| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 378,092 | Δ1 bp | 5.5% | intergenic (+32/+33) | PP_0314 → / ← gbcA | hypothetical protein/glycine‑betaine dioxygenase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 378,092 | 0 | T | . | 5.5% | 219.9 / 5.9 | 73 | intergenic (+32/+33) | PP_0314/gbcA | hypothetical protein/glycine‑betaine dioxygenase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/36); new base . (2/2); total (35/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
CTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATA > NC_002947/377943‑378241 | cTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGt > 2:537018/1‑150 (MQ=255) tCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGACACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAGGCGCCATGCTTCGGTc < 1:759062/150‑1 (MQ=255) gCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGATATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCtgctg‑c < 1:425052/150‑1 (MQ=255) cacaGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCg > 2:294653/1‑150 (MQ=255) ttttGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCa > 1:597065/1‑150 (MQ=255) tGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGG‑CAGCAGACCGAAGCATgg < 2:710952/150‑1 (MQ=255) gCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGt > 2:1209743/1‑150 (MQ=255) gCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGt < 1:537018/150‑1 (MQ=255) gCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGt < 1:919873/150‑1 (MQ=255) tGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATc > 2:734538/1‑150 (MQ=255) gCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGt < 2:975292/150‑1 (MQ=255) ttACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGATC‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTtac < 1:998408/150‑1 (MQ=255) gATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTg > 1:232319/1‑150 (MQ=255) gCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGG‑CAGCAGACCGAAGCATGGCgcttt < 1:1277848/130‑5 (MQ=38) gCAACGTCGTCTGACGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGG‑CAGCAGACCGAAGCATGGCgcttt > 2:1277848/1‑126 (MQ=37) tcgtcTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCActt > 2:1197733/1‑150 (MQ=255) gtcTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATTAGTTAATACTGCGCCTGCActtct > 1:984481/1‑150 (MQ=255) gtcTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCActtct > 2:262226/1‑150 (MQ=255) tGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCtttt > 2:155294/1‑149 (MQ=255) cGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAgg < 1:262226/150‑1 (MQ=255) aGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTa < 2:984481/150‑1 (MQ=255) gcgcTATCCCCTACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGgc < 2:597065/150‑1 (MQ=255) gcgcTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAg > 2:1278476/1‑143 (MQ=255) gcgcTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAg < 1:1278476/143‑1 (MQ=255) gcTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGgcgc < 1:294653/150‑1 (MQ=255) tCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTgcgc > 2:667224/1‑122 (MQ=255) tCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTgcgc < 1:667224/122‑1 (MQ=255) ccATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTgcgc > 2:413328/1‑120 (MQ=255) ccATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTgcgc < 1:413328/120‑1 (MQ=255) tACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGc < 1:1209743/150‑1 (MQ=255) aCAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGcc > 2:1061139/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCggg > 2:662420/1‑94 (MQ=255) aGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCggg < 1:662420/94‑1 (MQ=255) cGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATgg > 2:933652/1‑87 (MQ=255) cGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATgg < 1:933652/87‑1 (MQ=255) tGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGgtt < 1:1061139/150‑1 (MQ=255) ttATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAg > 1:791112/1‑143 (MQ=255) ttATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTCCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAg < 2:791112/143‑1 (MQ=255) tATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCa < 2:394525/150‑1 (MQ=255) tATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCGGCCCCCAGGTTGTTCa < 2:232319/150‑1 (MQ=255) aTGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGTGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAg > 2:301589/1‑150 (MQ=255) gagaTACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCa > 1:923378/1‑150 (MQ=255) aTACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTACCCCCAGGTTGTTCAGCAcgc > 1:1060715/1‑150 (MQ=255) gtacgGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTctgc < 1:1098149/56‑1 (MQ=255) gtacgGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTctgc > 2:1098149/1‑56 (MQ=255) gtacgGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAg > 2:98448/1‑132 (MQ=255) gtacgGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAg < 1:98448/132‑1 (MQ=255) gtacgGGAGTACAGCCTTGAGACGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGccc > 2:1130926/1‑150 (MQ=255) gAGTCCAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGGCAGGGCGATGCTACGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGAGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGCCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCGCGCGCCCGCGGTa > 2:485904/1‑150 (MQ=255) gAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTACCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTa < 2:1060715/150‑1 (MQ=255) tACAGCCTTGAGACGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCa < 1:1130926/150‑1 (MQ=255) aGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCttt > 2:1217252/1‑93 (MQ=255) aGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCttt < 1:1217252/93‑1 (MQ=255) ttGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCTCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATg > 2:1090900/1‑150 (MQ=255) agaTGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAg < 1:734538/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTca < 1:468314/150‑1 (MQ=255) aGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGTCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGCTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTcacc < 1:485904/150‑1 (MQ=255) gtgtGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGc < 2:1159092/47‑1 (MQ=255) gtgtGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGc > 1:1159092/1‑47 (MQ=255) gtgtGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATgg > 1:578386/1‑85 (MQ=255) gtgtGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATgg < 2:578386/85‑1 (MQ=255) tgtgAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTcaccacacc < 1:912966/150‑1 (MQ=255) tgcacccgcCATGCTTCGG‑CAGCAGACCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCAAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCaa > 2:172416/7‑150 (MQ=38) aaaGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAAc > 1:274002/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAAc > 1:532613/1‑150 (MQ=255) aGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGTGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTc < 1:301589/150‑1 (MQ=255) cgcCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGt < 1:859983/150‑1 (MQ=255) gcCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAg < 2:567768/69‑1 (MQ=255) gcCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAg > 1:567768/1‑69 (MQ=255) ccATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCTCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAGGTTCACCACACCAAACTCGTaa < 1:155294/150‑1 (MQ=255) aTGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGt > 1:507710/1‑150 (MQ=255) ttCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTc > 2:477989/1‑150 (MQ=255) tCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCAcgc < 2:994817/99‑1 (MQ=255) tCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCAcgc > 1:994817/1‑99 (MQ=255) tCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATa > 2:430681/1‑150 (MQ=255) | CTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTG‑CCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATA > NC_002947/377943‑378241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |