| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 4570378 | 79 (1.610) | 4 (0.090) | 4/236 | NT | 5.1% | coding (198/2775 nt) | treY | maltooligosyl trehalose synthase |
| ? | NC_002947 | = 4570402 | 75 (1.620) | coding (222/2775 nt) | treY | maltooligosyl trehalose synthase | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CCTCGACCACGCTGTACCGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCCTGCTGGCCTGGGGACGGCGCAGTCCGTATGC > NC_002947/4570231‑4570527 | ccTCGAGCACGCTGTACCGCTGGTGCCGTATTTAGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCACGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGa > 2:4948/1‑150 (MQ=255)ccTCGACCACGCTGTACCGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGa > 1:251653/1‑150 (MQ=255)ccTCGACCACGCTGTACCGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGa < 2:1153811/150‑1 (MQ=255)ccTCGACCACGCTGTACCGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGa > 1:1153811/1‑150 (MQ=255) tCGACCACGCTGTACCGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAgg > 2:1241443/1‑150 (MQ=255) cACGCTGTACCGCTGGTTCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCcgcg > 1:570067/1‑150 (MQ=255) cACGCTGTACCGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCcgcg > 2:113528/1‑150 (MQ=255) cTGTACCGCTGGTGCCGTATTGCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTgg > 2:342100/1‑150 (MQ=255) tGTACCGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGTCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCCCTGGa > 1:410719/1‑150 (MQ=255) tGTACCGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGa < 2:251653/150‑1 (MQ=255) gTACCGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAg < 1:210669/150‑1 (MQ=255) cGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGcc > 2:963798/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCt > 2:437995/1‑150 (MQ=255) 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tCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTgccgcccagctccgggttgacgcaggtaggatcgaccacgtcgtagccatggcgcgagcccgcgcgggccttgaggatgggc > 1:409241‑M2/1‑44 (MQ=255) tCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTgccgcccagctccgggttgacgcaggtaggatcgaccacgtcgtagccatggcgcgagcccgcgcgggccttgaggatgggc < 2:409241‑M2/126‑83 (MQ=255) aaCCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATcc < 1:1100080/76‑1 (MQ=255) aaCCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATcc > 2:1100080/1‑76 (MQ=255) aaCCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCCTGCTGGCCTGGGGa > 2:245502/1‑150 (MQ=255) aaCCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCCTGCTGGCCTGGGGa > 2:1084945/1‑150 (MQ=255) cccGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCctgct < 2:687383/138‑1 (MQ=255) cccGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCctgct > 1:687383/1‑138 (MQ=255) cccGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCCTGCTGGCCTGGGGACg < 2:753206/150‑1 (MQ=255) ccGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCtggt > 1:1142749/1‑124 (MQ=255) ccGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCtggt < 2:1142749/124‑1 (MQ=255) cGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCCTGCTGGCCTGGGGACGgc < 2:278920/150‑1 (MQ=255) ggggCGGCGAGGCCGCGCTGGAGAGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCCTGCTGGCCTGGGGACGGCGCAGTc < 1:1047430/149‑1 (MQ=255) gggCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCCTGCTGGCCTGGGGACGGCGCAGTcc < 1:1084798/150‑1 (MQ=255) gcggcaaccaggcgctccagcgcggcctcgccgcccagctccgggttgacgcaggtaggatcgaccacgtcgtagccatggcgcgagcccgcgcgggccttgaggatgggcgaggcatacaggtggctgatgcccagctgggcgaaatac > 1:6367‑M1/1‑5 (MQ=255) gcggcaaccaggcgctccagcgcggcctcgccgcccagctccgggttgacgcaggtaggatcgaccacgtcgtagcactggcgcgagcccgcgcgggccttgaggatgggcgaggcatacaggtggctgatgcccagctgggcgaaatac < 1:930240‑M1/150‑146 (MQ=255) cggcgAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCCTGCTGGCCTGGGGACGGCGCAGTCCGTa > 1:1134540/1‑150 (MQ=255) cggcacccaggcgctccagcgcggcctcgccgcccagctccgggttgacacaggtaggatcgaccacgtcgtagccatggcgcgagcccgcgcgggccttgaggatggacgaggcatacaggtggctgatgcccagctgggcgaaatacg < 1:97262‑M1/150‑147 (MQ=255) caaccaggcgctccagcgcggcctcgccgcccagctccgggttgacgcaggtaggatcgaccacgtcgtagccatggcgcgagcccgcgcggtccttgaggatgggcgaggcatacaggtggctgatgcccagctgggcgaaatacggca < 2:324479‑M1/150‑150 (MQ=255) caaccaggcgctccagcgcggcctcgccgcccagctccgggttgacgcaggtaggatcgaccacgtcgtagccatggcgcgagcccgcgcgggccttgaggatgggcgaggcatacaggtggctgatgcccagctgggcgaaatacgg < 2:1101105‑M1/148‑148 (MQ=255) caaccaggcgctccagcgcggcctcgccgcccagctccgggttgacgcaggtaggatcgaccacgtcgtagccatggcgcgagcccgcgcgggccttgaggatgggcgaggcatacaggtggctgatgcccagctgggcgaaatacgg > 1:1101105‑M1/1‑1 (MQ=255) | CCTCGACCACGCTGTACCGCTGGTGCCGTATTTCGCCCAGCTGGGCATCAGCCACCTGTATGCCTCGCCCATCCTCAAGGCCCGCGCGGGCTCGCGCCATGGCTACGACGTGGTCGATCCTACCTGCGTCAACCCGGAGCTGGGCGGCGAGGCCGCGCTGGAGCGCCTGGTTGCCGCCCTGCGCCAGCATGGCATGGGGCTGATCCTCGACACGGTGTCCAACCACATGGCCGTAGGCGGTGCCGACAACCCCTGGTGGCAAAGCCTGCTGGCCTGGGGACGGCGCAGTCCGTATGC > NC_002947/4570231‑4570527 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |