| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,202,863 | G→T | 7.8% | R229L (CGG→CTG) | xcpY → | type II secretion pathway protein XcpY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,202,863 | 0 | G | T | 7.8% | 203.7 / 4.6 | 64 | R229L (CGG→CTG) | xcpY | type II secretion pathway protein XcpY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/33); new base T (3/2); total (29/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
GTGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCTCAA > NC_002947/1202715‑1203010 | gTGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCgg < 1:252147/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCg < 1:48466/146‑1 (MQ=255) ccGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCg > 2:48466/1‑146 (MQ=255) ccGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGgctg < 1:1172068/150‑1 (MQ=255) cAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGctgct‑g > 1:1166070/1‑150 (MQ=255) aGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑gg > 2:1132599/1‑150 (MQ=255) aCCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGTAGCCGCTGCTGCT‑GGcggg < 2:1161130/150‑4 (MQ=255) ccGTGGGCAGTGCTGCACAGGGCGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCACGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCAGCCGCCTCCCGCCAGCAGCCGCGGCTGCT‑GGCAGCt > 2:233302/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCCCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGc < 2:355628/150‑1 (MQ=255) ctgcACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTg < 1:279619/150‑1 (MQ=255) gcACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGc > 1:1143211/1‑150 (MQ=255) acaGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGc < 2:324928/137‑1 (MQ=255) acaGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCGGCG‑GGCAGCTTGc > 1:324928/1‑137 (MQ=255) gCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTgggg > 1:1159330/1‑150 (MQ=255) gCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTgggg < 1:328107/150‑1 (MQ=255) gAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTgg < 1:913781/150‑1 (MQ=255) aGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGc < 2:844242/150‑1 (MQ=255) cAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCtgtg < 2:104284/150‑1 (MQ=255) tttgCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt < 1:689802/147‑1 (MQ=255) ttGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt < 2:586275/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt < 2:1130441/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt < 2:818151/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt < 1:244230/150‑1 (MQ=255) gcccAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGa < 1:1069676/148‑1 (MQ=255) gCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGTCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCGGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGACTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAg > 1:408250/1‑150 (MQ=255) cAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTc > 2:1187643/1‑150 (MQ=255) aaCCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCa > 2:982360/1‑150 (MQ=255) aCCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAg < 2:647159/150‑1 (MQ=255) ccGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGc > 2:246906/1‑150 (MQ=255) gTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt > 2:577870/1‑140 (MQ=255) gTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt < 1:577870/140‑1 (MQ=255) ttGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGc < 1:1187643/150‑1 (MQ=255) cgcTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAgg > 2:164803/1‑150 (MQ=255) gACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCaa < 2:111392/150‑1 (MQ=255) acacTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCTCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGc < 1:664673/114‑1 (MQ=255) acacTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGc > 2:664673/1‑114 (MQ=255) acacTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAActc > 2:20645/1‑150 (MQ=255) acTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCCAGCCAGGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTg > 1:32979/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCACCGGCTGTT‑GGCAGCTTGCATGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGGCAGCAATGGCGTCCGGCGCCACTCTGGCGCAg > 2:403789/1‑150 (MQ=255) atgatCGGCCGCGCCAGCAACTTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTCTGCA‑CTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAg < 1:403789/146‑1 (MQ=255) tGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAgg < 2:1175727/150‑1 (MQ=255) tGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAgg > 2:375499/1‑150 (MQ=255) ttCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTc > 1:715369/1‑150 (MQ=255) gACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCAtt > 1:18696/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGgcg < 2:414741/125‑1 (MQ=255) aCCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCGGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGgcg > 1:414741/1‑125 (MQ=255) cgcCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGt < 2:136941/150‑1 (MQ=255) cgcCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGt < 1:479831/150‑1 (MQ=255) cccGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGa < 2:478007/150‑1 (MQ=255) ccGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGAc > 1:268888/1‑150 (MQ=255) ccGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGAc < 2:715369/150‑1 (MQ=255) cgcTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAg < 1:128064/150‑1 (MQ=255) cTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGc < 1:1183908/150‑1 (MQ=255) tCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCAtt < 2:367746/129‑1 (MQ=255) tCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCAtt > 1:367746/1‑129 (MQ=255) ccgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGc < 2:1159330/150‑1 (MQ=255) 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ccAGCAGCCGCTGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGcaca > 1:169388/1‑150 (MQ=255) gcagccgcTGCTGCT‑GGAGGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGc < 2:838551/150‑1 (MQ=255) gcagcGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGcaca < 1:1221016/144‑1 (MQ=255) gcagcGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGcaca > 2:1221016/1‑144 (MQ=255) cagcGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCTc > 2:609187/1‑150 (MQ=255) gcGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCTCaa < 2:1247431/150‑1 (MQ=255) | GTGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCT‑GGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCTCAA > NC_002947/1202715‑1203010 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |