| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,592,486 | C→G | 8.1% | S127R (AGC→AGG) | PP_4920 → | lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,592,486 | 0 | C | G | 8.1% | 269.4 / 11.9 | 86 | S127R (AGC→AGG) | PP_4920 | lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/39); new base G (3/4); total (43/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
CCGAAGACAATCAGCATGGCACCGCACCAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACCGTCGAAGAATCGCAC > NC_002947/5592338‑5592630 | ccGAAGACAATCAGCATGGCACCGCACCAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGATTGCCGGGCTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCt < 1:50432/150‑1 (MQ=255) gAAGACAATCAGCATGGCACCGCACCAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCCATAGCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTAc > 1:238473/1‑150 (MQ=255) gAAGACAATCAGCATGGCACCGCACCAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTTCAGCTAc > 2:700182/1‑150 (MQ=255) gAAGACAATCAGCATGGCACCGCACCAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTAc > 1:548927/1‑150 (MQ=255) gAAGACAATCAGCATGGCACCGCACCAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTAc > 2:252293/1‑150 (MQ=255) tCAGCATGGCACCGCACCAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAg > 1:440202/1‑150 (MQ=255) ggCACCGCACCAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTAc > 2:1535671/1‑135 (MQ=255) ggCACCGCACCAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTAc < 1:1535671/135‑1 (MQ=255) accgcaccAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTg > 1:370038/1‑135 (MQ=255) accgcaccAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTg < 2:370038/135‑1 (MQ=255) accgcaccAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCg > 1:163339/1‑142 (MQ=255) accgcaccAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCg < 2:163339/142‑1 (MQ=255) aGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCAt < 1:271530/150‑1 (MQ=255) cACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATCTCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGgc > 2:473712/1‑136 (MQ=255) cACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGgc < 1:473712/136‑1 (MQ=255) aCCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGccc > 2:1430424/1‑150 (MQ=255) cTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGGTAGCTGGACaactc < 1:1629095/128‑5 (MQ=255) cTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGGTAGCTGGACaactc > 2:1629095/1‑124 (MQ=255) gCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGgcg > 2:1370823/1‑150 (MQ=255) ggCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCgg < 1:1370823/150‑1 (MQ=255) cTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCtt > 2:234498/1‑150 (MQ=255) aCGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTtca < 2:548927/150‑1 (MQ=255) cGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTtcat > 2:1558854/1‑150 (MQ=255) cGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTtcat > 2:905240/1‑150 (MQ=255) gAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTtcatc < 2:465450/150‑1 (MQ=255) aaCAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCt > 1:1661425/1‑144 (MQ=255) aaCAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCt < 2:1661425/144‑1 (MQ=255) aCAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCTGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCaa < 2:1037456/150‑1 (MQ=255) aGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATAGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGAATGCCCGGGCGCGGTTTCATCAACt > 2:914571/1‑150 (MQ=255) tatCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCa > 2:1560770/1‑150 (MQ=255) tatCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCa > 1:1341651/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCa > 2:1764261/1‑150 (MQ=255) tGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGa < 2:118710/150‑1 (MQ=255) tGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGAAAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACg < 2:568256/141‑1 (MQ=255) tGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGAAAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACg > 1:568256/1‑141 (MQ=255) ccGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACa < 1:1558854/150‑1 (MQ=255) ccGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGCTCGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACa < 1:700182/150‑1 (MQ=255) gACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAg > 1:108444/1‑150 (MQ=255) gACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAg > 1:1419365/1‑150 (MQ=255) aaaCGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACg < 1:200317/100‑1 (MQ=255) aaaCGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACg > 2:200317/1‑100 (MQ=255) aaCGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGc < 1:1560770/150‑1 (MQ=255) aaCGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGc < 1:624410/150‑1 (MQ=255) aaCGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGc < 1:1365490/150‑1 (MQ=255) aaCGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTCCTTGAGGTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGc < 1:821124/150‑1 (MQ=255) gTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGTATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGa < 2:440202/150‑1 (MQ=255) gTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGa < 2:1419365/150‑1 (MQ=255) aaCAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGAcc < 1:252293/150‑1 (MQ=255) agcagcTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTg > 1:872097/1‑150 (MQ=255) agcTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAg < 1:1764261/150‑1 (MQ=255) cTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGt < 2:833655/73‑1 (MQ=255) cTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGt > 1:833655/1‑73 (MQ=255) cTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGt < 2:1800623/73‑1 (MQ=255) cTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGt > 1:1800623/1‑73 (MQ=255) ttGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATg > 1:666806/1‑150 (MQ=255) ttGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATg < 2:872097/150‑1 (MQ=255) tGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGc < 1:986966/150‑1 (MQ=255) aaGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCaa > 1:175113/1‑103 (MQ=255) aaGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCaa < 2:175113/103‑1 (MQ=255) gCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTg > 1:1062317/1‑150 (MQ=255) cAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGcc < 1:905240/150‑1 (MQ=255) aGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCg < 2:108444/150‑1 (MQ=255) aGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCg > 1:458349/1‑150 (MQ=255) cagcaTGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGac < 2:1062317/150‑1 (MQ=255) caTGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACAcc > 2:1527783/1‑150 (MQ=255) tGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGa < 1:1781173/39‑1 (MQ=255) tGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGa > 2:1781173/1‑39 (MQ=255) gACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTc < 2:1504266/150‑1 (MQ=255) aCGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACCCAAACTGCACACGCTGCTGACC‑CTGCAGGCCATGCTTGTTTTTTGTCAGTAAGACACCTTCt < 2:805881/150‑1 (MQ=255) ggTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAAc < 1:1709577/150‑1 (MQ=255) gTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAAcc > 1:1924866/1‑150 (MQ=255) gATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCt < 2:1685628/140‑1 (MQ=255) gATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCt > 1:1685628/1‑140 (MQ=255) tcGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACCGTCgaag > 2:1222627/1‑150 (MQ=255) tcGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACCGTCgaag > 2:694483/1‑150 (MQ=255) tcGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACCGTCgaag > 2:703529/1‑150 (MQ=255) cagcgctGTCCAGGTAGCTGGACAACGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCt > 1:1937368/7‑135 (MQ=255) caccgctGTCCAGGTAGCTGGACAACGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCt < 2:1937368/129‑1 (MQ=255) cGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACTGTCgaaga < 2:1632505/150‑1 (MQ=255) cGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACCGTCgaaga > 1:11774/1‑150 (MQ=255) accgctGTCCAGGTAGCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACCGt > 1:1446233/6‑144 (MQ=255) accgctGTCCAGGTAGCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACCGt < 2:1446233/139‑1 (MQ=255) gAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACCGTCgaagaa < 1:1430424/150‑1 (MQ=255) ttGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCa > 1:265357/1‑95 (MQ=255) ttGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCa < 2:265357/95‑1 (MQ=255) tCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAA‑CAACTCACCTCTCCAGCAATAGCTGGTGCTCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACCGTCGAAGAATCGCAc > 1:717641/1‑150 (MQ=255) | CCGAAGACAATCAGCATGGCACCGCACCAGCCACCCTGCAGGCCTACGAACAGCAATATCTGGCCAGTGCCGACAAACGTAACAGCAGCTACTTGCAAGCCAAGGTACGCGAGCAGCATGACGGACTGGTGATCATCGAGTTGTCCAGCTACCTGGACAGCGGTGGCGCCCACGGCATGCCCGGGCGCGGCTTCATCAACTATTCACGCAAACTGGACAAGGTGCTGACC‑CTGCAGGACATGCTGGTGCCCGGCCAGGAAGACACCTTCTGGAAAACCGTCGAAGAATCGCAC > NC_002947/5592338‑5592630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |