgcc > 1:333393/1‑150 (MQ=255) ttGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGccc < 2:979871/142‑1 (MQ=255) ttGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGccc > 1:979871/1‑142 (MQ=255) ccTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCa < 1:649400/150‑1 (MQ=255) tCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCAcgtc > 2:1465852/1‑131 (MQ=255) tCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCAcgtc < 1:1465852/131‑1 (MQ=255) aCGCAGTGCTGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTc < 1:286378/150‑1 (MQ=255) aCGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTc > 2:487508/1‑150 (MQ=255) aGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTg < 2:1936074/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGccc > 1:112172/1‑150 (MQ=255) ggCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCgg < 2:923425/150‑1 (MQ=255) ggCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCgg < 1:295361/150‑1 (MQ=255) aGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCAcgtc > 1:1485433/1‑116 (MQ=255) aGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCAcgtc < 2:1485433/116‑1 (MQ=255) aCCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGACTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCcac > 2:412701/1‑149 (MQ=255) ccGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCcagc > 2:1704102/1‑150 (MQ=255) cgcgTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCgg > 1:796301/1‑85 (MQ=255) cgcgTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCgg < 2:796301/85‑1 (MQ=255) cgTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGaa < 2:967121/77‑1 (MQ=255) cgTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGaa > 1:967121/1‑77 (MQ=255) ggcggTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCgg < 1:1654291/136‑1 (MQ=255) ggcggTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCgg > 2:1654291/1‑136 (MQ=255) ggcggTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCAt > 1:1311377/1‑150 (MQ=255) tgtAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGt < 2:1851392/150‑1 (MQ=255) tAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTg < 1:1737142/149‑1 (MQ=255) tAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTg > 2:1737142/1‑149 (MQ=255) gCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGTCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGCTTGGGCGCTGGATCTCGTCGTGCCCGGCCGGCTGCAGCCCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGaa > 1:526891/1‑150 (MQ=255) gAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAg < 2:1311377/150‑1 (MQ=255) tgtgCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGtt > 1:267131/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGa > 2:1779041/1‑150 (MQ=255) cccTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGAt > 2:1736514/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATCGGTGCGCCCGCGGTCAAGTCCGACCCGCAGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGCCCGCCTGCAGCGCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCCTGACCGGGAAAGGTTCGATg > 2:524356/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCg > 2:1071568/1‑145 (MQ=255) tGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCg < 1:1071568/145‑1 (MQ=255) 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ccgCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTGCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCagcagc > 1:1585088/1‑101 (MQ=255) ccgCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTGCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCagcagc < 2:1585088/101‑1 (MQ=255) cgcgACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCACTGTAGGGTTg < 2:966779/150‑1 (MQ=255) gcgACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCACTGTAGGGTTgg < 2:1035551/150‑1 (MQ=255) | CGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGGCAATTGCCTCACGCAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGC‑C‑GGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCACTGTAGGGTTGG > NC_002947/5331311‑5331603 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |