| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2056021 | 54 (1.100) | 5 (0.120) | 5/218 | NT | 8.5% | intergenic (+27/‑116) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 2056095 | 61 (1.430) | intergenic (+101/‑42) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein | |||||
CATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGC > NC_002947/2055874‑2056169 | cATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTaa > 1:313721/1‑150 (MQ=255) tCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 2:1152657/1‑150 (MQ=255) gTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg > 2:749231/1‑150 (MQ=255) gTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGAACACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 2:1108995/150‑1 (MQ=255) cACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 1:585828/1‑150 (MQ=255) aTTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTg < 1:707160/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTggg < 1:747600/150‑1 (MQ=255) tgatgGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGAGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCACCTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGTATATCACTGcc > 1:1224912/1‑150 (MQ=255) ccATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCACGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCCTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATAACACTGCCCTCAgg > 2:652319/1‑150 (MQ=255) atggCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATCCCCCGGTGTTGGGCCAGCGCCGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTg < 2:1004236/147‑1 (MQ=255) tGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCAACATTGGCATTTCACTTCCCGCTGGTGCa < 2:79953/150‑1 (MQ=255) cGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGt < 2:585828/150‑1 (MQ=255) ttGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgaggg > 1:1221115‑M1/1‑105 (MQ=255) tGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAgg > 2:266144/1‑150 (MQ=255) tGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAgg > 1:106803/1‑150 (MQ=255) gACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGt < 1:686187/150‑1 (MQ=255) accTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGaaa > 1:971023/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCAAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAAt > 2:1139151/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCACTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATcc > 1:892869/1‑150 (MQ=255) ctgcGCCACCGTGCGCAGAATGCCGCTCGTCAATTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCcgc < 1:966154/150‑1 (MQ=255) ctgcGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCcgc < 1:266144/150‑1 (MQ=255) cACTGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCTCGTAGGa > 1:248296/1‑150 (MQ=255) ccGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagc < 2:1221115‑M1/150‑69 (MQ=255) ccGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGc < 2:971023/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCgg < 2:1120193/150‑1 (MQ=255) gcgcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGt < 1:1139151/150‑1 (MQ=255) gcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTc > 1:509537/1‑150 (MQ=255) gcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTc > 1:670906/1‑150 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa < 2:763330‑M2/150‑10 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 2:356321‑M2/1‑141 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 1:1152657‑M2/1‑141 (MQ=255) gATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaag < 2:861324‑M2/150‑11 (MQ=255) gATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaag < 1:1263371‑M2/150‑11 (MQ=255) tgCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggc < 2:868352‑M2/150‑15 (MQ=255) cAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGTCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgg < 1:1195308‑M1/130‑71 (MQ=255) cAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGTCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgg > 2:1195308‑M1/1‑60 (MQ=255) cAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccg < 1:1165379‑M2/150‑17 (MQ=255) cAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccg > 1:1237497‑M2/1‑134 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 1:1065336/1‑63 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:1065336/63‑1 (MQ=255) aGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:337169/62‑1 (MQ=255) aGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 1:337169/1‑62 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCTAGCGCTGATCCACCTGCAACGGCCTCTTCGCCGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg < 1:1036253/150‑1 (MQ=255) tACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg < 1:651567/148‑1 (MQ=255) tACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg > 2:651567/1‑148 (MQ=255) aCCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttg < 2:347320‑M1/150‑100 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc > 2:581999/1‑150 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGAAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc > 1:7490/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTcccc < 2:509537/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCcac < 1:545624/150‑1 (MQ=255) tGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACaa < 2:106803/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCCAGGCCTGGTCCAACAGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGGGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAg < 1:652319/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAg < 1:868352/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAgg < 1:749231/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAcc > 2:1072366/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAcc > 2:591621/1‑150 (MQ=255) aGCGCTGATCCAACTGCAAAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAcccc < 2:631453/150‑1 (MQ=255) gcgcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCa < 1:1063871/150‑1 (MQ=255) gcgcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCa < 2:1165379/150‑1 (MQ=255) gcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAgg < 1:1208815/140‑1 (MQ=255) gcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAgg > 2:1208815/1‑140 (MQ=255) tGAGCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGAATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCGATCGCATGCa > 1:54223/1‑150 (MQ=39) gagccAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGACATCCGCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCaa < 1:914386/147‑1 (MQ=255) tCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAAcc > 2:431846/1‑150 (MQ=255) ccAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAAccc > 1:1189413/1‑150 (MQ=255) cAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggt < 2:347320‑M2/150‑52 (MQ=255) cTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCca < 2:1057126/125‑1 (MQ=255) cTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCca > 1:1057126/1‑125 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttg > 1:1237497‑M1/1‑16 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttg < 1:1165379‑M1/150‑135 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTg < 1:591621/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgca < 2:868352‑M1/150‑137 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATc > 2:581971/1‑141 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATc < 1:581971/141‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatc < 1:1263371‑M1/150‑141 (MQ=255) ctTCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatc < 2:861324‑M1/150‑141 (MQ=255) ttCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcg < 2:763330‑M1/150‑142 (MQ=255) ttCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcg > 2:356321‑M1/1‑9 (MQ=255) ttCGCGGGTgaacccgctcctacgcggatttcaccctgtcactgcacctgagggcagtgatatcccaatgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgttgcagttggatcagcgctggcccagcaccggggtattcacttgcacatcg > 1:1152657‑M1/1‑9 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCt > 2:564902/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTc < 2:835302/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTc < 1:581999/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCa < 1:763330/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGc < 2:892869/150‑1 (MQ=255) | CATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGC > NC_002947/2055874‑2056169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |