New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1444636 | 50 (1.020) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 6.7% | coding (253/1530 nt) | PP_1263 | fusaric acid resistance protein |
? | NC_002947 | = 1444681 | 62 (1.270) | coding (298/1530 nt) | PP_1263 | fusaric acid resistance protein |
GCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGT > NC_002947/1444498‑1444785 | gCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGcc > 2:238488/1‑150 (MQ=255) aaTACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCa > 1:255760/1‑150 (MQ=255) ccTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAgcgc > 2:483994/1‑150 (MQ=255) ttGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCgg < 2:28444/150‑1 (MQ=255) gACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGaa < 1:1148380/150‑1 (MQ=255) gcgGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGcc < 1:1224164/150‑1 (MQ=255) cgGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCa > 2:756867/1‑150 (MQ=255) gCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAg < 1:1131026/150‑1 (MQ=255) cATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCAAAGGc > 2:354403/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCcggccatggccttggcttcgcgcacccgcgctgcggccatgg > 2:890548‑M1/1‑108 (MQ=255) gcgAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATgg > 2:328669/1‑150 (MQ=255) cgcgACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAGGCCAAGGCCATGGCCGgtgt > 1:872295/1‑150 (MQ=255) cgACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCcggccatggccttggcttcgcgcacccgcgctgcggccatggccaggcttg < 1:890548‑M1/150‑52 (MQ=255) aCTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTc < 2:286246/150‑1 (MQ=255) tGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGa < 2:527450/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTcc < 1:504965/150‑1 (MQ=255) cagcagTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAg > 1:1025879/1‑150 (MQ=255) cagcagTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAg < 1:740605/150‑1 (MQ=255) gcagTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGc < 2:255760/150‑1 (MQ=255) gtggtgGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCaa > 2:761359/1‑150 (MQ=255) ggtggCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCAGGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACg < 1:238488/150‑1 (MQ=255) tggCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggc < 1:823866/150‑1 (MQ=255) gCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGGCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggcca > 2:938337/1‑150 (MQ=255) gCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggcca > 2:315946/1‑150 (MQ=255) cACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggccag < 1:473821/150‑1 (MQ=255) aCGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggccagg < 1:1126152/150‑1 (MQ=255) gACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCcggccatggccttggcttcgcgcacccgcgctgcggccatggcca < 1:220980‑M1/97‑46 (MQ=255) gACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCcggccatggccttggcttcgcgcacccgcgctgcggccatggcca > 2:220980‑M1/1‑52 (MQ=255) aCCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAgc < 1:756867/150‑1 (MQ=255) cTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGcc > 2:84214/1‑150 (MQ=255) gCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACaa < 1:498097/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGcc > 2:244976/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGcc < 2:1096149/150‑1 (MQ=255) cGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCg < 2:585959/150‑1 (MQ=255) tGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGaa < 1:761359/150‑1 (MQ=255) gTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGTGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGAc < 1:544061/150‑1 (MQ=255) gTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGAc < 1:315946/150‑1 (MQ=255) cccTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGt > 1:813577/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGtt > 2:195205/1‑150 (MQ=255) ggccgtggccgGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTa < 2:1228523/150‑1 (MQ=255) gccgtggccgGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTAt < 2:364523/150‑1 (MQ=255) gccgGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCt < 1:354403/150‑1 (MQ=255) aGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGgcgcg < 1:328669/150‑1 (MQ=255) cccAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggccag > 2:746261/1‑94 (MQ=255) cccAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggccag < 1:746261/94‑1 (MQ=255) cccAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGgc > 2:88070/1‑145 (MQ=255) cccAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGgc < 1:88070/145‑1 (MQ=255) cccAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACACTCAAGCCCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCt > 2:375929/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGaa > 1:380447/1‑123 (MQ=255) ccAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGaa < 2:380447/123‑1 (MQ=255) ccAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTg > 2:1204721/1‑150 (MQ=255) ccaGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGt < 1:440603/148‑1 (MQ=255) cAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGggcttgggctaccggccacggccagggtaacccagcggtccagctgagggtcaccataggcgtgccaccactgctggtcgggccagtgagcgtcagtcg < 1:890548‑M2/150‑100 (MQ=255) cAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggc < 2:1045182/89‑1 (MQ=255) cAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggc > 1:1045182/1‑89 (MQ=255) cAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGt > 1:140056/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGCGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCg > 1:1220436/1‑150 (MQ=255) cTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGt < 1:938337/150‑1 (MQ=255) cTGGCCATGCCAGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCCTGCTGTTTATCATGCGCCAGGCAAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGCCCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGt < 1:1055180/150‑1 (MQ=255) | GCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGT > NC_002947/1444498‑1444785 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |