| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,470,656 | Δ1 bp | 7.6% | coding (178/1182 nt) | PP_2165 → | two‑component system response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,470,656 | 0 | C | . | 7.6% | 206.4 / 11.7 | 66 | coding (178/1182 nt) | PP_2165 | two‑component system response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/29); new base . (3/2); total (35/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.72e-01 | |||||||||||
GACGACGTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCAAGCCGCTGGAA > NC_002947/2470518‑2470805 | gacgacgTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGggc > 1:316015/1‑150 (MQ=255) gacgTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATTCCGCAGATGggcggc < 1:1139372/150‑1 (MQ=255) tCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAAc < 2:99099/150‑1 (MQ=255) tCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAAc < 2:201609/150‑1 (MQ=255) tCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGATTCAAAAGTGCTAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAAc > 1:1043836/1‑150 (MQ=255) gTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGa < 1:480381/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATcc > 1:465952/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTAATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCgtca < 1:554065/150‑1 (MQ=255) ccgccTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCgtcaggtca < 1:480078/150‑1 (MQ=255) cTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCagcga > 1:900361/1‑150 (MQ=255) ttGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGTCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTg > 1:479329/1‑150 (MQ=255) ttGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTTTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTg > 2:479210/1‑150 (MQ=255) gAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGCGGCATG‑CGCAGAtcgca > 2:40638/1‑110 (MQ=255) gAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGCGGCATG‑CGCAGAtcgca < 1:40638/114‑5 (MQ=255) tGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGtt < 2:316015/150‑1 (MQ=255) tGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACAAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGtt > 2:176238/1‑150 (MQ=255) tttCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTg > 2:258806/1‑137 (MQ=255) tttCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTg < 1:258806/137‑1 (MQ=255) tttCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGcc > 1:793851/1‑150 (MQ=255) tttCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGcc > 2:875807/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCg < 2:465952/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGt > 1:1056864/1‑150 (MQ=255) gCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGTCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGa < 2:479329/150‑1 (MQ=255) ctccAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtg < 1:344925/150‑1 (MQ=255) ctccAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtg > 1:683832/1‑150 (MQ=255) ctccAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtg < 1:108547/150‑1 (MQ=255) ctccAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCCCTGACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtg < 1:32331/150‑1 (MQ=255) tccAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCgtgg > 1:1146253/1‑150 (MQ=255) ccGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCTGACAAGGATAGCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCg < 2:675649/150‑1 (MQ=255) ggTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGt > 2:742468/1‑150 (MQ=255) agcagGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGAACTAGTGATCTGCGGTCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTTCGGTGCCGGCGTCa > 1:543606/1‑150 (MQ=255) agGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGa < 2:900361/150‑1 (MQ=255) cAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCg < 1:1072347/150‑1 (MQ=255) cAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCg > 2:1072347/1‑150 (MQ=255) gTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTgcg > 1:101977/1‑96 (MQ=255) gTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTgcg < 2:101977/96‑1 (MQ=255) ttCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGaa > 1:490784/1‑150 (MQ=255) ttCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGaa > 1:841343/1‑150 (MQ=255) tCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAg > 1:95672/1‑150 (MQ=255) aagaaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATc > 1:94058/1‑107 (MQ=255) aagaaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATc < 2:94058/107‑1 (MQ=255) aagaaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTc > 1:854394/1‑115 (MQ=255) aagaaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTc < 2:854394/115‑1 (MQ=255) agaaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGtt < 1:742468/150‑1 (MQ=255) gaaCACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCAATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTg > 1:1140283/1‑150 (MQ=255) gCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTggg > 1:885562/1‑150 (MQ=255) cccGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGgc < 1:467605/150‑1 (MQ=255) cccGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGACTGATGCGGTGTAAGCGTTGCGCCTGGgc < 1:479210/150‑1 (MQ=255) tccaCCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGgcg > 2:312287/4‑150 (MQ=255) cGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGGGTCATTAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGgcgc > 2:136860/1‑150 (MQ=255) cGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGtt > 2:173740/1‑138 (MQ=255) cGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGtt < 1:173740/138‑1 (MQ=255) gACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGt > 1:573335/1‑128 (MQ=255) gACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGt < 2:573335/128‑1 (MQ=255) aCCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGcgccg > 1:1238482/1‑150 (MQ=255) ccTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTg > 2:197231/1‑127 (MQ=255) ccTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTg < 1:197231/127‑1 (MQ=255) cGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGa < 1:176238/150‑1 (MQ=255) tgcgatctgc‑gCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCtc > 1:889966/1‑150 (MQ=255) gcccatctgcgGCATG‑CGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTTGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCtc > 2:799881/5‑150 (MQ=255) ccatctgcgGCATG‑CGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTgc < 2:517090/123‑1 (MQ=255) ccatctgcgGCATG‑CGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTgc > 1:517090/3‑125 (MQ=255) tgc‑gCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCAAGc < 2:889966/150‑1 (MQ=255) cATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCAAGCCGCt < 2:885562/150‑1 (MQ=255) cATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCAAGCCGCt < 1:312287/150‑1 (MQ=255) cATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACAACCTCATCAAGCCGCt > 2:362414/1‑150 (MQ=255) ccGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCAAGCCGCTGGaa < 2:1056864/150‑1 (MQ=255) | GACGACGTGGTCCGTGCCAGCCTCGCCGCCTATCTTGAAGACAGTGGTTTCAGCGTCCTCCAGGCCGGTAATGGCCAGCAGGGGCTTCAGGTCTTCGAAGAACACCAGCCCGACCTCGTGATCTGCGATCTGC‑GCATGCCGCAGATGGGCGGCCTCGAACTGATCCGTCAGGTCAGCGAGCGTGCGCCGCAGTTGCCGGTGATCGTGGTGTCCGGTGCCGGCGTCATGAGTGATGCGGTGGAAGCGTTGCGCCTGGGCGCCGCCGACTACCTCATCAAGCCGCTGGAA > NC_002947/2470518‑2470805 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |