New junction evidence | |||||||||||
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GGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTT > NC_002947/254532‑254828 | caaccgcctgctcggcctgtatacccgcatcaagtatggcaaagccgctaccgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagatcaa > 2:260841‑M1/149‑150 (MQ=255) gTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAag < 2:712056/150‑1 (MQ=255) tGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAagg < 2:561290/150‑1 (MQ=255) gACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAaggc > 1:42811/1‑150 (MQ=255) cgcctgctcggcctgtatacccgcatcaagtatggcaaagccgctaccgaaaccctgcgcgaactggtagccatccccaccttcaatgtcgagggtacgccgcagtacgaaaaccctgaattcctcaagatcgccgacaagataAaggcc < 2:1045856‑M1/6‑1 (MQ=255) ccTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAaggcca > 2:737500/1‑150 (MQ=255) cTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAaggcca‑g < 1:1109641/150‑1 (MQ=255) tGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGTATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAaggcca‑ggc < 2:1008207/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAaggc > 2:939299/1‑137 (MQ=255) tCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAaggc < 1:939299/137‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCgg < 2:1084724/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTc < 2:665339/150‑1 (MQ=255) aGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCg < 2:1129505/150‑1 (MQ=255) 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2:270874/150‑1 (MQ=255) acCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCg > 1:462742/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTa < 1:733484/90‑1 (MQ=255) ccGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTa > 2:733484/1‑90 (MQ=255) ccGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTc > 1:1271313/1‑135 (MQ=255) ccGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTc < 2:1271313/135‑1 (MQ=255) ccGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGt > 1:770597/1‑150 (MQ=255) gTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGc > 1:72086/1‑150 (MQ=255) ttGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCg > 1:1241440/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTg < 2:1241440/150‑1 (MQ=255) cGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGCGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATAc < 1:674884/150‑1 (MQ=255) ggAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGaa > 2:1040979/1‑97 (MQ=255) ggAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGaa < 1:1040979/97‑1 (MQ=255) ggAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACt < 2:1224713/150‑1 (MQ=255) ggAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACt < 1:846223/150‑1 (MQ=255) ggAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACt > 1:509728/1‑150 (MQ=255) ggAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACt < 1:911233/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACtt < 1:386882/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACtt < 1:387515/150‑1 (MQ=255) | GGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGATCACTTCCTTCCCGCTGCCCAGTGAGATCTCGTACACCCGGTTGTCGATGTTGCGGAAGGCCA‑GGCCGAAGCGGTCGGCCAAGGCCTTGATCTTGTCGGCGATCTTGAGGAATTCAGGGTTTTCGTACTGCGGCGTACCCTCGACATTGAAGGTGGGGATGGCTACCAGTTCGCGCAGGGTTTCGGTAGCGGCTTTGCCATACTT > NC_002947/254532‑254828 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |