Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 680,674 | C→T | 8.8% | P64L (CCG→CTG) | PP_0583 → | AraC family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 680,674 | 0 | C | T | 8.8% | 186.8 / 6.9 | 68 | P64L (CCG→CTG) | PP_0583 | AraC family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/31); new base T (2/4); total (33/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 |
ACCTGCCCAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCG > NC_002947/680527‑680823 | acCTGCCCAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGc > 2:26844/1‑150 (MQ=255) ccTGCCCAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCa < 2:1045495/150‑1 (MQ=255) cTGCCCAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAg > 2:1257340/1‑150 (MQ=255) tGCCCAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGt > 1:456369/1‑150 (MQ=255) ccAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTggg < 2:456369/150‑1 (MQ=255) ccAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTggg < 1:992635/150‑1 (MQ=255) aGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTggggg > 1:1201221/1‑150 (MQ=255) aGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTggggg > 2:68759/1‑150 (MQ=255) gACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACTGCGGTggggca < 2:975782/150‑3 (MQ=255) ccccTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCACCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACTGCGGTggggcaaa < 1:574661/150‑5 (MQ=255) cccTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGgtgt > 2:890830/1‑150 (MQ=255) cccTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGgtgt < 1:457825/150‑1 (MQ=255) cccTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGgtgt < 2:115337/150‑1 (MQ=255) cccGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCccg > 1:506573/1‑150 (MQ=255) cGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGc > 2:1234690/1‑150 (MQ=255) gAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACTGCGGTggggcaa > 2:306127/1‑128 (MQ=255) gAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACTGCGGTggggcaa < 1:306127/131‑4 (MQ=255) aaGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGa < 2:1201221/150‑1 (MQ=255) cTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCCCCGCCGTGGGGGGTGTGGTCCCCGGCGGATGCCGAGGAt > 2:586577/1‑150 (MQ=255) cgcCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGt < 1:68759/150‑1 (MQ=255) cGGATCGTGGACCCCTCGGCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCCCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGGGTACACACGCGACGGCAGTTACGTGGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGt < 2:635718/150‑1 (MQ=255) gATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGa > 2:1020746/1‑130 (MQ=255) gATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGa < 1:1020746/130‑1 (MQ=255) gTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTc < 1:955348/150‑1 (MQ=255) ggACCCCTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGa < 1:1252898/150‑1 (MQ=255) gACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGAt < 2:1159220/150‑1 (MQ=255) cTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAg < 2:317851/150‑1 (MQ=255) ccaccaGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCga < 1:890830/150‑1 (MQ=255) accaGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCgaga > 1:128938/1‑150 (MQ=255) aCGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCa < 1:783954/150‑1 (MQ=255) aCGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCa < 1:1257340/150‑1 (MQ=255) gACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGAGTGAAACCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGc > 1:655836/1‑150 (MQ=255) caCTGGGTACAATCCTCCCACGCCATCACCGCCGTACTCGGCTTGTACACCCGCCACGCCAGTTACTCTGCCCCACCGCAGCGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGc < 2:1092243/149‑1 (MQ=255) ggTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTa > 1:1236407/1‑150 (MQ=255) gTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTAc < 1:1234690/150‑1 (MQ=255) aaTTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTgc > 1:50437/1‑150 (MQ=255) aTTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTgcg > 1:365935/1‑150 (MQ=255) tACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGc > 1:700885/1‑94 (MQ=255) tACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGc < 2:700885/94‑1 (MQ=255) tACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTgcgcgccgag > 2:232093/1‑144 (MQ=255) tACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGAt > 1:913565/1‑150 (MQ=255) tACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGGTGATCCCCGCCGCTGCCGAGCATGAAGTTGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGAt > 1:607323/1‑150 (MQ=255) gcgTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATggg > 2:701240/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCgg > 1:547397/1‑150 (MQ=255) gtgtACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACaa < 2:60195/150‑1 (MQ=255) gtACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATg < 2:506573/150‑1 (MQ=255) acacacGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGcc < 2:547397/150‑1 (MQ=255) acacGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCgg > 1:945361/1‑150 (MQ=255) acacGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCgg > 1:435709/1‑150 (MQ=255) acacGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGCAACAATGCCgg < 2:50437/150‑1 (MQ=255) acGCGACGTCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGt < 2:1218882/150‑1 (MQ=255) cgACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCt < 1:652341/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGc < 1:216206/95‑1 (MQ=255) aCGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGc > 2:216206/1‑95 (MQ=255) ggCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCTGAACAATGCCGGGTGCTGGaa < 1:26844/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGaa > 1:388740/1‑150 (MQ=255) cAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGt < 1:586577/150‑1 (MQ=255) cAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGATGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGt > 2:722315/1‑150 (MQ=255) aGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTg > 2:832295/1‑150 (MQ=255) tttGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGAcgccg > 1:319526/1‑150 (MQ=255) tttGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGAcgccg > 1:456075/1‑150 (MQ=255) cccccACTGCGGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGa < 1:943182/60‑1 (MQ=255) cccccACTGCGGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGa > 2:943182/2‑61 (MQ=255) ccACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGgcg > 1:490435/1‑150 (MQ=255) cACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCg > 2:56875/1‑124 (MQ=255) cACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCg < 1:56875/124‑1 (MQ=255) cACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGgcgc < 1:832295/150‑1 (MQ=255) cACCGCAGTGGGGGATGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGgcgc < 1:722315/150‑1 (MQ=255) cGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGcgcgcg > 1:332815/1‑150 (MQ=255) | ACCTGCCCAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGGCGCGCG > NC_002947/680527‑680823 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |