| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4765474 = | 60 (1.220) | 4 (0.090) | 4/236 | NT | 6.9% | coding (82/2439 nt) | fpvA | TonB‑dependent outer membrane ferripyoverdine receptor FpvA |
| ? | NC_002947 | 4765507 = | 51 (1.100) | coding (115/2439 nt) | fpvA | TonB‑dependent outer membrane ferripyoverdine receptor FpvA | |||||
TATTAACATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCGGCTCGCAATCGAACCTGCAGGTGCTCTATAGCCCACAGGACGTGGAAGGCAAGCGCAGCAGCGCACTGACCGGTGCAATGGAGCCCGCCGC > NC_002947/4765360‑4765655 | tATTAACATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCaa > 1:183324/1‑150 (MQ=255) ttAACATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACa < 2:1129721/150‑1 (MQ=255) ttAACATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACa < 1:1071183/150‑1 (MQ=255) ttAACATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACa > 1:491155/1‑150 (MQ=255) ttAACATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACa > 1:233107/1‑150 (MQ=255) tAACATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAg < 2:491155/150‑1 (MQ=255) aCATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAgg < 1:1006079/149‑1 (MQ=255) aCATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAgg > 2:1006079/1‑149 (MQ=255) aCATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGt > 2:525186/1‑150 (MQ=255) aCATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGt < 1:411734/150‑1 (MQ=255) cATCTGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTc < 2:250173/150‑1 (MQ=255) tGACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCGGGCCCACCAGGCCCAGt > 1:64124/1‑150 (MQ=255) gACACTCAAGGGCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGtt > 1:1087799/1‑150 (MQ=255) gggCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAAc > 1:982719/1‑131 (MQ=255) gggCTTTGAAAAAATGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAAc < 2:982719/131‑1 (MQ=255) aTGCCAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTg > 1:181864/1‑150 (MQ=255) cAACACAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCa > 2:1176512/1‑150 (MQ=255) acacAACGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAgc > 2:291750/1‑150 (MQ=255) aaCGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGAGCCt > 1:1280386/1‑150 (MQ=255) aaCGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTCGCATACATGCCAGGTAGCGCCCAGTCCCAACCGGTCCAGTCGAAGCCGCCGGCCCCGCCGCTGGCCAGCGCCt > 1:988210/1‑150 (MQ=255) cGTCTTCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCttg > 1:1177050/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCCCACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTgg > 1:780233/1‑150 (MQ=255) ccccACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGcc < 1:1159504/147‑1 (MQ=255) ccccACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGcc > 2:1159504/1‑147 (MQ=255) ccccACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTc < 2:183324/150‑1 (MQ=255) ccccACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTc > 2:575400/1‑150 (MQ=255) cccACGCTCTGGCGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCg < 2:1052023/150‑1 (MQ=255) attggcgctgcaaggcgcaacgagcggcgaatgaccagcgccaATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCGGCt < 1:1213867‑M2/103‑1 (MQ=255) attggcgctgcaaggcgcaacgagcggcgaatgaccagcgccaATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCGGCt > 2:1213867‑M2/44‑146 (MQ=255) aacaaggcgctggccagcggctgggccggcacgttgaactggacctgttgGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAg > 1:288490‑M1/51‑95 (MQ=255) aacaaggcgctggccagcggctgggccggcacgttgaactggacctgttgGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAg < 2:288490‑M1/45‑1 (MQ=255) gcgctgcaaggcgcaacgagcggcgaatgaccagcgccaATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCaa < 1:624681‑M2/59‑1 (MQ=255) gcgctgcaaggcgcaacgagcggcgaatgaccagcgccaATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCaa > 2:624681‑M2/40‑98 (MQ=255) CGCTGGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCGGCTCGCAATCGa > 2:1196415‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGGTCATACGCGGCGCGTTGCGCATTGCAGCGCCAGTGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCTGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCGGCTCGCAATCGAAc > 2:499711‑M1/1‑150 (MQ=255) GGTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCGGCTCGCAATCGAACCt > 1:600697‑M1/1‑150 (MQ=255) gTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGcc < 2:1015846/120‑1 (MQ=255) gTCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGcc > 1:1015846/1‑120 (MQ=255) tCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCGGCTCGCAATCGAAc > 1:820043/1‑146 (MQ=255) tCATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCGGCTCGCAATCGAAc < 2:820043/146‑1 (MQ=255) cATTCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCGGCTCGCAATCGAACCTGCa < 2:1177050/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGCTCGTTGCGCCTTGCAGCGCCAATGGCCGTCGGCCTGGCGGGCCTGCCGGCGATCGCCCAGGCCCAACAGGTCCAGTTCAACGTGCCGGCCCAGCCGCTGGCCAGCGCCTTGTTGGCCTTCGGCTCGCAATCGAACCTGCAgg > 2:796020/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |