| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1967188 = | 129 (0.530) | 33 (0.170) | 16/228 | 15.2 | 24.3% | intergenic (+15/+104) | PP_1762/yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | 1967284 = | 106 (0.560) | intergenic (+111/+8) | PP_1762/yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
CAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCGTGC > NC_002947/1967135‑1967431 | tgggggccggcGTGGGGGGGGGGCTTTGCGCTTGCGTGTACCGGCCTCTCGGGGGGGTTGCCCGCCCCCACCGGAACCCCCCACCCAACACGGTTGGCGCCCGGCGTGGGGGCGGGGGAAACCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTAtt < 2:1941590/146‑1 (MQ=255) aTGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCCGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTAtt < 2:2190112/150‑1 (MQ=255) aTGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTAtt < 2:4879413/150‑1 (MQ=255) gccggcGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCTCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGAGGCAGGTTTATTGGGCg > 2:5248065/1‑150 (MQ=255) gccggcGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGAATGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGGTGATTGGGCg > 2:5248155/1‑150 (MQ=255) ccggcGGTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTTCCCCCACCCACCGGCTGACCGCACCCCACAACGGGTTCGCCCAGCCTCTGGGGTCGGGCCAGCCCCCGAAGAGGCCGCTGCCGGGTTGTTGGGCGt > 2:279847/1‑150 (MQ=255) gggcGTTGGCGGGGGGCTGATCGCTTTCCTGTACGGGCCTCTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACCGGATCCCCGCAACCCTCACGGCTTGCGCCCGGCCTGTGGGCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGtt < 1:4897992/149‑1 (MQ=37) cggcGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCGTTCCCCCGCCCACAGGATAACCCCAAACCAAAAGGTTTGCCCCCCGCCGGTGGGAGCCGGCAACCCCCCGAAGAGGCCCATGCAGGGTTAGTTGGCGtt > 2:2428706/1‑150 (MQ=255) gggggCTGAGCGCTTTCCTGCACCGGCCTCTGCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCCGGAGCCCCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGGGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGcc < 2:2516876/148‑1 (MQ=37) gCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCGGCCTGTGGGAGCGGCCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTTTTGGGGGTTGGAAGCCAGCCCGtt > 2:3930551/1‑150 (MQ=37) gcGCTTTCCGGTCCCGGCCTCTGCGCGGGCTTGCCCGCCCCCACCGGATCACCGCACCCCACACGTATGGCGCCCGGCCTGGGGGAGGGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCAccc < 2:4028837/149‑1 (MQ=255) cTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCGCGCCCGCCCCCACCGGATCCCCGCAACCCCCACGGATGGCGCCCGGCCTGTGGGAGCGGGCAACCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCtg < 1:3229084/150‑1 (MQ=38) tttCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACCGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCGGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGGTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCagt > 2:3015783/1‑150 (MQ=255) cTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCACCGGCTCACCCCAACCCGCAAGGATTGCGCCCTGCCGGGGGGTGCGGGCCCCCCCGCGCAGCGGCCGCGGGCGGGTTATTGGGGGGTGGACGCCAGCCCGGTGACCCCGGTGcgg > 2:2550342/1‑148 (MQ=255) gtcccGGCCTCTGGGGGGGCTGGCCCGCTCCAACAGGAACCCCGCAACCCTCACGTATGGCGCCCTGCCTGTGGGAGGGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTc < 2:1029072/147‑1 (MQ=255) cGGCCGCTGGGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCCGGACCACCGCAACCCTCACGGATGCCGCCCTGCGTGTGGGCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGc < 1:3966969/150‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTTCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGCAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCGGTGCTGTCCGGcc > 2:3085370/1‑150 (MQ=255) ggCCTCTCCGCGGGCTTGCCCGCCCCCCCAGGATCACCGCACCCCTCACGGATTGCGCCCGGCCTGTGGGCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGcc < 2:4201500/150‑1 (MQ=38) tctTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCGGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGGTTATTGGGCGTTGAACGCCAGCCCGTTCACCCCAGTGCTGTCCGGCCCCAt > 2:3562799/1‑150 (MQ=255) ctTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCGGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATc > 2:2669503/1‑150 (MQ=14) gggttgccccGCCCCCCCCGCACCACCCCAACCCACACGGTTGGCGCCCGGCGGGTGGGCGGGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtac < 1:2999160/143‑1 (MQ=255) gggggggcccgcccCCCCCGGACCCCCGCACCCCTCCTGGTTGGCCCCGGGCGTGGGGGCGCGGCACCGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtac < 1:4688661/144‑1 (MQ=255) gggCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCAGcaggtac > 2:3305855/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtacaggt > 1:3058342/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATca > 1:3010181/1‑138 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAggtacaggtaca > 2:1858086/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCGGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTCCAGGTacac > 1:2513254/1‑150 (MQ=17) ccGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTacac > 2:3233767/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTacac > 2:2211694/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCg > 1:3481537/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGc > 2:317580/1‑150 (MQ=255) cccACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCa > 1:1827525/1‑150 (MQ=255) cccACAGCATCACCGCAACCCTCAAGGCTTGCGCCCGGCCTGTGGGCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCa < 2:84164/150‑1 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGc > 1:4254253/1‑123 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg > 2:1404065/1‑150 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg > 2:3039674/1‑150 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg > 2:1942644/1‑150 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg > 1:3678742/1‑150 (MQ=255) 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acaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGa > 2:3934649/1‑150 (MQ=255) aGGATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGGTGAACGCCAGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGAtc > 2:668128/1‑150 (MQ=255) gATCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGAtctc > 1:4431960/1‑150 (MQ=255) tCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCtt > 2:4045464/1‑150 (MQ=255) tCACCGCAACCCTCAAGGATTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCtt > 2:4740828/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |