| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_002947 | 6,098,326 | (CAAGCTGCG)2→1 | coding (811‑819/867 nt) | PP_5350 ← | RpiR family transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_002947 | 6098315 | 6098323 | 9 | 92 [1] | [0] 91 | PP_5350 | RpiR family transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 6098324 = | 0 (0.000) | 78 (1.700) | 58/244 | 0.0 | 100% | coding (821/867 nt) | PP_5350 | RpiR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 6098314 | 0 (0.000) | coding (831/867 nt) | PP_5350 | RpiR family transcriptional regulator | |||||
TTCGCGGGCTTGCCCCGTTCACACAGGAATTGCACCGATTTATAGAAGTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAACAGGCCAGTACAGGTTGAATTCAGTCGTCGGTAGCCTTGATCGACTTGGGCGACAGACGCAAGCTGCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAG‑GTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGCACGTCG > NC_002947/6098175‑6098470 | accggcctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagac < 1:444987‑M1/1‑1 (MQ=255)accgccctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagac > 1:660025‑M1/150‑150 (MQ=255) gcctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCaa > 2:1456‑M1/146‑150 (MQ=255) gcctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCaa < 1:165680‑M1/5‑1 (MQ=255) cctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAg < 1:1189713‑M1/6‑1 (MQ=255) tcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCt < 2:717416‑M1/8‑1 (MQ=255) tcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCt < 2:581502‑M1/8‑1 (MQ=255) ttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGc > 1:674519‑M1/141‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) tgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAG‑GTCAGTGGGGTGTAGATCTCgg > 1:402828‑M1/21‑150 (MQ=255) gatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAG‑GTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgt > 1:46906‑M1/20‑150 (MQ=255) gatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAG‑GTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgt > 1:1038920‑M1/20‑150 (MQ=255) acttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCa < 2:1107154‑M1/73‑1 (MQ=255) acttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCa > 1:1107154‑M1/15‑87 (MQ=255) tgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAG‑GTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCAt > 2:579626‑M1/12‑150 (MQ=255) agaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATAACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGTGTGTG‑GGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGCACGTCg < 1:374292‑M1/147‑1 (MQ=255) | TTCGCGGGCTTGCCCCGTTCACACAGGAATTGCACCGATTTATAGAAGTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAACAGGCCAGTACAGGTTGAATTCAGTCGTCGGTAGCCTTGATCGACTTGGGCGACAGACGCAAGCTGCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAG‑GTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGCACGTCG > NC_002947/6098175‑6098470 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |