| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6009165 = | 24 (0.490) | 16 (0.440) | 11/184 | NT | 63.2% | intergenic (+6/+76) | norM/PP_5263 | multidrug resistance protein NorM/GGDEF domain‑containing protein |
| ? | NC_002947 | 6009242 = | 1 (0.030) | coding (1667/1668 nt) | PP_5263 | GGDEF domain‑containing protein | |||||
GGCGGTGGTGCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCC > NC_002947/6009016‑6009228 | ggtgtggagagtgaagagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttag > 1:437927‑M1/150‑150 (MQ=255) gtgtggagagtgaagagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttagg > 1:254884‑M1/149‑150 (MQ=255) cGGTGGTGCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCggg > 1:1046389/1‑150 (MQ=255) ggtggtGCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGc < 1:681978/150‑1 (MQ=255) gaagagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTcgcg > 1:1212152‑M1/138‑150 (MQ=255) tCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCgg < 2:1046389/150‑1 (MQ=255) tCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCgg < 1:175949/150‑1 (MQ=255) aagagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcaggccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCgg < 1:359682‑M1/14‑1 (MQ=255) aagagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCgg > 2:958451‑M1/137‑150 (MQ=255) agagcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgacatcgtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCggg > 1:655144‑M1/136‑150 (MQ=255) gcagctgacgttgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCAc > 1:512590‑M1/133‑150 (MQ=255) tgttgcgcgggtttggctgcgaccaggtgcaaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca > 2:835318‑M1/122‑150 (MQ=255) ggCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca > 2:1111977/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑g < 1:14517/150‑1 (MQ=255) 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2:864951‑M1/98‑150 (MQ=255) ggTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAGACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACCGCGCAAT‑CCTGTGGGAGCgg < 1:964763/150‑1 (MQ=25) gTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTTTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCggg < 1:526944/150‑1 (MQ=255) aaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCgg < 2:1135093‑M1/57‑1 (MQ=255) aaggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCgg > 1:1135093‑M1/92‑148 (MQ=255) aggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGc < 2:707808‑M1/55‑1 (MQ=255) aggcttcctggtcagcagaccgctaccgatagggcaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGc > 1:707808‑M1/91‑145 (MQ=255) ggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttgtagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGATCATTCA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAgcgtgcgt > 1:1265798‑M1/90‑150 (MQ=255) ggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGc > 1:507200‑M1/90‑93 (MQ=255) ggcttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGc < 2:507200‑M1/4‑1 (MQ=255) gcgcTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACCGCGCAAT‑CCTGTGGGAGCGGGCGt < 1:653467/150‑1 (MQ=25) gcgcTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACCGCGCAAT‑CCTGTGGGAGCGGGCGt < 1:879544/150‑1 (MQ=25) gcTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACCGCGCAAT‑CCTGTGGGAGCGGGc > 1:261629/1‑146 (MQ=25) ttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑g < 1:106209‑M1/32‑1 (MQ=255) ttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑g > 2:106209‑M1/87‑118 (MQ=255) ttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTgg > 2:650776‑M1/87‑137 (MQ=255) ttcctggtcagcagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTgg < 1:650776‑M1/51‑1 (MQ=255) cTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACCGCGCAAT‑CCTGTGGGAGCGGGCGTGcc < 1:1111977/150‑1 (MQ=25) cTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCtgt > 2:1281382/1‑130 (MQ=255) cTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCtgt < 1:1281382/130‑1 (MQ=255) cagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGa > 1:589491‑M1/76‑128 (MQ=255) cagaccgctaccgataggggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGa < 2:589491‑M1/53‑1 (MQ=255) cTTTGAGTGGCAGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGc > 1:45545/1‑134 (MQ=255) cTTTGAGTGGCAGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGc < 2:45545/134‑1 (MQ=255) aaaCGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGa < 2:130551/93‑1 (MQ=255) aaaCGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGa > 1:130551/1‑93 (MQ=255) gggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCgg > 2:680767‑M1/59‑115 (MQ=255) gggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCgg < 1:680767‑M1/57‑1 (MQ=255) gggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcatttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGa > 2:504477‑M1/59‑111 (MQ=255) gggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcatttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGa < 1:504477‑M1/53‑1 (MQ=255) ggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTgg < 2:22636‑M1/51‑1 (MQ=255) ggaattgatggcgtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTgg > 1:22636‑M1/58‑108 (MQ=255) gttgttGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCgg < 1:1101424/96‑1 (MQ=255) gttgttGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCgg > 2:1101424/1‑96 (MQ=255) ttgGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTccc < 1:389180/96‑1 (MQ=255) ttgGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTccc > 2:389180/1‑96 (MQ=255) gtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTc > 2:680178‑M1/46‑55 (MQ=255) gtatttgctgcaggcgcctggccgccagttggagggtgtcctttaGGGCCTCTTc < 1:680178‑M1/10‑1 (MQ=255) | GGCGGTGGTGCAGTCGGGATCTGGTGGGGGCTGGCGCTGGGGCTGGCATGTGCGGCGGTGGCGCTGACCTTTGGCTTTGAGTGGCGGATGAAACGGTTGTTGGGTAAGGCGGGGGTTCGTACAGAAGCTGCTGTTTCGGCCTGACTTCCGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACA‑GGATTGCGCGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCC > NC_002947/6009016‑6009228 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |