New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3552788 = | 47 (0.960) | 4 (0.080) | 4/240 | NT | 8.6% | coding (402/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
? | NC_002947 | 3552814 = | 40 (0.850) | coding (428/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
CTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCGGAACTGTGCGTGCGTTTGCGGGCC > NC_002947/3552639‑3552935 | cTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGc < 1:1028705/150‑1 (MQ=255) agccagtcgccagactttccagccgcgggcccgcaaacgcacgcacagttccggctcttctccggcgatcaggtcaggacggaagccacccacggcagcaaaggcgtctgcccgcatcagcgcatcgccgccacaggccttggcctcacc < 2:486599‑M1/1‑1 (MQ=255) ggTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCCCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTgcgcca < 2:18150/150‑3 (MQ=255) ccagtcgccagactttccagccgcgggcccgcaaacgcacgcacagttccggctcttctccggcgatcaggtcaggacggaagccacccacggcagcaaaggagtctgcccgcatcagcgcatcgccgccacaggccttggcctcacCGa > 1:297684‑M1/148‑150 (MQ=255) tACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGAcc > 2:64589/1‑150 (MQ=255) gtcgccagactttccagccgcgggcccgcaaacgcacgcacagttccggctcttctccggcgatcaggtcaggacggaagccacccacggcagcaaaggcgtctgcccgcatcagcgcatcgccgccacaggccttggcctcaccgcccg > 1:735393‑M1/145‑146 (MQ=255) aCAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCt > 2:345294/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGa < 2:987108/150‑1 (MQ=255) cgtcgATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTg < 1:591927/150‑1 (MQ=255) gtcgATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTgg < 1:64589/150‑1 (MQ=255) gCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATAccc > 2:647211/1‑150 (MQ=255) tGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtc > 1:1215145/1‑150 (MQ=255) gAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcggt > 1:426647/1‑150 (MQ=255) gAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcggt < 1:150337/150‑1 (MQ=255) gTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAg > 2:1161337/1‑150 (MQ=255) tGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAgg < 2:908170/150‑1 (MQ=255) aTGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCa > 2:340169/1‑150 (MQ=255) aTGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCa > 2:340840/1‑150 (MQ=255) gCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAg < 2:426647/150‑1 (MQ=255) gctggcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTgg < 2:552508/150‑1 (MQ=255) tggcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTggcg > 2:1009452/1‑150 (MQ=255) gcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATAccc < 1:609431/121‑1 (MQ=255) gcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATAccc > 2:609431/1‑121 (MQ=255) aCGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGAt < 2:242442/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGACgc < 1:1009452/150‑1 (MQ=255) cgcAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATgcgc < 2:1276139/150‑1 (MQ=255) ggCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGAt < 1:647211/150‑1 (MQ=255) ggCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGAt > 2:1188456/1‑150 (MQ=255) tttCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCgg < 2:198554/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCAGGGCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCa > 1:462463/1‑150 (MQ=255) ttGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGCGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAg > 1:236094/1‑150 (MQ=255) agcagcACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACg < 2:479935/150‑1 (MQ=255) ggtcaggacggaagccacccacggcagcaaaggcgtctgcccgcatcagcgcatcgccgccacaggccttggcctcacCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcggt > 1:494913‑M1/79‑106 (MQ=255) ggtcaggacggaagccacccacggcagcaaaggcgtctgcccgcatcagcgcatcgccgccacaggccttggcctcacCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcggt < 2:494913‑M1/28‑1 (MQ=255) aggacggaagccacccacggcagcaaaggcgtctgcccgcatcagcgcatcgccgccacaggccttggcctcacCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGa > 2:318445‑M1/75‑104 (MQ=255) aggacggaagccacccacggcagcaaaggcgtctgcccgcatcagcgcatcgccgccacaggccttggcctcacCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGa < 1:318445‑M1/30‑1 (MQ=255) tGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCgtgg < 2:1260199/150‑1 (MQ=255) tGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCgtgg < 2:1140029/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACTTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCgtggg < 1:345294/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGTGTGTGGGCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGGTGTGCGTCCTGGAGTGGGATACCCGGGTAGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTTATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCgtgggt < 1:508023/150‑1 (MQ=255) gtgtgtGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTc > 2:200732/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTcctga > 1:387599/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTcctga > 1:620424/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTcctgacc < 1:340840/150‑1 (MQ=255) gCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTcctgacc < 1:340169/150‑1 (MQ=255) gCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGCGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGAt < 2:236094/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGc < 2:620424/150‑1 (MQ=255) cgcTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGCCCTGTCCTGATCgtctta < 2:1215145/150‑6 (MQ=255) cGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGc > 2:887720/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCg < 1:200732/150‑1 (MQ=255) cAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCg > 2:1261830/1‑150 (MQ=255) aGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCgtgggt < 2:484142/113‑1 (MQ=255) aGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCgtgggt > 1:484142/1‑113 (MQ=255) ttCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCGGAACt > 2:841803/1‑150 (MQ=255) ttCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCGGAACt > 1:90394/1‑150 (MQ=255) tACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCGGAACTgtgcgtg < 2:90394/150‑1 (MQ=255) aCAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCGGAACTgtgcgtgc > 2:199432/1‑150 (MQ=255) cTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCGGAACTGTGCGTGCGTTTGccg < 1:887720/150‑3 (MQ=255) cTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCGGAACTGTGCGTGCGTTTGCgg < 1:841803/150‑1 (MQ=255) tgCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCGGAACTGTGCGTGCGTTTGCGGGcc > 1:86307/1‑150 (MQ=255) | CTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCCGTGGGTGGCTTCCGTCCTGACCTGATCGCCGGAGAAGAGCCGGAACTGTGCGTGCGTTTGCGGGCC > NC_002947/3552639‑3552935 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |