New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3676073 | 41 (0.840) | 5 (0.110) | 5/222 | NT | 12.1% | intergenic (+37/+55) | PP_3240/PP_5592 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3676096 | 36 (0.830) | intergenic (+60/+32) | PP_3240/PP_5592 | hypothetical protein/hypothetical protein |
TCGACCCCGACTCCCCGGATGCCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCGG > NC_002947/3675948‑3676243 | tCGACCCCGACTCCCCGGATGCCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAg > 2:134200‑M2/1‑149 (MQ=255) gtcGAAGACCCTCAATTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGATACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTcacca < 2:148660/148‑1 (MQ=255) ccTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACt > 1:974559/1‑150 (MQ=255) tCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGcc < 2:226918/150‑1 (MQ=255) gACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCtt < 2:645547/150‑1 (MQ=255) gACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCtt > 2:951578/1‑150 (MQ=255) ccACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGGCATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAg > 1:358861/1‑150 (MQ=255) cggccAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTggc < 2:493930/150‑1 (MQ=255) cggccAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTggc < 2:394739/150‑1 (MQ=255) gagaCATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAgacga < 2:994202/111‑1 (MQ=255) gagaCATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAgacga > 1:994202/1‑111 (MQ=255) aCATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCccgccgc > 2:635429/1‑150 (MQ=255) gagaAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACa < 1:416783/150‑1 (MQ=255) aaGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGa < 1:132631/150‑1 (MQ=255) gAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCg < 1:274483/150‑1 (MQ=255) gTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCggg > 2:1226503/1‑150 (MQ=255) aaCCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAg > 1:355912/1‑150 (MQ=255) aCCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGTGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGt < 1:1226503/150‑1 (MQ=255) ccACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCa < 1:927713/93‑1 (MQ=255) ccACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCa > 2:927713/1‑93 (MQ=255) cACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGTTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGc > 2:587844/1‑150 (MQ=255) cACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGc > 2:507388/1‑150 (MQ=255) aCGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGTTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCa < 1:587844/150‑1 (MQ=255) gCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGc < 2:665392/150‑1 (MQ=255) gATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATc > 1:8543/1‑150 (MQ=255) gATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATc > 1:723690/1‑150 (MQ=255) ttACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCGCGTGGGAACCAgcttgccggcgacgagaccggtaatcaaggccgtggtttactcctttttctcaatgtctctaggcggcttggccggcccctgtgggtcgacttgagggtcttc < 1:303689‑M2/150‑104 (MQ=255) cGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGt > 1:160496/1‑148 (MQ=255) cGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGt < 2:160496/148‑1 (MQ=255) ggTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGAt > 2:805820/1‑150 (MQ=255) gTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTAc > 1:290115/1‑102 (MQ=255) gTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTAc < 2:290115/102‑1 (MQ=255) tcgtcgCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagaccggtaatcaaggccgtggtttactcctttttctcaatgtctctaggcggcttggccggcccctgtgggtcgact < 2:1027811‑M2/130‑93 (MQ=255) tcgtcgCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagaccggtaatcaaggccgtggtttactcctttttctcaatgtctctaggcggcttggccggcccctgtgggtcgact > 1:1027811‑M2/1‑38 (MQ=255) cgtcgCCGGCAAGCCATGTGAGATCCCTTAGGACCAAGCTTTCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTg < 2:102783/150‑1 (MQ=255) gCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGTCGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTa < 1:1048502/150‑1 (MQ=255) ggCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagaccggtaatcaaggccgtggtttactcctttttctcaatgtctctaggcggcttggccggcccctgtgggtcgacttgagggtcttc > 2:537397‑M2/1‑30 (MQ=255) ggCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagaccggtaatcaaggccgtggtttactcctttttctcaatgtctctaggcggcttggccggcccctgtgggtcgacttgagggtcttc < 1:537397‑M2/133‑104 (MQ=255) aGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCAc < 1:951578/150‑1 (MQ=255) tgCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTgg < 2:309058/123‑1 (MQ=255) tgCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTgg > 1:309058/1‑123 (MQ=255) gATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCa > 2:469581/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCgg > 1:40884/1‑150 (MQ=255) | TCGACCCCGACTCCCCGGATGCCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTGGCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCGG > NC_002947/3675948‑3676243 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |