| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,601,876 | C→A | 5.6% | D553Y (GAC→TAC) | PP_4924 ← | subtilase family serine protease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,601,876 | 0 | C | A | 5.6% | 227.9 / 2.4 | 72 | D553Y (GAC→TAC) | PP_4924 | subtilase family serine protease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/37); new base A (2/2); total (32/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
GCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGCGAGAAACCTCACCGCCAGTACTTCCCGGTC > NC_002947/5601728‑5602023 | gCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTcc > 2:134988/1‑150 (MQ=255) cACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCa < 1:113558/150‑1 (MQ=255) aCTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAg > 1:1695615/1‑150 (MQ=255) cTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGc < 1:1166870/150‑1 (MQ=255) tGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCg > 1:1613029/1‑150 (MQ=255) aCATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGTTGCCTTGa > 1:1568359/1‑150 (MQ=255) cATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAg < 1:1920359/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCa > 2:1864295/1‑150 (MQ=255) gcccgcccCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTg > 1:1191698/1‑150 (MQ=255) ccccgccGTGATAGGTGTTGCTGCCCCCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGa < 2:606001/150‑1 (MQ=255) gccgTGATAGTTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTa < 2:109747/150‑1 (MQ=255) gccgTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTa < 1:646265/150‑1 (MQ=255) gccgTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTa < 2:492585/150‑1 (MQ=255) ccgTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTTGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAg < 1:383141/150‑1 (MQ=255) cgTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGTTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAgg < 2:1568359/150‑1 (MQ=255) aTAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATTATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCt > 1:847347/1‑150 (MQ=255) tAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCtt < 2:656981/150‑1 (MQ=255) aGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTcc > 1:1906318/1‑110 (MQ=255) aGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTcc < 2:1906318/110‑1 (MQ=255) ggTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCg < 1:1864295/150‑1 (MQ=255) gtgtTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCACCTGCCTTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCgg < 2:15284/150‑1 (MQ=255) gtgtTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCgg < 1:1301461/150‑1 (MQ=255) gtgtTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCgg > 1:899151/1‑150 (MQ=255) gctgcCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGt > 1:1580285/1‑150 (MQ=255) ccaccgccaccAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGc > 1:257157/1‑150 (MQ=255) accgccaccAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGccc > 2:867216/1‑150 (MQ=255) accgccaccAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGccc > 2:1671126/1‑150 (MQ=255) ccaccaACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCtt < 2:1049378/150‑1 (MQ=255) aaccaGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAg > 2:772718/1‑121 (MQ=255) aaccaGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAg < 1:772718/121‑1 (MQ=255) aaccaGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGa > 2:942918/1‑150 (MQ=255) accaGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAg > 1:418925/1‑120 (MQ=255) accaGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAg < 2:418925/120‑1 (MQ=255) cTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTaga < 2:937046/150‑1 (MQ=255) cccTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTg > 1:668395/1‑150 (MQ=255) 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ccGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGATGATGTAAGAGCTTCGGATAGAGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACcctcct > 1:918464/1‑150 (MQ=255) cgcgGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTg < 2:1205683/150‑1 (MQ=255) cgcgCTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTg < 2:1763499/150‑1 (MQ=255) gcgGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTAAGACG‑AGCCCCACGGGGTTCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCCCCCTCCTgg < 2:50896/150‑1 (MQ=255) ggTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGc < 1:134988/150‑1 (MQ=255) tCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCt < 1:942918/150‑1 (MQ=255) aaGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGaa < 2:299289/120‑1 (MQ=255) aaGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGaa > 1:299289/1‑120 (MQ=255) atcatcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCg > 2:986240/1‑150 (MQ=255) atcatcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCg > 1:896640/1‑150 (MQ=255) atcatcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCg > 1:896657/1‑150 (MQ=255) tcatcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTTAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGa < 1:1866004/150‑1 (MQ=255) catcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGAt < 1:1671126/150‑1 (MQ=255) atcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGAtt > 1:1456406/1‑150 (MQ=255) tcGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTa > 2:1766623/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGAc < 1:867216/150‑1 (MQ=255) cgcgCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGAc < 1:986240/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACgg < 2:257157/150‑1 (MQ=255) gcTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGt < 2:1613029/150‑1 (MQ=255) tGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCATCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAAGCCCGTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGCTTACAGACGGTAt > 2:501620/1‑150 (MQ=255) tAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAg < 2:491393/49‑1 (MQ=255) tAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAg > 1:491393/1‑49 (MQ=255) gCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGCGAGaa < 2:1580285/150‑1 (MQ=255) gCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGA‑TACCGACGGTATCGGCGAGaaa > 1:478577/1‑150 (MQ=255) tggaCGCCGCAGCGCT‑CGGCGTACAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGa < 2:247449/80‑1 (MQ=37) tggaCGCCGCAGCGCT‑CGGCGTACAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGa > 1:247449/4‑83 (MQ=37) tggaCGCCGCAGCGCT‑CGGCGTACAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGCGAGAAACCTc > 2:861488/4‑150 (MQ=255) gCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAg > 1:1366688/1‑87 (MQ=255) gCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAg < 2:1366688/87‑1 (MQ=255) gCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGCGAGAAACCTCACCGc < 2:1601915/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGc > 2:649598/1‑127 (MQ=255) cTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGc < 1:649598/127‑1 (MQ=255) cggcgTACAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGCGAGAAACCTCACCGCCAGTACTTccc < 1:861488/150‑1 (MQ=255) cgTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGA‑TACCGACGGTATCGGCGAGAAACCTCACCGCCAGTACTTCCCGGTc < 2:478577/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTaga < 2:74717/76‑1 (MQ=255) | GCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCATCGCCCGCGCTGCCGTAAAGCGTCTGTACGCCG‑AGCGCTGCGGCGTCCAGCGTGCTGCCTTGAGCACTCTGGCTGATGTAGGCCCTTCGGGAAGTGGGCCCGCTTGACGAAGTCAGTAGAGTGCCACCCTCCTGGGCCTCGATCCGATTACCGACGGTATCGGCGAGAAACCTCACCGCCAGTACTTCCCGGTC > NC_002947/5601728‑5602023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |