| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 413997 = | 80 (1.630) | 11 (0.290) | 10/194 | NT | 18.6% | intergenic (+14/‑189) | glnE/waaF | glutamate‑ammonia‑ligase adenylyltransferase/ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II |
| ? | NC_002947 | 414083 = | 34 (0.890) | intergenic (+100/‑103) | glnE/waaF | glutamate‑ammonia‑ligase adenylyltransferase/ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GAAGTGTACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAGGCCAGGCTGT > NC_002947/413849‑414145 | gAAGTGTACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTa < 1:563723/150‑1 (MQ=255) ccatgtcgccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTAtt > 2:1240367‑M1/147‑150 (MQ=255) gtACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTcgc < 1:471266/150‑1 (MQ=255) aCAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCgg < 1:58692/150‑1 (MQ=255) aaaGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGc > 1:756390/1‑150 (MQ=255) gacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAg > 2:24426‑M1/137‑150 (MQ=255) gCGTTCCGCTCGGCCGTCCCCCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCGTGGGGCATCTATGCTGCACAGTTTGCCGATAAACTCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAACTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAg < 2:393258/150‑1 (MQ=255) gTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGcc > 2:1135893/1‑150 (MQ=255) cccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGcc > 2:744418‑M1/135‑150 (MQ=255) ttCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGccc > 2:764402/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGCGTTGGGTATACACGAATTCGGCCGTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGccc > 2:103024/1‑148 (MQ=255) gCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTc < 1:1057481/150‑1 (MQ=255) cgcGGCCTCCCGCCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTcc < 1:463887/148‑1 (MQ=255) cTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGGTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAgg > 2:925279/1‑150 (MQ=255) tCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGt > 2:393747/1‑150 (MQ=255) tCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGt > 2:703996/1‑150 (MQ=255) tCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATGCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGt < 1:998384/150‑1 (MQ=255) ccACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTAc > 2:810943/1‑150 (MQ=255) 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< 2:243242‑M1/13‑1 (MQ=255) tcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcatcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGc < 2:1247187‑M1/34‑1 (MQ=255) ccAGGCCGTGCAGACGGAGGCCGGGGTGCTGGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGcaca < 1:1182839/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGcaca > 2:6185/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGATTGcaca > 1:897115/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGcc > 1:858364/1‑150 (MQ=255) 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gTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCggg > 1:570163/1‑126 (MQ=255) gTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCggg < 2:570163/126‑1 (MQ=255) aaGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTg < 1:810943/150‑1 (MQ=255) ccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggctTATTCGCGGGCAAGCCCGCTcc > 1:635244‑M1/51‑72 (MQ=255) ccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggctTATTCGCGGGCAAGCCCGCTcc < 2:635244‑M1/22‑1 (MQ=255) ccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATccc > 2:24604‑M1/51‑110 (MQ=255) ccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATccc < 1:24604‑M1/60‑1 (MQ=255) 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gTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAat > 1:345291/1‑150 (MQ=255) gTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAat < 2:311631/150‑1 (MQ=255) aGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATa > 2:338751/1‑105 (MQ=255) aGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATa < 1:338751/105‑1 (MQ=255) gCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACGGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAg < 1:288510/137‑1 (MQ=255) gCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACGGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAg > 2:288510/1‑137 (MQ=255) gCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGt > 2:65353/1‑116 (MQ=255) gCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGt < 1:65353/116‑1 (MQ=255) tGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAagag < 2:345291/150‑1 (MQ=255) gATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAgg < 2:58658/150‑1 (MQ=255) gtgtTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCtt > 1:214763/1‑84 (MQ=255) gtgtTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCtt < 2:214763/84‑1 (MQ=255) gCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATaaa > 1:507673/1‑134 (MQ=255) gCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATaaa < 2:507673/134‑1 (MQ=255) | GAAGTGTACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAGGCCAGGCTGT > NC_002947/413849‑414145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |