New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3268649 = | 35 (0.710) | 4 (0.080) | 3/244 | NT | 10.4% | coding (807/1203 nt) | PP_2867 | pyridine nucleotide‑disulphide oxidoreductase family protein |
? | NC_002947 | 3268672 = | 35 (0.730) | coding (784/1203 nt) | PP_2867 | pyridine nucleotide‑disulphide oxidoreductase family protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
CATGTTGGCACGACATCACGGCATGATTGCCAAGCTCGTCACAGGTGGCGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGAAACTACTGTGGCACCGCAAACCCACTCCACGCCCAGTGC > NC_002947/3268531‑3268819 | cATGTTGGCACGACATCACGGCATGATTGCCAAGCTCGTCACAGGTGGCGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCt < 2:189788/150‑1 (MQ=255) tGGCACGACATCACGGCATGATTGCCAAGCTCGTCACAGGTGGCGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCg < 1:507093/150‑1 (MQ=255) ccAAGCTCGTCACAGGTGGCGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTg > 1:1115961/1‑138 (MQ=255) ccAAGCTCGTCACAGGTGGCGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTg < 2:1115961/138‑1 (MQ=255) ccAAGCTCGTCACAGGTGGCGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGaa > 2:357457/1‑146 (MQ=255) ccAAGCTCGTCACAGGTGGCGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGaa < 1:357457/146‑1 (MQ=255) aGGTGGCGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATTCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGacca > 1:90236/1‑150 (MQ=255) cGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTgg < 2:1026821/120‑1 (MQ=255) cGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTgg > 1:1026821/1‑120 (MQ=255) gTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCt < 2:404480/150‑1 (MQ=255) ggCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGc < 2:1049289/150‑1 (MQ=255) gCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGtt < 1:345942/113‑1 (MQ=255) gCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGtt > 2:345942/1‑113 (MQ=255) gCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGcc < 1:471444/117‑1 (MQ=255) gCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGcc > 2:471444/1‑117 (MQ=255) ccACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGt < 1:18457/150‑1 (MQ=255) aCGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCg > 1:671424/1‑150 (MQ=255) gCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTc < 1:774790/89‑1 (MQ=255) gCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTc > 2:774790/1‑89 (MQ=255) tGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCAGCGGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGcc < 1:1119394/150‑1 (MQ=255) cacGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTc < 2:478906/150‑1 (MQ=255) ttGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGtt < 2:191853/64‑1 (MQ=255) ttGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGtt > 1:191853/1‑64 (MQ=255) tGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAg < 2:1112002/150‑1 (MQ=255) gTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGa > 2:1133677/1‑150 (MQ=255) tGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGaaa < 2:759737/150‑1 (MQ=255) tGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGaaa < 2:671424/150‑1 (MQ=255) ccATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGAAact > 1:419439/1‑150 (MQ=255) cATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTAc > 2:385737/1‑142 (MQ=255) cATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTAc < 1:385737/142‑1 (MQ=255) aTCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGAAactac > 1:594266/1‑150 (MQ=255) cAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGAAACTACTGTGGCAcc > 2:916978/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTTAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGAAACTACTGTGGCACCg > 2:1160527/1‑150 (MQ=255) gcgGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGAAACTACTGTGGCACCGCAAACCCa > 2:544882/1‑150 (MQ=255) cgGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTTCACACCGGCAGGGTCTACCGAAACTACTGTGGCACCGCAAACCCAc < 1:1196869/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCT‑GCACCTATCAATGTCGTATGCCGTCTTGTGCTACCGAAACTACTGTGGCACCGCATAGCCACTCCACGCCCAGt > 1:792468/1‑150 (MQ=255) gccgcTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGCAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGAAACTACTGTGGCACCGCAAACCCACTCCACGCCCAGTGc > 1:865462/1‑150 (MQ=255) | CATGTTGGCACGACATCACGGCATGATTGCCAAGCTCGTCACAGGTGGCGTAGGCCACGTCTCCAGCTGCATACACGGCATCATTGCCCTTGACCTTCAGGTTGCCATCGACATGCAAGCGGCCGCGGTTGTCGCGCTCGCCGCTGATCTGTTCGGTGAGCGGGTTGGCCTTGAAGCCAACCGTCCAGACCACCGTGCTGGCGTCGATCCGCTGGCCGTTGTCCA‑GCTGCACACCGGCAGGGTCTACCGAAACTACTGTGGCACCGCAAACCCACTCCACGCCCAGTGC > NC_002947/3268531‑3268819 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |