Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,573,517 | C→T | 5.4% | R184C (CGC→TGC) | rsgA → | ribosome biogenesis GTPase RsgA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,573,517 | 0 | C | T | 5.4% | 220.4 / 2.1 | 74 | R184C (CGC→TGC) | rsgA | ribosome biogenesis GTPase RsgA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/38); new base T (2/2); total (33/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.30e-01 |
CCGGCGCCAGAGCCGCACCCGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTGGGCAAGTCGTCGCTGGTCAACAGCCTGCTGCCA > NC_002947/5573370‑5573663 | ccGGCGCCAGAGCCGCACCCGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACcgc > 1:939648/1‑150 (MQ=255) gcCAGAGCCGCACCCGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACt < 2:1032085/150‑1 (MQ=255) ccAGAGCCGCACCCGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTg < 1:806006/150‑1 (MQ=255) cAGAGCCGCACCCGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTgg > 2:505039/1‑150 (MQ=255) agagCCGCACCCGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTggg > 1:441031/1‑150 (MQ=255) cACCCGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCg > 1:1207385/1‑150 (MQ=255) cACCCGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCg < 1:1535032/150‑1 (MQ=255) aCCCGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCgc > 1:777362/1‑150 (MQ=255) cccGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCgct > 2:316764/1‑150 (MQ=255) ccGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGAGCTACCCgctg > 2:1076804/1‑150 (MQ=255) ccgATCGACCGCTCTCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCCGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGACCCGCCATGCATGCGCTGCTGGAGGTCTTCCTCGAACTGGGCTGCCCGCTGCTGGaa < 2:73182/148‑1 (MQ=255) cTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGaa > 2:920457/1‑150 (MQ=255) cTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGaa < 2:939648/150‑1 (MQ=255) gATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGt > 2:60380/1‑150 (MQ=255) gATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGt > 1:1471840/1‑150 (MQ=255) tCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGttt < 1:898419/150‑1 (MQ=255) cGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTc < 1:1129823/150‑1 (MQ=255) aCCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCgg > 2:1733006/1‑150 (MQ=255) aCCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCgg > 1:1472828/1‑150 (MQ=255) aCCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCgg < 1:316764/150‑1 (MQ=255) aCCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCgg > 2:96397/1‑150 (MQ=255) gCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGcac < 1:505039/150‑1 (MQ=255) tATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCacac > 1:1193522/1‑150 (MQ=255) tATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCacac < 1:60380/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCAcaccac < 2:1471840/150‑1 (MQ=255) tGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACg < 1:742479/150‑1 (MQ=255) cGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGGGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCAt > 1:758667/1‑150 (MQ=255) cGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCAt < 1:758943/150‑1 (MQ=255) gAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACTAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATg > 2:627773/1‑150 (MQ=255) gAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGTGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATg < 1:1396937/150‑1 (MQ=255) aCGCCGGACTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGc > 2:1302578/1‑147 (MQ=255) aCGCCGGACTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGc < 1:1302578/147‑1 (MQ=255) gCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAgcgc < 2:1207385/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCt < 1:920457/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTg > 2:1315505/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTgc < 2:1472828/150‑1 (MQ=255) tGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTACAGGTGCTGCGGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTgcagc < 2:60236/150‑1 (MQ=255) gcCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGcaac < 1:96397/150‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCaacaac < 2:1707929/150‑1 (MQ=255) tgctgctgAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGATCTACCGCGAAGTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGATGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACg < 1:1689776/150‑1 (MQ=255) tgctgAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAg > 2:833243/1‑125 (MQ=255) tgctgAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAg < 1:833243/125‑1 (MQ=255) aCAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGTACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCa > 2:1055164/1‑150 (MQ=255) aCAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCa > 1:1240839/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACCCCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGc < 1:731891/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATTAGc < 2:1193522/150‑1 (MQ=255) gCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCgtg < 1:1315505/150‑1 (MQ=255) ccGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCgtgt < 2:1929408/150‑1 (MQ=255) cGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCgt < 2:1213745/147‑1 (MQ=255) cGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATCCGCTGCTTGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCgt > 1:1213745/1‑147 (MQ=255) aCCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCa > 2:685024/1‑109 (MQ=255) aCCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCa < 1:685024/109‑1 (MQ=255) acgacgAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCgc < 1:949376/63‑1 (MQ=255) acgacgAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCgc > 2:949376/1‑63 (MQ=255) gacgaGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACTGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGcc < 1:1395260/124‑1 (MQ=255) gacgaGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACTGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGcc < 1:1395293/124‑1 (MQ=255) gacgaGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACTGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGcc > 2:1395260/1‑124 (MQ=255) gacgaGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACTGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGcc > 2:1395293/1‑124 (MQ=255) acgaGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCgg < 2:777362/150‑1 (MQ=255) aTGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTgg < 2:1240839/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTGTTCTTCATGCTCTGGTGGAGACCGAGAGCGACCCGGGCTACCCGATGCTGGAAGTTTCGGCACCCCACCGCGACGGAATGCAGGGCCTGAAGCAACGCCTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCCTCGGCCAGTCggacgtcgg < 2:356355/150‑8 (MQ=255) tGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTggg < 1:627773/150‑1 (MQ=255) gCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTGGGCAAgtcgt > 1:1578559/1‑150 (MQ=255) ccTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCgg > 1:957563/1‑134 (MQ=255) ccTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCgg < 2:957563/134‑1 (MQ=255) cTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACg < 1:1906150/103‑1 (MQ=255) cTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACg > 2:1906150/1‑103 (MQ=255) ctgctgGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCCGATCTCCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTGGGCAAGTCGTCGCTGGTCAAc < 1:1391949/150‑1 (MQ=255) tgctgGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTg > 1:1405173/1‑128 (MQ=255) tgctgGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTg < 2:1405173/128‑1 (MQ=255) tgctgGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTGGGCAAGTCGTCGCTGGTCAACa > 1:95499/1‑150 (MQ=255) tgctgGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTGGGCAAGTCGTCGCTGGTCAACa > 1:541219/1‑150 (MQ=255) ctggcagTCTACCACGATCTTGCTAACCCGCTCCTTGACGTTTCTCAAAACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGTAGCAACAACTCGACGTCGATCTTTACCTGTTCGTCGCCCAGTCGGGAGTAGGCAAGTCGTCTCTGGTCAACAGc < 2:758667/144‑1 (MQ=255) tACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTGGGCAAGTCGTCGCTGGTCAACAGCCTGCTGCCa > 1:1461603/1‑150 (MQ=255) tACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTGGGCAAGTCGTCGCTGGTCAACAGCCTGCTGCCa > 2:1913634/1‑150 (MQ=255) | CCGGCGCCAGAGCCGCACCCGAACCTGATCGACCGCTATCTGGTAGCGGCCGAGCACGCCGGCCTGCGCCCGCTGCTGCTGCTGAACAAGGCCGACCTGATCAACGACGAGAATGGCCCCGGCCTGCATGCGCTGCTGGAGGTCTACCGCGAACTGGGCTACCCGCTGCTGGAAGTTTCGGCACACCACGGCGACGGCATGCAGCGCCTGCAGCAACAACTCGACGGCCATATCAGCGTGTTCGTCGGCCAGTCGGGAGTGGGCAAGTCGTCGCTGGTCAACAGCCTGCTGCCA > NC_002947/5573370‑5573663 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |